New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 854380 = | 329 (0.920) | 21 (0.060) | 13/148 | NT | 6.6% | intergenic (‑275/‑460) | USA300HOU_RS04170/zipA_1 | Epimerase family protein/Cell division protein ZipA |
? | USA300TCH1516_ALE | 854405 = | 295 (0.890) | intergenic (‑300/‑435) | USA300HOU_RS04170/zipA_1 | Epimerase family protein/Cell division protein ZipA |
Only 100 of 407 total aligned reads displayed.
TAAAAGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTA > USA300TCH1516_ALE/854315‑854495 | tAAAAGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCg > 2:5096568/1‑91 (MQ=255) aaaGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGtt > 1:4111831/1‑91 (MQ=255) aGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGtttt < 1:4244946/91‑1 (MQ=255) aGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGtttt < 1:6578933/91‑1 (MQ=255) aGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGAAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGtttt < 2:4137819/91‑1 (MQ=255) gTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGttttt > 2:3441029/1‑91 (MQ=255) gTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGttttt < 2:3059763/91‑1 (MQ=255) ttgtttaaaaaattaatgctttaaattgatgtataatgggaataagaaataaataaaaacgacccgtacgttaatcgtgcgggtcGttttt < 1:2049258‑M2/6‑1 (MQ=255) aTGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttat > 1:3092420/1‑91 (MQ=255) tgtgTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttatt > 1:3264380/1‑91 (MQ=255) gtgtAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttattt > 2:811727/1‑91 (MQ=255) gtgtAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttattt > 1:3002981/1‑91 (MQ=255) tgtAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttattta > 2:2977375/1‑91 (MQ=255) tAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTtatttatt > 2:2377044/1‑91 (MQ=255) tAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTtatttatt > 2:1788833/1‑91 (MQ=255) tAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTtatttatt < 1:132678/91‑1 (MQ=255) tAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTtatttatt < 2:3623349/91‑1 (MQ=255) aaaaaattaatgctttaaattgatgtataatgggaataagaaataaataaaaacgacccgtacgttaatcgtgcgggtcGTTTttatttat < 1:5618460‑M2/12‑1 (MQ=255) aaaCGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTc > 1:2302978/1‑91 (MQ=255) aaCGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCt < 2:3115997/91‑1 (MQ=255) aaCGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCt < 2:1582336/91‑1 (MQ=255) aCGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCtt < 1:66902/91‑1 (MQ=255) cGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTa < 2:3935209/91‑1 (MQ=255) gCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTAt < 1:1101841/91‑1 (MQ=255) cTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTAtt < 2:6521267/91‑1 (MQ=255) tGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTc > 2:1428168/1‑91 (MQ=255) tGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTc < 2:4582601/91‑1 (MQ=255) tGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTc < 1:4372497/91‑1 (MQ=255) gCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTACTcc > 1:6502025/1‑91 (MQ=255) aTGATACAAACGAAGGTACAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCa > 2:3365490/1‑91 (MQ=255) aTGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCa > 2:4309696/1‑91 (MQ=255) aTGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCa > 1:3700961/1‑91 (MQ=255) aTGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCa > 1:355318/1‑91 (MQ=255) aTACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATta < 1:3816065/91‑1 (MQ=255) aTACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATta < 2:6063294/91‑1 (MQ=255) tACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATtat > 1:2541665/1‑91 (MQ=255) aaaCGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACa < 2:2154809/91‑1 (MQ=255) aaCGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACAt > 2:4179311/1‑91 (MQ=255) aaCGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACAt < 2:6558599/91‑1 (MQ=255) gAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCaa < 1:5310158/91‑1 (MQ=255) aaGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAAt < 2:6820477/91‑1 (MQ=255) ggTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAAttt > 1:2587673/1‑91 (MQ=255) gTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTa < 2:5380439/91‑1 (MQ=255) gTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTa > 1:2833834/1‑91 (MQ=255) tAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTaa < 2:4378115/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTaaa > 2:2635690/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAg < 2:5042386/91‑1 (MQ=255) aaaTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGc < 2:885432/91‑1 (MQ=255) aaaTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGc < 1:6079375/91‑1 (MQ=255) aaTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCa > 2:1527712/1‑91 (MQ=255) aTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCAt < 1:4146337/91‑1 (MQ=255) aTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCAt < 2:5575460/91‑1 (MQ=255) tttGACTCCCTTTAGTAGTGTACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCAtt < 2:6319286/91‑1 (MQ=255) tGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTaa < 1:6120073/91‑1 (MQ=255) aCTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTttatttat < 2:288080/53‑1 (MQ=255) aCTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAAtt > 2:4831933/1‑91 (MQ=255) cTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAAttt < 2:3236050/91‑1 (MQ=255) tCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAAtttt > 1:5508646/1‑91 (MQ=255) cccTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAAttttt > 2:2701274/1‑91 (MQ=255) cccTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAAttttt > 1:2190852/1‑91 (MQ=255) ccTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAAtttttt < 1:5098942/91‑1 (MQ=255) taaataaaaacGACCCGCACGATTAA‑CGTACGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTa < 2:6014583‑M1/80‑1 (MQ=255) cTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTa > 1:4580542/1‑91 (MQ=255) ttAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTaaa < 2:1997695/91‑1 (MQ=255) ttAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTaaa < 1:6986024/91‑1 (MQ=255) tagtagTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTAATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAAc < 2:4694967/91‑1 (MQ=255) agtagtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACa < 2:374094/91‑1 (MQ=255) gtagtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACaa < 1:4626452/91‑1 (MQ=255) gtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTaa > 1:6883261/1‑84 (MQ=255) gtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAAtt > 1:1589281/1‑91 (MQ=255) gtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAAtt < 2:3801934/91‑1 (MQ=255) gtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATATAAAGCATTAATTTTTTAAACAAAtt > 2:6881372/1‑91 (MQ=255) gtGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTACCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAAtt > 2:5933870/1‑91 (MQ=255) tGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAAttt > 2:581715/1‑91 (MQ=255) ggACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTa > 1:169698/1‑91 (MQ=255) CCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGa < 2:2441805‑M1/91‑1 (MQ=255) CCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGaa < 2:4974870‑M1/91‑1 (MQ=255) CGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAAt < 2:6664765‑M1/91‑1 (MQ=255) GTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATa < 1:1760342‑M1/91‑1 (MQ=255) tACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATAc > 2:111168/1‑91 (MQ=255) tACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATAc < 1:868782/91‑1 (MQ=255) tACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATAc < 1:5733544/91‑1 (MQ=255) cacgattaacgtacgggtcGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCAGTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATAc > 1:5454679‑M2/20‑91 (MQ=255) cG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACAt > 1:1043574/1‑91 (MQ=255) g‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATa < 1:4834835/91‑1 (MQ=255) cgattaacgtacgggtcGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACAt > 1:6328578‑M2/18‑91 (MQ=255) gattaacgtacgggtcGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATa > 1:1282685‑M2/17‑91 (MQ=255) tAATCGTGCTGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGt < 2:739502/91‑1 (MQ=255) tAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGt < 2:4475745/91‑1 (MQ=255) tAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGt < 1:1072391/91‑1 (MQ=255) aaTCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTa > 2:4241994/1‑91 (MQ=255) aaTCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTa > 1:2379503/1‑91 (MQ=255) aTCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTaa < 2:643436/91‑1 (MQ=255) aTCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTaa < 1:2441805/91‑1 (MQ=255) tCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAat > 1:5941452/1‑91 (MQ=255) cGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAata > 2:5210626/1‑91 (MQ=255) cGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAata < 1:6420929/91‑1 (MQ=255) gCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATaa > 1:4757804/1‑91 (MQ=255) gCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATaa < 1:3456268/91‑1 (MQ=255) cgggtcGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAAc < 1:5221945‑M2/85‑1 (MQ=255) | TAAAAGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTA > USA300TCH1516_ALE/854315‑854495 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |