New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1765719 = | 322 (0.900) | 19 (0.060) | 15/146 | NT | 6.5% | intergenic (‑26/‑377) | valS/tag | Valine‑‑tRNA ligase/DNA‑3‑methyladenine glycosylase 1 |
? | USA300TCH1516_ALE | 1765753 = | 250 (0.770) | intergenic (‑60/‑343) | valS/tag | Valine‑‑tRNA ligase/DNA‑3‑methyladenine glycosylase 1 |
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
CACGAGGATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCACTCTTTTAACATAATTGGAATAATCATACCAATACTATCATCGTG > USA300TCH1516_ALE/1765663‑1765843 | cACGAGGATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTc < 1:2603441/91‑1 (MQ=255) cACGAGGATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTc > 2:1445570/1‑91 (MQ=255) cGAGGATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCg < 1:2858555/91‑1 (MQ=255) cGAGGATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCg < 2:6589427/91‑1 (MQ=255) aGGATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCCTCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTg < 1:5581648/91‑1 (MQ=255) ggATCATATTTTGGTTTCATTTCCATTTGCTATACCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTgg < 2:1266128/91‑1 (MQ=255) 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ataCCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAata < 2:1718985/91‑1 (MQ=255) ataCCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAata > 2:3804759/1‑91 (MQ=255) taCCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAatat > 1:5991300/1‑91 (MQ=255) aCCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATc < 1:1405524/91‑1 (MQ=255) aCCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATc < 1:2391421/91‑1 (MQ=255) aCCTCCTAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATc > 1:6102127/1‑91 (MQ=255) cctcctAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCa < 1:4695351/91‑1 (MQ=255) ctAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAAtt < 2:2232579/91‑1 (MQ=255) ctAAAAAAATAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAAtt < 2:2311313/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaTAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCa < 2:3014178/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaTAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCa > 1:1041251/1‑91 (MQ=255) aaaaaaaTAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAAGATCAAATTCa > 1:6968531/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTAAAAATATCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCAc < 1:5343629/91‑1 (MQ=255) aaataaaaataTCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCActct > 2:5122472/1‑91 (MQ=255) aaataaaaataTCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCActct > 1:4873000/1‑91 (MQ=255) aataaaactaTCCATCCTATATACAAATAGGACGGATATTCCGTGGTACCACCTATATTCAAGAAGGATGATTAATATCAAATTCACTCtt > 2:288823/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |