New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2751374 | 349 (0.980) | 10 (0.030) | 6/146 | NT | 3.0% | intergenic (‑222/+39) | betA/gbsA | Oxygen‑dependent choline dehydrogenase/Betaine aldehyde dehydrogenase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2751393 | 333 (1.020) | intergenic (‑241/+20) | betA/gbsA | Oxygen‑dependent choline dehydrogenase/Betaine aldehyde dehydrogenase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
TCTATGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTACTCTT > USA300TCH1516_ALE/2751303‑2751483 | cTATGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGc > 2:759722‑M2/1‑90 (MQ=255) cTATGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGc < 2:6914445‑M2/91‑2 (MQ=255) tATGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAGCATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGca < 1:5360218‑M2/91‑3 (MQ=255) tATGATTCATCTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAGACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGca > 1:6957665‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGcac > 1:2664889‑M2/1‑88 (MQ=255) aTGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGcac > 1:5938626‑M2/1‑88 (MQ=255) tGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGcact > 2:2788255‑M2/1‑87 (MQ=255) tGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGcact > 2:3368775‑M2/1‑87 (MQ=255) tGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGcact > 2:3585372‑M2/1‑87 (MQ=255) ttCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGcactcac > 2:3039916‑M2/1‑84 (MQ=255) tCATTTTGCGTTTAGTCCAAATAATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCAcc > 2:5330124/1‑91 (MQ=255) cATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCt < 1:5569718/91‑1 (MQ=255) aTTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCtt < 1:3941278/91‑1 (MQ=255) ttttGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTa < 2:138299/91‑1 (MQ=255) gCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTa < 2:5077225/91‑1 (MQ=255) cGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTaa > 2:3798323/1‑91 (MQ=255) cGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTaa < 2:5173401/91‑1 (MQ=255) cGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTACTTACAATGGCATTAACCTTATCTaa > 1:5268991/1‑91 (MQ=255) gTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAAt < 2:551516/91‑1 (MQ=255) tcgTCAAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAATTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCCCTCACCTTATCTATtttt > 2:2827876/3‑91 (MQ=255) gTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTa > 2:3700625/1‑91 (MQ=255) tCCAAATTATCACTCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTAt < 2:4642991/91‑1 (MQ=255) tCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTAt < 1:2017756/91‑1 (MQ=255) ccAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTAtt < 1:3602465/91‑1 (MQ=255) ccAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATCGCACTCACCTTATCTAATTTTTAtt > 2:6497490/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTg > 2:2102603/1‑91 (MQ=255) aaTTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGc > 2:4523181/1‑91 (MQ=255) aaTTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGc < 1:6458760/91‑1 (MQ=255) aaTTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGc > 2:4727479/1‑91 (MQ=255) aTTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCt < 1:4802523/91‑1 (MQ=255) atcaatcaACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTaaa > 1:3098358/1‑91 (MQ=255) tcaatcaaCATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTTCAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAAc < 1:6719166/91‑1 (MQ=255) aatcaaCATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCa > 2:6281093/1‑91 (MQ=255) aatcaaCATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCa > 1:891480/1‑91 (MQ=255) tcaaCATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAAt > 2:5229413/1‑91 (MQ=255) cATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCAc < 1:169658/91‑1 (MQ=255) cATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCAc > 2:1031059/1‑91 (MQ=255) tttCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTa > 2:1564496/1‑91 (MQ=255) tCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAAt > 2:204134/1‑91 (MQ=255) tCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAAt < 1:2418446/91‑1 (MQ=255) tCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAAt < 1:5679026/91‑1 (MQ=255) cGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAAtt > 1:1348256/1‑91 (MQ=255) gCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATtg > 2:4909220/1‑91 (MQ=255) cACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATtgtg < 1:6314228/91‑1 (MQ=255) cACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATtgtg > 1:6686717/1‑91 (MQ=255) cACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATtgtg > 1:4536379/1‑91 (MQ=255) cTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGa > 1:223760/1‑91 (MQ=255) cTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGa < 2:3242/91‑1 (MQ=255) cTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGa > 1:3398324/1‑91 (MQ=255) cTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGa > 1:1229584/1‑91 (MQ=255) ttATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGat < 1:2479773/91‑1 (MQ=255) ataCAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGattt < 1:4028018/91‑1 (MQ=255) taCAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGatttg > 1:5010783/1‑91 (MQ=255) acaaaacaaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGatttgt > 1:772470/1‑91 (MQ=255) acaaaacaaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGatttgt > 2:4872632/1‑91 (MQ=255) caaaacaaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATtg < 2:5389863/81‑1 (MQ=255) aaaacaaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGatttgtat < 2:819237/91‑1 (MQ=255) aaaacaaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGatttgtat < 1:6605001/91‑1 (MQ=255) acaaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGatttgtatttg < 1:30128/91‑1 (MQ=255) aaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGtt < 2:5644660/91‑1 (MQ=255) aaaGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGtt > 2:2682382/1‑91 (MQ=255) aaGTGAGTGACTTGTGATCTTACAATGGCACCCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGCATTCGTATTTGTTa > 1:6410548/1‑91 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa < 2:4037698/91‑1 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa > 1:4609558/1‑91 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa < 1:5149708/91‑1 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa > 2:341792/1‑91 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa < 2:1131381/91‑1 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa > 2:6098091/1‑91 (MQ=255) agtgagtgTCTTGTGTACTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaa < 1:2827876/91‑1 (MQ=255) gtgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaaa > 2:4443504/1‑91 (MQ=255) tgagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTaaaa > 1:1261840/1‑91 (MQ=255) gagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGcactcactttgttttgtataagtggcgaaatgttgattgataatttggactaaacgcaaaatgaatc < 1:4406019‑M2/91‑68 (MQ=255) gagtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAAt < 2:435955/91‑1 (MQ=255) agtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAAtg > 1:1575350/1‑91 (MQ=255) agtgTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAAtg < 1:4727479/91‑1 (MQ=255) tgtCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAAtgtg < 2:4128323/91‑1 (MQ=255) gtCTTGTGTTCTTACAATGGTACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATgtgt < 2:5809208/91‑1 (MQ=255) gtCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATgtgt < 2:264102/91‑1 (MQ=255) tCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGtt < 1:3791091/91‑1 (MQ=255) cTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGttt < 1:1764871/91‑1 (MQ=255) cTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGttt < 1:4346028/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGtttt > 1:1054107/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCGAATATGTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGtttt < 2:6364939/91‑1 (MQ=255) tgtgTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTg > 1:2103102/1‑91 (MQ=255) gtgtTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGa < 2:2361724/91‑1 (MQ=255) tgtTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTTaa > 1:3185073/1‑91 (MQ=255) ttCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAAc < 1:1133296/91‑1 (MQ=255) ttCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAAc > 1:2327074/1‑91 (MQ=255) ttCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAAc < 2:6604789/91‑1 (MQ=255) tCTTACAATGGcactcactttgttttgtataagtggcgaaatgttgattgataatttggactaaacgcaaaatgaatcatagattatttca < 2:2402064‑M2/91‑81 (MQ=255) tACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAgg < 1:4272393/91‑1 (MQ=255) tACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAgg > 1:2790436/1‑91 (MQ=255) tACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAgg > 2:1685780/1‑91 (MQ=255) tACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAgg < 2:6830234/91‑1 (MQ=255) aaTGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTAc > 1:6147082/1‑91 (MQ=255) aTGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTAct < 2:1869852/91‑1 (MQ=255) tGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTActc > 2:4585411/1‑91 (MQ=255) tGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTActc < 1:356516/91‑1 (MQ=255) ggCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTActct > 2:1768606/1‑91 (MQ=255) gCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTACtctt > 1:5918733/1‑91 (MQ=255) | TCTATGATTCATTTTGCGTTTAGTCCAAATTATCAATCAACATTTCGCCACTTATACAAAACAAAGTGAGTGTCTTGTGTTCTTACAATGGCACTCACCTTATCTAATTTTTATTTGCTAAACCAATTCACTAATTGTGGATTTGTATTTGTTAAAATGTGTTTTGAAACAAGGTACTCTT > USA300TCH1516_ALE/2751303‑2751483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |