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Only 100 of 3687 total aligned reads displayed.
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4:333657‑M2/141‑76 (MQ=255) aaTAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaa > 1:827302‑M2/1‑64 (MQ=255) aaaaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaaca > 1:250716‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaagacccccagtattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaaaacacgtttaaacactgtaatatcaacagttacagctatatatataagatcgagt > 3:122255‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacg > 3:74004‑M2/1‑58 (MQ=255) agacccccagtattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaaaacacgtttaaacactgtaatatcaacagttacagctatatatataaaatcgagttat > 2:774378‑M1/1‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |