| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CACAATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCTT > USA300TCH1516_ALE/2716602‑2716882 | cacaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACa > 2:670310/1‑141 (MQ=255)cacaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACa > 1:279922/1‑141 (MQ=255)aaagtgaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacaataagccaagggttttatggagcaaggttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaattaaattctcaaaaaaaaaaaaaaa > 4:146106‑M1/141‑141 (MQ=255) aagtgaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaaa > 2:439298‑M1/140‑141 (MQ=255) 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2:470294/141‑1 (MQ=255) gTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAAACACTAATGTGTCGCACAATGGTGCACATTACGATTCCTATCTGCATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTaa < 3:269801/141‑1 (MQ=255) gACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTc > 1:705638/1‑141 (MQ=255) cTCATAAACAAAGCCAATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCACTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATGGTGTCCAt < 2:191528/141‑1 (MQ=255) tcctAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGTTTCCTCCCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCCGACCAAAAAATTAACATGGTGTCCATc > 4:91145/4‑141 (MQ=255) tCATAGACAAAGCCCGTTCTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTTTCCATc > 4:91140/1‑141 (MQ=255) 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2:1029671‑M1/141‑1 (MQ=255) | CACAATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCTT > USA300TCH1516_ALE/2716602‑2716882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |