| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1205323 | 119 (0.960) | 50 (0.570) +AGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAG |
11/182 | NT | 37.7% | intergenic (‑204/‑365) | USA300HOU_RS15290/lspA | hypothetical protein/Lipoprotein signal peptidase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2478252 = | 115 (0.920) | intergenic (+139/‑436) | USA300HOU_RS12760/USA300HOU_RS12765 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TCCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTC > USA300TCH1516_ALE/2478114‑2478392 | ccACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAca > 2:255001/1‑141 (MQ=255) agaaacaaccTATAATAATAGTTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAcagc > 2:520511/3‑141 (MQ=255) caaacaaaCTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAcagca > 1:623807/1‑141 (MQ=255) caaacaaaCTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAcagca > 3:97225/1‑141 (MQ=255) caaacaaaCTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAcagca > 2:862603/1‑141 (MQ=255) aaaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagca > 1:439711‑M2/135‑141 (MQ=255) aaaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagca > 1:204193‑M2/135‑141 (MQ=255) aaaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcccgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagca > 3:371828‑M2/135‑141 (MQ=255) aaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagcag > 1:1067824‑M2/134‑141 (MQ=255) aaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagcag > 4:288567‑M2/134‑141 (MQ=255) aaacaaacTATTATTATAGGTAGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAcagcaa > 2:372522/1‑140 (MQ=255) aagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGt > 2:841826‑M2/133‑141 (MQ=255) aagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGt > 3:192550‑M2/133‑141 (MQ=255) agtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTa > 1:893813‑M2/132‑141 (MQ=255) agtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTa < 3:201421‑M2/10‑1 (MQ=255) gtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTaa < 1:907819‑M2/11‑1 (MQ=255) gtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTaa > 2:898650‑M2/131‑141 (MQ=255) gtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTaa < 2:432538‑M2/11‑1 (MQ=255) gtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaaggattgtataaatagagAACAGCAGTaa > 2:1055992‑M2/131‑141 (MQ=255) taaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAg < 3:411688‑M2/12‑1 (MQ=255) aaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGa > 1:347132‑M2/129‑141 (MQ=255) aaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGAt < 1:532987‑M2/14‑1 (MQ=255) aaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGAt > 2:972114‑M2/128‑141 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATa > 3:406842/1‑141 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATa > 1:803596/1‑141 (MQ=255) aattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGATa > 1:825850‑M2/127‑141 (MQ=255) aattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGATa > 2:952122‑M2/127‑141 (MQ=255) tattattatAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATaa < 2:1525/141‑1 (MQ=255) gttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGATAATTTTCaa < 1:3638‑M2/23‑1 (MQ=255) aGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAAtt > 2:769918/1‑141 (MQ=255) ggTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTACTCCTTGATCAGACCATTGTTATATTGAACATAAATAAACTAAATAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTa < 1:647307/141‑1 (MQ=39) tacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtagtgtataaatagagAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCAATTAGaa < 4:125375‑M2/28‑1 (MQ=255) gttTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTGAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGaaa > 1:845991/1‑141 (MQ=255) tttCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAAAAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACAATAAAAAAAAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGaaaa < 2:201834/141‑1 (MQ=38) tctCTAATACTGCGTCAAAATATCTTTAAATATTCGTTACAACTTGATTAGACAATTGTTATATAGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATACATAAAAAAAACAGCAGTACGTTAATTTTCAATTAGaaaa < 2:635214/139‑1 (MQ=255) ggagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGaaaa < 2:602662‑M2/31‑1 (MQ=255) 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1:816118/1‑141 (MQ=255) atTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGATATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTTGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTAc < 2:474608/141‑1 (MQ=255) cGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTActgct > 1:471777/1‑141 (MQ=255) tCAAACTCTCTTGAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTAGTACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGt < 2:591871/141‑1 (MQ=255) tCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCAATAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGt < 2:5039/141‑1 (MQ=255) cAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGtt < 2:1012941/141‑1 (MQ=255) 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cTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTAttt > 2:382782/1‑141 (MQ=255) aaTATTCGTTAATCCTTGATTAGATAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGTACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACa < 1:754193/141‑1 (MQ=255) atatTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACaa > 1:91479/1‑141 (MQ=255) gccagtcgaagaccaaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACtt < 3:68874‑M2/65‑1 (MQ=255) ttAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCg > 2:173267/1‑141 (MQ=255) aaTCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTa > 2:769936/1‑141 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(MQ=255) aaaaaTAAATAAACTAAAGAGTATGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCTTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTgg < 4:358720/140‑1 (MQ=255) aaataaatAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGca > 1:379344/1‑141 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTa > 3:243626/1‑141 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTa > 2:653620/1‑141 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTa > 4:281726/1‑141 (MQ=255) ataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTAc < 4:32177/141‑1 (MQ=255) cTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaa > 3:357943/1‑141 (MQ=255) cTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaa > 2:1041949/1‑141 (MQ=255) tAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaaa > 1:821746/1‑141 (MQ=255) aaaGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaaaa < 2:309819/141‑1 (MQ=255) agagTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAAtt > 1:110481/1‑141 (MQ=255) gTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCta > 1:206573/1‑141 (MQ=255) cTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCtata < 4:75990/141‑1 (MQ=255) gggACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATaaa < 1:312256/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 1:656512/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 1:1003636/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 2:439634/141‑1 (MQ=255) gACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATa < 1:727281/141‑1 (MQ=255) aCATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAg < 4:362161/141‑1 (MQ=255) aTCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAtttt < 3:154906/141‑1 (MQ=255) tCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttttt > 1:488343/1‑141 (MQ=255) tCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttttt > 2:1021872/1‑141 (MQ=255) tAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgatg > 2:487419/1‑141 (MQ=40) aaaCAGCTGTAAGCTAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTGTTTATACAATACTTCGTATTGCATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTCCTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGt < 2:148246/141‑1 (MQ=11) | TCCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTC > USA300TCH1516_ALE/2478114‑2478392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |