New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1822865 = | 129 (1.040) | 7 (0.060) | 7/240 | NT | 5.7% | intergenic (+186/+60) | USA300HOU_RS09070/ackA | Putative universal stress protein/Acetate kinase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1822909 = | 110 (0.950) | intergenic (+230/+16) | USA300HOU_RS09070/ackA | Putative universal stress protein/Acetate kinase |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACT > USA300TCH1516_ALE/1822725‑1823003 | gCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACaaaa > 1:950592/1‑141 (MQ=255) cttactacgtggtaaagaaggatttattaactatcctcattcaccagttaaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatatta < 4:275200‑M1/1‑1 (MQ=255) cttactacgtggtaaagaaggatttattaactatcctcattcaccagttaaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatatta > 1:943766‑M1/141‑141 (MQ=255) ttactacgtggtaaagaaggatttattaactatcctcattcaccagttaaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattaa > 4:230595‑M1/140‑141 (MQ=255) cAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATTTTTTCATAATATTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTTAAACAATACaaaaa > 4:414681/1‑141 (MQ=255) cAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACaaaaa > 2:665610/1‑141 (MQ=255) tactacgtggtaaagaaggatttattaactatcctcattcaccagttaaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattAAg > 2:637287‑M1/139‑141 (MQ=255) agaaagttGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAg > 1:714648/8‑141 (MQ=255) gaaagttGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTAACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATAAAAAAAGc > 2:1072923/7‑141 (MQ=255) aCTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATTATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTTAAACAATACAAAAAGc > 4:369654/1‑141 (MQ=255) ttCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTc < 1:240292/141‑1 (MQ=255) ttCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTc < 2:673037/141‑1 (MQ=255) acgtggtaaagaaggatttattaactatcctcattcaccagttaaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattAAGCGTc > 1:545372‑M1/135‑141 (MQ=255) cTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTa > 1:398968/1‑141 (MQ=255) tGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTAc < 3:368176/141‑1 (MQ=255) cACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTAcct > 1:139322/1‑141 (MQ=255) ttGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTAcctcc‑‑t > 4:67774/1‑141 (MQ=255) ttttATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACatat < 1:480556/141‑1 (MQ=255) tttATTTTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACAtata > 2:407906/1‑141 (MQ=255) tttATTGTTTAT‑AATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATaa < 4:202480/141‑1 (MQ=255) ttATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATaa < 3:117646/141‑1 (MQ=255) ttATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATaa > 3:26424/1‑141 (MQ=255) gTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGACAAGCGCCATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTa > 1:644644/1‑141 (MQ=255) ttATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAATATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGc > 4:188696/1‑141 (MQ=255) tataAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCg > 2:880936/1‑141 (MQ=255) tataAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGAGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TATATCg > 2:855043/1‑141 (MQ=255) tatcctcattcaccagttaaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCgg > 1:151699‑M1/110‑141 (MQ=255) aaataaaACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGgag > 4:124756/1‑141 (MQ=255) tcattcaccagttaaagttgtcgttattctaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATa > 2:777578‑M1/105‑141 (MQ=255) aaaaCTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAg > 2:365467/1‑141 (MQ=255) aaaaCTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAg < 1:52122/141‑1 (MQ=255) aaaaCTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAg > 1:969208/1‑141 (MQ=255) aaaCTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGa > 2:734431/1‑141 (MQ=255) ttcaccagtttaagttgtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGAc > 3:222707‑M1/102‑141 (MQ=255) tCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCt < 2:156084/141‑1 (MQ=255) cACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCtt > 4:164509/1‑141 (MQ=255) aCTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTa > 1:367140/1‑141 (MQ=255) taataaTGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAata < 1:929927/141‑1 (MQ=255) aataatGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAatat > 2:49111/1‑141 (MQ=255) ataatGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGAAATTAAACTAGTTAATTTAAAAAAAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAataaa < 4:172700/141‑3 (MQ=255) actGTATTCATAACCTTCTTCGAGTACTTAATACTCTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTAAACTCGTTAATTTTCAACCAATACAAAAACAGTTCACCTCC‑‑TACCTATAAA‑TCTAGCGGAGATAGAAGCTTAAtatata > 2:256937/3‑141 (MQ=255) gTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATatttattt > 2:552069/1‑141 (MQ=255) ttttCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAtttattta > 2:259328/1‑141 (MQ=255) cATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTaaaaa > 3:121689/1‑141 (MQ=255) cATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACATCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTaaaaa > 1:1025061/1‑141 (MQ=255) aTAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAat > 1:397721/1‑141 (MQ=255) aaTCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAatta > 2:1006749/1‑141 (MQ=255) aTCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAattat > 3:75530/1‑141 (MQ=255) tcttctTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAattatt > 2:131519/1‑141 (MQ=255) tcttctTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAattatt < 1:746595/141‑1 (MQ=255) cttcttCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTAttt < 4:349003/141‑1 (MQ=255) ttcGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTaaa > 1:540306/1‑141 (MQ=255) gACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAacca < 2:21170/141‑1 (MQ=255) ctactTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAaccacc < 2:1078427/141‑1 (MQ=255) ctTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGaa > 2:957973/1‑141 (MQ=255) ctTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGATTAATATTTCTTAAAAAATGATTTTAAACCACCGaa > 2:213653/1‑141 (MQ=255) cTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATa < 3:291786/141‑1 (MQ=255) cTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATa > 2:132442/1‑141 (MQ=255) ttAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAAc > 2:588481/1‑141 (MQ=255) tAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACa > 2:876280/1‑141 (MQ=255) tAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACa > 2:525491/1‑141 (MQ=255) aaGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACAt < 1:295578/141‑1 (MQ=255) atTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACgg < 3:239925/141‑1 (MQ=255) atTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACgg < 1:1017170/141‑1 (MQ=255) ttCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACggg > 1:111879/1‑141 (MQ=255) ttCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TCTAGCGGAGATAGACGCTTAATATATATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGACATCCCATCACggg > 4:420413/1‑141 (MQ=255) gatgttattacatttggttgtttaaaataatttttaaataaatattAAGCGTATACATAC‑‑TACATATAAT‑TGTAGTTGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACggg > 2:900948‑M1/47‑141 (MQ=255) cGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCa > 1:418378/1‑141 (MQ=255) tGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAAt < 3:164761/141‑1 (MQ=255) gAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATc > 3:66245/1‑141 (MQ=255) aaaaGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCa < 3:335796/141‑1 (MQ=255) aaaGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCAAGGGCAATCAt < 1:610914/141‑1 (MQ=255) aaGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATa > 1:925050/1‑141 (MQ=255) agagACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATAGAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATAc < 2:954038/141‑1 (MQ=255) agaCANTACACTAGTTAATTTTCAAACATTACAAACTGCGTCTACCCCC‑‑TGAATATAAT‑GTAAGTGGAGATAAAGGGTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAAGGTCATAACATCACGGGCAATCATACtt < 1:317636/141‑1 (MQ=255) gaCATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGCATGTCATAACATCACGGGCAATCATACttt > 1:1033962/1‑141 (MQ=255) cATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTttct < 1:174306/141‑1 (MQ=255) cATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTttct < 1:904880/141‑1 (MQ=255) tACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCa > 3:49440/1‑141 (MQ=255) acacTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCAt > 3:402316/1‑141 (MQ=255) cacTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCGCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATc < 2:687115/141‑1 (MQ=255) cTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTg > 2:932359/1‑141 (MQ=255) aataatttttaaataaatattAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTAG‑‑GAGGTAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTgg < 3:280309‑M1/120‑1 (MQ=255) aTTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAAt > 1:519758/1‑141 (MQ=255) ttttCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATa < 1:85412/141‑1 (MQ=255) ttttCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATa < 2:1019978/141‑1 (MQ=255) ttCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAAc < 3:345960/141‑1 (MQ=255) tCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACg < 1:1018620/141‑1 (MQ=255) cAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGa < 1:206766/141‑1 (MQ=255) cAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGa < 2:946766/141‑1 (MQ=255) aaaCAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGAc < 1:882978/141‑1 (MQ=255) aaCAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACa < 2:893507/141‑1 (MQ=255) aaTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATGAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACt < 1:418087/141‑1 (MQ=255) aTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGACTGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACtt < 2:372557/141‑1 (MQ=255) aTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACtt > 3:163409/1‑141 (MQ=255) aTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACtt < 2:887566/141‑1 (MQ=255) cAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTaa < 3:449559/141‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAAc > 1:870291/1‑141 (MQ=255) aaaaGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACt > 1:611078/1‑141 (MQ=255) aaaaGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAC‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACt < 3:325009/141‑1 (MQ=255) | GCAACTTTCTGCACTTGGTTTTTTATTGTTTATAAATAAAACTCACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATATTTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACT > USA300TCH1516_ALE/1822725‑1823003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |