New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1822865 = | 129 (1.040) | 7 (0.060) | 7/240 | NT | 5.7% | intergenic (+186/+60) | USA300HOU_RS09070/ackA | Putative universal stress protein/Acetate kinase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1822909 = | 110 (0.950) | intergenic (+230/+16) | USA300HOU_RS09070/ackA | Putative universal stress protein/Acetate kinase |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
ACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTAAG > USA300TCH1516_ALE/1822769‑1823048 | aCTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTa > 3:95710/1‑141 (MQ=255) aCTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTa > 1:367140/1‑141 (MQ=255) cTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTaa > 1:930621/1‑141 (MQ=255) aataatGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAatat > 2:882978/1‑141 (MQ=255) aataatGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAatat > 2:49111/1‑141 (MQ=255) ataataATTTCATCATCTTCTTCGACTACTTAATTATTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAAtat‑t < 4:17022/141‑1 (MQ=255) atGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAAtat‑ttat < 2:241724/141‑1 (MQ=255) tGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAAtat‑ttatt > 1:1018992/1‑141 (MQ=255) gTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATat‑ttattt > 2:552069/1‑141 (MQ=255) ttttCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAt‑ttattta > 2:259328/1‑141 (MQ=255) tttCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTaa < 1:912371/141‑1 (MQ=255) ttCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTaaa < 3:372705/141‑1 (MQ=255) tCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTaaaa < 4:217812/141‑1 (MQ=255) gtcgttattccaacagatgaagaaagtatgattgcccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattaagcgtctacctcctacatataattgtagcggagatagacgcttAATAt‑ttattta < 2:374254‑M2/12‑1 (MQ=255) cATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACATCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTaaaaa > 1:1025061/1‑141 (MQ=255) aTAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAat < 1:205925/141‑1 (MQ=255) aaTCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAatta > 2:1006749/1‑141 (MQ=255) tcttctTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAattatt > 2:900766/1‑141 (MQ=255) cttcttCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTAttt < 4:349003/141‑1 (MQ=255) ttcGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTaaa > 1:540306/1‑141 (MQ=255) gACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAacca < 2:21170/141‑1 (MQ=255) ctTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGaa > 2:957973/1‑141 (MQ=255) aaTTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGt < 2:947523/141‑1 (MQ=255) cTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATa > 2:132442/1‑141 (MQ=255) cTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATa < 3:291786/141‑1 (MQ=255) tAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACa > 2:876280/1‑141 (MQ=255) tAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACa > 2:525491/1‑141 (MQ=255) tatTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACg < 2:1065772/141‑1 (MQ=255) cccgtgatgttatgacattcggtggtttaaaataatttttaaataaatattaagcgtctatctcaactacaattatatgtagtatgtatacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACAACCAAATGTAATAACATc > 2:900948‑M2/96‑141 (MQ=255) atTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACgg < 3:239925/141‑1 (MQ=255) atTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACgg < 1:1017170/141‑1 (MQ=255) ttCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TCTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑ATATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGACATCCCATCACggg > 4:420413/1‑141 (MQ=255) tGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAAt > 1:40704/1‑141 (MQ=255) tGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAAt < 2:671196/141‑1 (MQ=255) tGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAAt < 3:164761/141‑1 (MQ=255) gAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATc > 3:66245/1‑141 (MQ=255) aaaaGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCa < 3:335796/141‑1 (MQ=255) aaGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATa > 1:925050/1‑141 (MQ=255) agaCANTACACTAGTTAATTTTCAAACATTACAAACTGCGTCTACCCCC‑‑TGAATATAAT‑GTAAGTGGAGATAAAGGGTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAAGGTCATAACATCACGGGCAATCATACtt < 1:317636/141‑1 (MQ=255) aCATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTttc > 2:211032/1‑141 (MQ=255) cATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTttct < 1:624373/141‑1 (MQ=255) aTTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTttctt < 2:985509/141‑1 (MQ=255) ttACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTttcttc < 1:432685/141‑1 (MQ=255) acacTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCAt < 1:147804/141‑1 (MQ=255) acTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCt < 3:436484/141‑1 (MQ=255) cTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTg > 2:932359/1‑141 (MQ=255) ttAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTgg > 2:123265/1‑141 (MQ=255) aataatttttaaataaatattAAGCGTCTATCTCCGCTACA‑ATTATATGTAG‑‑GAGGTAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTgg < 3:280309‑M1/120‑1 (MQ=255) aTTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAAt > 1:519758/1‑141 (MQ=255) cAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGa < 1:206766/141‑1 (MQ=255) cAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGa < 2:946766/141‑1 (MQ=255) cAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGa > 3:297240/1‑141 (MQ=255) aaaCAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGAc < 1:882978/141‑1 (MQ=255) aaCAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACa < 2:893507/141‑1 (MQ=255) aaTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATGAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACt < 1:418087/141‑1 (MQ=255) aaTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCAt > 1:54002/1‑92 (MQ=255) aTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGACTGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACtt < 2:372557/141‑1 (MQ=255) aTACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACtt > 3:163409/1‑141 (MQ=255) cAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTaa < 3:449559/141‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAAc > 1:870291/1‑141 (MQ=255) aaaaGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACt > 1:611078/1‑141 (MQ=255) AGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGt < 2:972372‑M1/141‑1 (MQ=255) AGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGt < 1:633256‑M1/141‑1 (MQ=255) CGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGa > 1:696123‑M1/1‑141 (MQ=255) GTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGaa > 1:750456‑M1/1‑141 (MQ=255) TCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTggtggat < 1:1048031‑M1/141‑4 (MQ=255) TCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAAt > 1:1017090‑M1/1‑141 (MQ=255) TCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAAt > 1:957973‑M1/1‑141 (MQ=255) CTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATg > 2:128317‑M1/1‑141 (MQ=255) CTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTCAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATg < 1:785033‑M1/141‑1 (MQ=255) gtctatctccgctacaattatatgtaggaggtagacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTAAACTGGTGaa > 3:222707‑M2/41‑141 (MQ=255) TACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAGCATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGa < 2:573226‑M1/141‑1 (MQ=255) TACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGa < 2:526488‑M1/141‑1 (MQ=255) tatctccgctacaattatatgtaggaggtagacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTAGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGa > 2:777578‑M2/38‑141 (MQ=255) ctcc‑‑tACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGa < 4:297250/141‑1 (MQ=255) tcc‑‑tACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGAt > 2:414580/1‑141 (MQ=255) c‑‑tACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAg > 3:387061/1‑141 (MQ=255) ccgctacaattatatgtaggaggtagacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATa > 1:151699‑M2/33‑141 (MQ=255) tACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGt < 1:980197/141‑1 (MQ=255) cgctacaattatatgtaggaggtagacgcttTTTGTATTGTTTGAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATa > 2:137449‑M2/32‑141 (MQ=255) atatAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTtaa < 2:366310/141‑1 (MQ=255) tataAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTtaat > 2:779158/1‑141 (MQ=255) ataAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTtaata > 1:88126/1‑141 (MQ=255) ataAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTtaata < 1:182124/141‑1 (MQ=255) taAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTtaataa > 1:174592/1‑141 (MQ=255) t‑tGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATc < 2:257834/141‑1 (MQ=255) t‑tGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATc < 3:67774/141‑1 (MQ=255) tGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATcc > 3:22684/1‑141 (MQ=255) gTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCct > 2:474870/1‑141 (MQ=255) aGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAAGGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCcttc < 1:932359/141‑1 (MQ=255) aGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCcttc < 2:1025061/141‑1 (MQ=255) aGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCcttc > 1:725986/1‑141 (MQ=255) agaTAGACGCTTAATAT‑GTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTAc < 1:874449/141‑1 (MQ=255) gacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACgt < 1:550169‑M2/134‑1 (MQ=255) gacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACgt > 1:1042128‑M2/8‑141 (MQ=255) gacgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACgt > 1:545372‑M2/8‑141 (MQ=255) acgcttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACgta > 3:337471‑M2/7‑141 (MQ=255) cttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACgtagta > 2:637287‑M2/4‑141 (MQ=255) ttAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTaa > 4:230595‑M2/3‑141 (MQ=255) tAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTAAg > 1:943766‑M2/2‑141 (MQ=255) | ACTTAATAATGTTTTCATAATCTTCTTCGACTACTTAATTCTTTAAGATATTCGTGAAAAGAGACATTACACTAGTTAATTTTCAAACAATACAAAAAGCGTCTACCTCC‑‑TACATATAAT‑TGTAGCGGAGATAGACGCTTAATAT‑TTATTTAAAAATTATTTTAAACCACCGAATGTCATAACATCACGGGCAATCATACTTTCTTCATCTGTTGGAATAACGACAACTTTAACTGGTGAATGAGGATAGTTAATAAATCCTTCTTTACCACGTAGTAAG > USA300TCH1516_ALE/1822769‑1823048 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |