New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1058102 = | 262 (0.730) | 18 (0.060) | 12/144 | NT | 6.9% | intergenic (+143/+64) | slyA_2/atl_1 | Transcriptional regulator SlyA/Bifunctional autolysin |
? | USA300TCH1516_ALE | 1058152 = | 250 (0.780) | intergenic (+193/+14) | slyA_2/atl_1 | Transcriptional regulator SlyA/Bifunctional autolysin |
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
AACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTAGCAT > USA300TCH1516_ALE/1058062‑1058242 | aaCAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCt > 2:6253967/1‑91 (MQ=255) aaCAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCt < 1:2957225/91‑1 (MQ=255) aaaTCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTAt > 2:6106546/2‑91 (MQ=255) aaTCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATg > 2:3663113/1‑91 (MQ=255) aaTCACCGCTATTTTTGCTCGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATg < 1:5377192/91‑1 (MQ=255) attaCCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGt < 2:4584903/88‑1 (MQ=255) aTCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGt < 2:3128092/91‑1 (MQ=255) aTCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGt < 2:2324694/91‑1 (MQ=255) cACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTc > 1:1749068/1‑91 (MQ=255) aCCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCa > 2:634135/1‑91 (MQ=255) aCCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCa > 1:928977/1‑91 (MQ=255) gCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGt < 2:1324243/91‑1 (MQ=255) cTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGtt < 1:3287195/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGc < 2:5719385/91‑1 (MQ=255) aTTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGc < 1:4447913/91‑1 (MQ=255) ttttGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCtt < 1:1918786/91‑1 (MQ=255) tttGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCtta > 2:5368890/1‑91 (MQ=255) ttGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttat < 1:6617893/91‑1 (MQ=255) tGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttatt < 1:4144510/91‑1 (MQ=255) gCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattt > 1:3052489/1‑91 (MQ=255) gCTTGTGTATGGATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttattt < 2:4248786/91‑1 (MQ=255) ttGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCttatttat > 1:234211/1‑91 (MQ=255) gtgtATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTatat > 1:2833022/1‑91 (MQ=255) tgtatgtaTAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATAtt < 2:2586169/91‑1 (MQ=255) tgtatgtaTAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATAtt < 1:1826644/91‑1 (MQ=255) tgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTgg < 1:369720/91‑1 (MQ=255) tgtatAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTgg > 2:764655/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGa < 2:4886376/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGt > 2:5025435/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTc > 1:4237489/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTc < 2:1384984/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTc > 1:495944/1‑91 (MQ=255) aaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGa < 1:3846767/91‑1 (MQ=255) aaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGa > 2:2914853/1‑91 (MQ=255) aaaGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACATTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGa < 2:6789087/91‑1 (MQ=255) aaGGGATCAAAGGTGATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCAAGTTGCTTATTTATATTGTGTGATGTCGaa < 1:6426394/91‑1 (MQ=255) aGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGCTGTCGAAg > 2:6936666/1‑91 (MQ=255) aGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAg > 2:4003050/1‑91 (MQ=255) aGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAg > 2:4660960/1‑91 (MQ=255) gggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGt < 2:127130/91‑1 (MQ=255) gggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGt > 2:1919104/1‑91 (MQ=255) gggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGt > 1:6095107/1‑91 (MQ=255) gggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGt > 1:3469422/1‑91 (MQ=255) gggATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCCAAGt > 2:3521304/1‑91 (MQ=255) GGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTa < 2:6579969‑M1/91‑1 (MQ=255) GGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTa < 1:1368286‑M1/91‑1 (MQ=255) GGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTa < 1:3299890‑M1/91‑1 (MQ=255) GATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAt < 2:4337058‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCAAAGGTCATCCCCCCTGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAtt < 2:5451936‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAttt > 2:4438871‑M1/1‑91 (MQ=255) TCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAttt < 2:3787118‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTAttt < 2:1559709‑M1/91‑1 (MQ=255) CAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTg < 1:5086226‑M1/91‑1 (MQ=255) gTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGAc > 1:2624697/1‑91 (MQ=255) tCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACt > 1:4367910/1‑91 (MQ=255) tCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACt > 1:5250934/1‑91 (MQ=255) catcccccactatcaatcatgggggatgacttttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACtt > 2:2142304‑M2/40‑91 (MQ=255) aTCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTc < 1:4660960/91‑1 (MQ=255) tcccccactatcaatcatgggggataacctttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGACGTATTTGCTGACTTCg > 2:6657458‑M2/38‑91 (MQ=255) tCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCg > 1:1579436/1‑91 (MQ=255) ccccATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGcc < 2:1811763/91‑1 (MQ=255) cccactatcaatcatgggggatgacttttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCa > 1:2021318‑M2/35‑91 (MQ=255) cATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAAt < 2:1065992/91‑1 (MQ=255) tatcaatcataggggatgacctttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAAtttt > 2:5832109‑M2/30‑91 (MQ=255) ttgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTAt < 2:4078507/91‑1 (MQ=255) tgatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCATTTTTATc < 2:410439/91‑1 (MQ=255) gatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCa > 1:4743087/1‑91 (MQ=255) gatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCa > 2:1608883/1‑91 (MQ=255) gatAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCa < 1:1420984/91‑1 (MQ=255) atAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAt > 1:2516072/1‑91 (MQ=255) atAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAt > 1:3678824/1‑91 (MQ=255) aGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtag < 1:6572849/91‑1 (MQ=255) aGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtag > 2:514272/1‑91 (MQ=255) gTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagt < 1:3175780/91‑1 (MQ=255) gTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagt < 1:5933612/91‑1 (MQ=255) gTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagt < 1:4013707/91‑1 (MQ=255) gTGGGGGATGACTATTGATCCTATGTTCATCTTGCTTATTTATAGTGTAGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagt > 1:5560332/1‑91 (MQ=255) tgggggatgacctttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagta < 1:2102885‑M2/71‑1 (MQ=255) gggggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCAtagtag > 1:6245197/1‑91 (MQ=255) ggggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGc > 1:1068674/1‑91 (MQ=255) ggggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGc < 2:4758584/91‑1 (MQ=255) gggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGcc < 2:5300655/91‑1 (MQ=255) gggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGcc < 1:577727/91‑1 (MQ=255) ggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCt < 2:5496989/91‑1 (MQ=255) ggATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCt < 2:2728665/91‑1 (MQ=255) gATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCtt < 2:2467833/91‑1 (MQ=255) aTGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCttt < 2:3400222/91‑1 (MQ=255) aCTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgat > 1:6999185/1‑91 (MQ=255) aCTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgat > 2:326840/1‑91 (MQ=255) aCTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGAAGCCTTtgat > 2:5570380/1‑91 (MQ=255) ttttGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTtgatga < 2:2803949/91‑1 (MQ=255) tttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTgatgat < 2:3004506‑M2/83‑1 (MQ=255) tttgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTgatgat > 2:6161498‑M2/9‑91 (MQ=255) tgatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGAttt > 2:903232‑M2/7‑91 (MQ=255) gatccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGAtttt < 1:6045146‑M2/86‑1 (MQ=255) atccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTa > 1:84162‑M2/5‑91 (MQ=255) atccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTa < 1:6668336‑M2/87‑1 (MQ=255) atccTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTa < 1:1220965‑M2/87‑1 (MQ=255) cTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTAGCa < 2:6456631‑M2/90‑1 (MQ=255) tATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTAGCAt < 2:1948448/91‑1 (MQ=255) | AACAATCACCGCTATTTTTGCTTGTGTATGTATAAAAAAGGGATCAAAGGTCATCCCCCATGATTGATAGTGGGGGATGACTTTTGATCCTATGTTCATGTTGCTTATTTATATTGTGGGATGTCGAAGTATTTGCCGACTTCGCCAATTTTATCATAGTAGCCTTTGATGATTTTAGCAT > USA300TCH1516_ALE/1058062‑1058242 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |