New junction evidence | |||||||||||
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? | USA300TCH1516_ALE | 1575710 = | 102 (0.850) | coding (1807/6201 nt) | USA300HOU_RS07705 | Glycyl‑glycine endopeptidase ALE‑1 |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTATTGT > USA300TCH1516_ALE/1575570‑1575848 | ccAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgag > 4:240246/1‑141 (MQ=255) ccAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgag > 1:236015/1‑141 (MQ=255) ccAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgag > 1:775345/1‑141 (MQ=255) cAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgaga > 3:208002/1‑141 (MQ=255) 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cATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATctgctg < 4:48984/141‑1 (MQ=255) tCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAAGCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTgctgct > 3:348853/1‑141 (MQ=255) cAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCtt < 1:707412/141‑1 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt < 1:105198/141‑1 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt > 1:738669/1‑141 (MQ=255) tttGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCACATCTGCTGCTTTTTTACtt < 1:87324/141‑1 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3:298683/1‑141 (MQ=255) cACCTCATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAACTCCGCTGCATATTTACCTCCGACATTGAAACTTTTTGCGGTTTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCAc < 1:377158/141‑1 (MQ=255) cACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCAc < 1:153063/141‑1 (MQ=255) tggaacaattaggtggcgcttttgaGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACtt > 1:1064285‑M2/26‑141 (MQ=255) tggaacaattaggtggcgcttttgaGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACtt > 1:1064118‑M2/26‑141 (MQ=255) ccTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACtt > 2:852097/1‑141 (MQ=255) tAATCGTTCCAGAGCGCCTTTGAGAGTATCTTTCATCCACTCGGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGCCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTtgc < 2:625776/141‑1 (MQ=255) aaTTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTtgct < 1:790493/141‑1 (MQ=255) aTTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTtactg < 2:201041/141‑1 (MQ=255) tGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTgctgct > 1:569416/1‑141 (MQ=255) ttCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCCTTAAGGATTTACTATAGCTATTAACTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTc > 4:14169/1‑141 (MQ=255) cAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGt > 2:999356/1‑141 (MQ=255) agagCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTa < 2:806780/141‑1 (MQ=255) gcgcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCa < 1:358425/141‑1 (MQ=255) gcgcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCa < 2:898176/141‑1 (MQ=255) gcgcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCa < 3:162609/141‑1 (MQ=255) gcCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAAc < 2:165646/141‑1 (MQ=255) ccTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGTCTAAAAATTCACTTGCTGCTTCATNTCCAACt > 2:813118/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTTTTTTTGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTa > 4:194452/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTa < 4:358680/141‑1 (MQ=255) ttgaGATTATCTTTCATCAACTCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTAtt > 2:483365‑M2/5‑141 (MQ=255) ttgaGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTAtt > 1:924918‑M2/5‑141 (MQ=255) gaGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTATTGt < 2:931579‑M2/139‑1 (MQ=255) | CCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCTAAAAATCCACTTGCTGCTTCAGTACCAACTATTGT > USA300TCH1516_ALE/1575570‑1575848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |