| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2733754 = | 361 (1.010) | 9 (0.030) | 8/146 | NT | 2.8% | intergenic (+67/+62) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2733788 = | 304 (0.930) | intergenic (+101/+28) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 452 total aligned reads displayed.
TTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCTTCATTCAT > USA300TCH1516_ALE/2733698‑2733878 | ttACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGcc > 2:2866219/1‑91 (MQ=255) aCGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTCTAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCt > 2:4712938/1‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 2:3442421/1‑91 (MQ=255) ggTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttt > 2:2463772/1‑91 (MQ=255) ggTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttt > 2:5230018/1‑91 (MQ=255) gTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtttt < 1:1906240/91‑1 (MQ=255) tCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttttt < 1:4929203/91‑1 (MQ=255) tCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttttt < 1:3024112/91‑1 (MQ=255) cGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTtta > 2:109673/1‑91 (MQ=255) gCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttat < 1:3702739/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttat < 2:1198379/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttat > 1:3069314/1‑91 (MQ=255) cTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatt < 1:1015733/91‑1 (MQ=255) ttttGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatta < 2:4116633/91‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTg > 2:1906515/1‑91 (MQ=255) gATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGa > 1:2199986/1‑91 (MQ=255) gATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGa > 2:228253/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGAt > 1:4565476/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGAt > 1:1447526/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGAt > 2:87591/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATg < 1:1128766/91‑1 (MQ=255) aaaaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGc < 2:1956681/91‑1 (MQ=255) aaaaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGc < 1:2033683/91‑1 (MQ=255) aaaaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGc < 2:5916555/91‑1 (MQ=255) aGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTCAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAt < 1:5348416/91‑1 (MQ=255) aGTGACATAGCGATAGGACTTTAGAACAAGAGAAAGCCACACTCTTGTAATCTTAAACCAAGGGGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTag < 2:318023/91‑2 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGGGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 1:2689660/91‑1 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 2:1776988/91‑1 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 2:168629/91‑1 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 2:4506073/91‑1 (MQ=255) tGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAttt < 1:5118785/91‑1 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTGTATTATTGATGGCAATTTaa > 2:3554063/1‑91 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTAAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATTGCTATTTaa > 2:6971556/1‑91 (MQ=255) tAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAttt < 2:1470723/91‑1 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtttt > 2:4294739/1‑91 (MQ=255) gTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTCTTTAATTTta > 2:5548079/1‑91 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:2741570/91‑1 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:3264731/91‑1 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:800375/91‑1 (MQ=255) ggACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAacac < 1:5668409/91‑1 (MQ=255) ggACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAacac > 2:6883640/1‑91 (MQ=255) ggACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTCTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAacac > 2:3794170/1‑91 (MQ=255) cTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTAt < 2:914158/91‑1 (MQ=255) cTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTAt > 2:4186696/1‑91 (MQ=255) gTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCg > 1:5907050/1‑91 (MQ=255) tataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGt < 1:6517274/91‑1 (MQ=255) tataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATCGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGt > 1:6839474/1‑91 (MQ=255) tataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGAGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACAGTATCGt > 2:6397447/1‑91 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt > 1:2898650/1‑91 (MQ=255) aaCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtt < 1:1989532/91‑1 (MQ=255) aaCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtt > 2:5522554/1‑91 (MQ=255) aCAAGAGAGAGCCACACGCTTGGAATCTTAATCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 2:6174066/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAGCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 2:2631757/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt > 1:4209541/1‑91 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 1:5498405/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 1:6082414/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt > 1:6378846/1‑91 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt < 2:3375138/91‑1 (MQ=255) agagAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCt < 1:4030341/91‑1 (MQ=255) agagAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCt < 2:1300683/91‑1 (MQ=255) agagAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCt > 2:3011280/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:1238742/1‑91 (MQ=255) gaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCtttt < 2:6503251/91‑1 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTc > 2:5660436/1‑91 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTc > 2:806641/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa < 2:5140670/91‑1 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 1:1800640/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 1:3535494/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 1:2655239/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt < 1:2381360‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt < 1:163435‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 2:6055551‑M1/1‑91 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt < 2:3952695‑M1/81‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 1:3510432‑M1/91‑1 (MQ=255) ctCACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATCGCTATTTAATCTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGa < 2:1598523‑M1/89‑1 (MQ=255) CACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAAt > 2:4643413‑M1/1‑91 (MQ=255) CGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCa < 1:6686031‑M1/91‑1 (MQ=255) tGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTc < 2:3711620/91‑1 (MQ=255) ggAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCa < 2:3263777/91‑1 (MQ=255) ggAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCa < 2:4025216/91‑1 (MQ=255) aaCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACa < 1:868289/91‑1 (MQ=255) aaCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACa < 1:438953/91‑1 (MQ=255) aCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACAt < 2:5309782/91‑1 (MQ=255) aCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACAt < 1:320656/91‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACAtt < 2:6279993/91‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACAtt > 2:4797811/1‑91 (MQ=255) ccAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACAtt < 1:1356349/91‑1 (MQ=255) aaGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACTCTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTAt < 2:6737528/91‑1 (MQ=255) aGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTTTTTAATCATTTCAATAATGACATTAtt > 2:2715586/1‑90 (MQ=255) ggTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCt > 1:3655915/1‑91 (MQ=255) ggTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCt > 2:5719396/1‑91 (MQ=255) ggTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCt > 1:6189472/1‑91 (MQ=255) ggTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCt > 1:3368060/1‑91 (MQ=255) gtggcCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttca > 1:476892‑M2/6‑91 (MQ=255) tggcCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttcat < 1:5719396‑M2/87‑1 (MQ=255) ggcCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttcatt > 2:4556297‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttcatt > 1:6989250‑M2/4‑91 (MQ=255) gcCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttcattc > 1:5193872‑M2/3‑91 (MQ=255) gcCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttcattc > 2:2775839‑M2/3‑91 (MQ=255) cCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCttcattca < 2:6557549‑M2/90‑1 (MQ=255) | TTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCTTCATTCAT > USA300TCH1516_ALE/2733698‑2733878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |