New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1619594 = | 96 (0.770) | 6 (0.050) | 5/244 | NT | 5.9% | coding (813/816 nt) | proC | Pyrroline‑5‑carboxylate reductase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1619661 = | 102 (0.870) | intergenic (+64/+41) | proC/rnz | Pyrroline‑5‑carboxylate reductase/Ribonuclease Z |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
AGAAAAAATATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAA > USA300TCH1516_ALE/1619454‑1619734 | aagacagaggatcgaaatgaaatttatcaaacattgatacagaatgaagatacacctaattttaattttgtaaaagattttgagagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaatta > 2:390488‑M1/141‑141 (MQ=255) aGAAAAAATATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCaa > 2:577987/1‑141 (MQ=255) gAAAAAATATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAAt > 2:85231/1‑141 (MQ=255) gAAAAAATATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAAt > 4:112279/1‑141 (MQ=255) atacagaagatataaatgaaatttatcaaacattgatacaaaatgaagatacacctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattat > 2:623808‑M1/140‑141 (MQ=255) atacagaagatataaatgaaatttatcaaacattgatacaaaatgaagatacacctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatacttgccaaataacaataaattat < 1:828941‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATa > 1:1071429/1‑141 (MQ=255) aaaaaaTATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATa > 2:124036/1‑141 (MQ=255) aaaaaTATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATaa < 1:799492/141‑1 (MQ=255) cagaagatataaatgaaatttatcaaacattgatacaaaatgaagatacacctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATaaa < 4:206320‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaaTATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATaaa > 1:591652/1‑141 (MQ=255) gaagatataaatgaaatttatcaaacattgatacaaaatgaagatacacctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATaaaaa < 2:223837‑M1/7‑1 (MQ=255) gaagatataaatgaaatttatcaaacattgatacaaaatgaagatacacctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATaaaaa < 2:223609‑M1/7‑1 (MQ=255) atatTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAaaac < 4:180397/141‑1 (MQ=255) ttACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAA > 2:666464‑M1/1‑141 (MQ=255) tACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAAC > 2:298875‑M1/1‑141 (MQ=255) tACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTGCGAAGAGTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATCGAAGACCAATAAAAACAAAC > 4:212280‑M1/1‑141 (MQ=255) tACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAATGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATGTAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTa < 1:391433/141‑1 (MQ=255) cGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATg > 4:266223/1‑141 (MQ=255) acacAAGCTGGCCTTGATAGATTGTCACAGTATGAGCTAGGACCTATGGTCGAAGGTTTTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGca < 1:914906/141‑1 (MQ=255) caAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGcatca < 1:578911/141‑1 (MQ=255) caAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGcatca > 3:206320/1‑141 (MQ=255) aaGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGcatcat > 2:1072026/1‑141 (MQ=255) aGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCatcatc > 1:846420/1‑141 (MQ=255) gCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAATGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATGTAGAATACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCatcatca > 4:130018/1‑140 (MQ=255) gCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCg > 2:94101/1‑141 (MQ=255) ggCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCaa > 2:691695/1‑141 (MQ=255) aagatacgcctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAATAACCCGTCAAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACtgt > 4:258937‑M1/95‑141 (MQ=255) aCATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGtcaaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtg < 3:112279‑M1/141‑35 (MQ=255) atacacctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAATAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGttt > 3:86964‑M1/92‑141 (MQ=255) tGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGtcaaacacagtgcttgcgatgatgcatacatgtgttgg < 2:464909‑M1/141‑39 (MQ=255) tGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGAGTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGa < 2:597449/141‑1 (MQ=255) tCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGAcg > 1:899539‑M2/1‑139 (MQ=255) ctaattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAATAA‑CCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACggg > 2:1020684‑M1/86‑141 (MQ=255) taattttaattttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACggg > 1:344331‑M1/85‑141 (MQ=255) acaATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGAcggg < 2:362409‑M2/141‑5 (MQ=255) caATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGAcgggt > 1:738163‑M2/1‑136 (MQ=255) tatGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAt > 1:670795/1‑141 (MQ=255) tGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAttt > 4:369262/1‑141 (MQ=255) gATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAtttt > 2:916241/1‑141 (MQ=255) gATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAtttt < 1:523139/141‑1 (MQ=255) aTTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTCTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAATCAACCCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTAttttt < 1:264046/141‑1 (MQ=255) tttAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTta > 1:411689/1‑141 (MQ=255) tttAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTta > 1:411644/1‑141 (MQ=255) tttAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTta > 2:257804/1‑141 (MQ=255) tttgtaaaagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTtat > 3:345778‑M1/75‑141 (MQ=255) ttAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTtat < 1:841030/141‑1 (MQ=255) ttAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTtat < 4:357800/141‑1 (MQ=255) aGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATaa < 3:86985/141‑1 (MQ=255) aTCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAAttt < 1:617959/141‑1 (MQ=255) tCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTa > 2:736058/1‑141 (MQ=255) aagattttgatagttttaaaatctaatgacaaagtaataaacaatgcttgccaaataacaataaattATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTAt > 2:398487‑M1/68‑141 (MQ=255) tATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTAtt < 1:727735/141‑1 (MQ=255) ttttCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGt < 2:346818/141‑1 (MQ=255) tCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTAt < 1:298875/141‑1 (MQ=255) cGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTAtt > 2:1048498/1‑141 (MQ=255) aGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTgg > 2:776033/1‑141 (MQ=255) gATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc < 1:1019585/141‑1 (MQ=255) gATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc > 2:768616/1‑141 (MQ=255) gATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGc > 3:12763/1‑141 (MQ=255) aTTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCa < 2:606990/141‑1 (MQ=255) ttGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCGCTGTGTTTGACGGGATTTTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCaa > 1:926236/1‑141 (MQ=255) gTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTGTTGTTATTTGGCAAGc < 1:1072026/141‑1 (MQ=255) tCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTACTATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGcc > 3:262501/1‑140 (MQ=255) cTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAACCCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAt > 2:834815/1‑141 (MQ=255) cTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGGTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAt > 3:242105/1‑141 (MQ=255) tAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAtt > 3:40364/1‑141 (MQ=255) tAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAtt > 4:244692/1‑141 (MQ=255) tAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAtt > 4:244709/1‑141 (MQ=255) tAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCAtt > 1:662808/1‑141 (MQ=255) aaCGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGt < 1:100533/141‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGtt > 2:81017/1‑141 (MQ=255) gCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTtta < 2:384137/141‑1 (MQ=255) gCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTtta > 1:878071/1‑141 (MQ=255) tGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTttatt > 3:225691/1‑141 (MQ=255) ccGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGAGCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTAGGCAATCATTGTttattaa > 2:589524/1‑140 (MQ=255) cGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACt > 2:579856/1‑141 (MQ=255) gTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACtt > 1:740510/1‑141 (MQ=255) tCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACttt > 1:183113/1‑141 (MQ=255) tCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACttt > 1:183045/1‑141 (MQ=255) aCCGTAGTATCGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAACCAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTc > 1:213477/1‑141 (MQ=255) ccGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTcc > 1:1080294/1‑140 (MQ=255) tagtaTTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTa > 2:190138/1‑141 (MQ=255) agtaTTGAACTTTCTAATGTAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCACATACA‑T‑AGTTGGACGGGTTATTTTTATAAATTATTACTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGac > 4:299171/1‑140 (MQ=255) ttGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAttt < 1:456172/141‑1 (MQ=255) tGAACTTTCTAAGATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGAtttt < 1:1040336/141‑1 (MQ=255) aCTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACATTGTCATTAGATTTTaaa > 1:422476/1‑141 (MQ=255) cTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCACCACATGTATGCACCACCGCCAGCACTGCGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGActttccaa > 2:762588/1‑137 (MQ=255) cTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTAt > 2:127855/1‑141 (MQ=255) aaTATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCACCGCAAGCACTGTGCCTGAcgggtttgtttttattggtcttctatattagaaagttcaatactacggtcggcggcagcgtttagacaatcttc < 2:596494‑M2/141‑75 (MQ=255) atatAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaa < 1:822031/141‑1 (MQ=255) atatAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaa > 2:846255/1‑141 (MQ=255) tataGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCaaa < 1:69575/141‑1 (MQ=255) taGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAAt > 1:268891/1‑141 (MQ=255) agaagaCCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATc > 1:622217/1‑141 (MQ=255) agaagaCCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATc > 4:184871/1‑141 (MQ=255) gaagaCCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCt < 1:34051/141‑1 (MQ=255) gaagaCCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCt < 3:289071/141‑1 (MQ=255) ccAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTAc < 4:268528/141‑1 (MQ=255) aaTAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACaa > 1:42007/1‑141 (MQ=255) | AGAAAAAATATTACCTCTAAAGGTGGTACGACACAAGCTGGCCTTGATACATTGTCACAATATGATTTAGTATCTATTTTCGAAGATTGTCTAAACGCTGCCGTCGACCGTAGTATTGAACTTTCTAATATAGAAGACCAATAAAAACAAACCCGCCAACACATGTATGCATCATCGCAAGCACTGTGTTTGACGGGTTATTTTTATAATTTATTGTTATTTGGCAAGCATTGTTTATTACTTTGTCATTAGATTTTAAAACTATCAAAATCTTTTACAAA > USA300TCH1516_ALE/1619454‑1619734 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |