| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1954767 = | 287 (0.800) | 17 (0.060) | 8/138 | NT | 7.0% | intergenic (‑29/+36) | nisB/gdmA | Nisin biosynthesis protein NisB/Lantibiotic gallidermin |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1954795 = | 206 (0.670) | intergenic (‑57/+8) | nisB/gdmA | Nisin biosynthesis protein NisB/Lantibiotic gallidermin | |||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
TACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTG > USA300TCH1516_ALE/1954705‑1954885 | tcgaaaGACTTGACGCTTTGTAAATATTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATTGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGc < 1:5844234/88‑1 (MQ=37) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTg < 1:1217643/91‑1 (MQ=255) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTg > 1:6889066/1‑91 (MQ=255) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTg < 2:333379/91‑1 (MQ=255) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTg < 2:407293/91‑1 (MQ=255) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTg < 2:4009937/91‑1 (MQ=255) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTg > 2:1985940/1‑91 (MQ=255) cAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGA‑CTCTATTTGCTg > 2:4528760/1‑91 (MQ=255) aaaTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGt < 1:5078738/91‑1 (MQ=255) aaaTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGt < 1:2583477/91‑1 (MQ=255) aaTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTa < 2:5264988/91‑1 (MQ=255) aaTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTa > 1:1719794/1‑91 (MQ=255) aTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTaa < 1:2092947/91‑1 (MQ=255) aTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTaa < 1:738708/91‑1 (MQ=255) tACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAAt > 2:6795280/1‑91 (MQ=255) cTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCt > 1:2192890/1‑91 (MQ=255) gACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTaa < 1:6677415/91‑1 (MQ=255) aCGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAc > 2:6723413/1‑91 (MQ=255) aCGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAc > 1:325738/1‑91 (MQ=255) cGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAca < 2:2282821/91‑1 (MQ=255) ggTTCGTCAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAcag < 1:5548350/91‑1 (MQ=255) ttgtgctaagactggtagttttaatagcttctgctgttaagattacagcaaatagagccctttcaggctctatttgCTGTAATCTTAAcag < 1:5888163‑M2/15‑1 (MQ=255) gTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAcagc < 2:447582/91‑1 (MQ=255) gTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAcagc < 1:5529770/91‑1 (MQ=255) ttCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAcagca < 1:5436653/91‑1 (MQ=255) ttCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAcagca < 2:3662543/91‑1 (MQ=255) tAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAg < 1:3641081/91‑1 (MQ=255) tAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAg < 1:1290109/91‑1 (MQ=255) aaaTAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGc > 1:871937/1‑91 (MQ=255) aaaTAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CACTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGc > 1:4767540/1‑91 (MQ=255) tAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAt < 2:3289225/91‑1 (MQ=255) tAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAt < 2:3795047/91‑1 (MQ=255) tAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAt < 1:1021877/91‑1 (MQ=255) tAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAt > 2:5637467/1‑91 (MQ=255) aGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAtt > 1:692171/1‑91 (MQ=255) gtgtTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTa < 1:4028888/91‑1 (MQ=255) cATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACt > 1:1493967/1‑91 (MQ=255) tttGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTAc < 1:441763/91‑1 (MQ=255) tttGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTAc < 2:1781053/91‑1 (MQ=255) ttGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTAcc < 1:2743856/91‑1 (MQ=255) gTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAg > 2:3618709/1‑91 (MQ=255) aaGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTc < 1:500522/91‑1 (MQ=255) aaGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTc > 1:3131551/1‑91 (MQ=255) cACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTa > 1:2425630/1‑91 (MQ=255) cACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCACTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAAAAGCAGAAGCTATTAAAACTACAAGTCTTa > 2:351559/1‑91 (MQ=255) aCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAg > 1:4660513/1‑91 (MQ=255) aCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAg > 1:3793340/1‑91 (MQ=255) tctgctgttaagattacagCAAATAGAGCC‑TGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGc < 1:525027‑M1/72‑1 (MQ=255) ccTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCCGTCTTAGc > 2:4737938/1‑91 (MQ=255) ccTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGc < 1:201735/91‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGca < 1:2510026/91‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGca < 2:6356223/91‑1 (MQ=255) tCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcac > 1:4591792/1‑91 (MQ=255) tCACATATCTGAATAGACAAATATAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACCGCAGAAGCAATTAAAACTACCAGTCTTAGcac > 2:5970169/1‑91 (MQ=21) gctgttaagattacagCAAATAGAGCCTGAAAGGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcaca < 1:1383124‑M1/75‑1 (MQ=255) gctgttaagattacagCAAATAGAGCC‑TGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcaca < 1:3452344‑M1/75‑1 (MQ=255) cacaTATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcaca > 2:619515/1‑91 (MQ=255) acaTATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGATATCAAAACTACCAGTCTTAGCACaa > 2:6893042/1‑91 (MQ=255) caTATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAAc > 2:3920215/1‑91 (MQ=255) tatTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCa < 2:1207137/91‑1 (MQ=255) tatTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCa > 1:6198478/1‑91 (MQ=255) tatTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCa > 2:2562902/1‑91 (MQ=255) ttGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGa < 2:4252973/91‑1 (MQ=255) ttGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGa < 1:1555063/91‑1 (MQ=255) tGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAg > 1:1597501/1‑91 (MQ=255) aTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTAc < 2:6369538/91‑1 (MQ=255) aTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTAc > 2:5526049/1‑91 (MQ=255) aTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTAc < 2:5172788/91‑1 (MQ=255) aGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAt < 2:2168728/91‑1 (MQ=255) aGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAt > 2:2917646/1‑91 (MQ=255) gACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATa > 1:6304135/1‑91 (MQ=255) AAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAAc > 1:4918648‑M1/1‑91 (MQ=255) ATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTa > 1:3929508‑M1/1‑91 (MQ=255) ATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTa > 1:6482081‑M1/1‑91 (MQ=255) TAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt < 2:80316‑M1/91‑1 (MQ=255) TAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt > 1:2272729‑M1/1‑91 (MQ=255) TAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTATTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt < 2:5783818‑M1/91‑1 (MQ=255) AGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATg > 2:1050436‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGa > 1:107555‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGa < 1:1948553‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGa < 1:4173163‑M1/91‑1 (MQ=255) agcctgaaagggctctatttgTTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGAc > 1:3032170‑M2/22‑91 (MQ=255) GCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACt < 2:137547‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACtt > 2:2434054‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAGGCTATTAAAACTa < 2:490208‑M1/51‑1 (MQ=255) CCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTa > 1:489226‑M1/1‑51 (MQ=255) CCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTg < 2:4973‑M1/91‑1 (MQ=255) cTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGt < 2:6639950/91‑1 (MQ=255) aGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATAc < 2:2071274/91‑1 (MQ=255) ggctctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACg < 2:4654520‑M2/80‑1 (MQ=255) ctctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGtt > 1:2812969‑M2/10‑91 (MQ=255) tctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTc < 1:5601116‑M2/83‑1 (MQ=255) tctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTc > 1:3230491‑M2/9‑91 (MQ=255) tctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTc < 1:2917646‑M2/83‑1 (MQ=255) ctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCg > 1:411192‑M2/8‑91 (MQ=255) ctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCg > 1:566699‑M2/8‑91 (MQ=255) ctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCg < 2:1597501‑M2/84‑1 (MQ=255) ctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAGAAACTATGACTTGTAATACGTTCg > 1:6630441‑M2/8‑91 (MQ=255) tgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCAcc > 2:485679‑M2/3‑91 (MQ=255) cTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctg < 1:2344178/91‑1 (MQ=255) | TACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGG‑CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTG > USA300TCH1516_ALE/1954705‑1954885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |