New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1838254 = | 133 (1.070) | 6 (0.050) | 6/238 | NT | 5.1% | intergenic (‑58/+49) | gph_2/nagE | Phosphoglycolate phosphatase/PTS system N‑acetylglucosamine‑specific EIICBA component |
? | USA300TCH1516_ALE | 1838290 = | 100 (0.870) | intergenic (‑94/+13) | gph_2/nagE | Phosphoglycolate phosphatase/PTS system N‑acetylglucosamine‑specific EIICBA component |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTCACTTAAAAAAACGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATCAATAA > USA300TCH1516_ALE/1838152‑1838430 | tcACTTAAAAAAACGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCt > 4:389337/1‑141 (MQ=255) cACTTAAAAAAACGCCATCAACATCAGATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTg < 4:18720/141‑1 (MQ=255) cACTTAAAAAAACGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTg > 2:176363/1‑141 (MQ=255) tAAAAAAACGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTTAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTa < 2:584311/141‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAAt > 2:801570/1‑141 (MQ=255) aaaaaCGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATAAAAATCATAATACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAGACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTaact < 2:57551/141‑3 (MQ=255) aaatgCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAAttt > 2:986000/5‑141 (MQ=255) aaCGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAAtttt > 1:721288/1‑141 (MQ=255) aaCGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAAtttt > 2:211964/1‑141 (MQ=255) aCGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAA‑CCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTta‑t > 3:246258/1‑141 (MQ=255) cGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTta‑t < 1:686862/141‑1 (MQ=255) cGCCATCAAAATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTta‑t > 1:957039/1‑141 (MQ=255) gCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTta‑ta < 4:115692/141‑1 (MQ=255) gCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTta‑ta < 4:236323/141‑1 (MQ=255) gCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTta‑ta < 1:799783/141‑1 (MQ=255) ccATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑Taa < 3:444418/141‑1 (MQ=255) catcaacatcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑Taaa > 2:379056/1‑141 (MQ=255) catcaacatcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑Taaa > 1:616153/1‑141 (MQ=255) atcaacatcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAAt > 1:133467/1‑141 (MQ=255) atcaacatcaaATAAAACTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAAt > 2:729468/1‑141 (MQ=255) cattcaactcaagttattgtcggtacacacgtacagcaggttgctgatgaaattgaaaaacatttataaaatttaaacagctaaagcgcaaaccctattgaagttagatttgcgctttAGCTGTTTAAATTTta‑ta < 3:360612‑M2/18‑1 (MQ=255) cattcaactcaagttattgtcggtacacacgtacagcaggttgctgatgaaattgaaaaacatttataaaatttaaacagctaaagcgcaaaccctattgaagttagatttgcgctttAGCTGTTTAAATTTta‑ta > 4:360612‑M2/119‑136 (MQ=255) acatcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGttt < 2:602895/141‑1 (MQ=255) acatcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGttt < 4:315634/141‑1 (MQ=255) acatcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGttt < 1:690442/141‑1 (MQ=255) catcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGtttt < 3:59673/141‑1 (MQ=255) atcaaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGttttt > 2:508001/1‑141 (MQ=255) caaATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCa < 4:274249/141‑1 (MQ=255) tAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAAttt > 1:582357/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAAttt < 2:226002/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTtc > 3:32567/1‑141 (MQ=255) aaaaTTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTtc < 1:365502/141‑1 (MQ=255) tttCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAg < 3:256027/141‑1 (MQ=255) tcttcACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCa > 1:108705/1‑141 (MQ=255) cttcACACGCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCaa < 1:853608/141‑1 (MQ=255) cacaATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACct < 2:1082796/141‑1 (MQ=255) caATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACctgc < 1:829275/141‑1 (MQ=255) caATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACctgc < 1:657203/141‑1 (MQ=255) ccACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACctgc < 1:279168/135‑1 (MQ=255) ccACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACctgc > 2:279168/1‑135 (MQ=255) ccACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACg > 2:848302/1‑141 (MQ=255) ccACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACg > 4:249249/1‑141 (MQ=255) cACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACgt < 4:32567/141‑1 (MQ=255) aCTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACgtg < 1:461425/141‑1 (MQ=255) tCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAAAGAAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACgtgtg > 2:762370/1‑141 (MQ=255) aTTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTAGCGATTTAGAAGATTAAATTTAA‑CAAATGTTTTATAATTTCATCAGCAATTTGATGTACGTGTGTAc > 1:914791/1‑141 (MQ=255) tttCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTAcc > 2:979065/1‑141 (MQ=255) cTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGAc < 1:886684/141‑1 (MQ=255) cTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGAc > 4:427156/1‑141 (MQ=255) tGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACa < 2:871243/141‑1 (MQ=255) aaTTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATaa > 1:731621/1‑141 (MQ=255) aTTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAAc < 2:721288/141‑1 (MQ=255) tCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACtt < 4:391000/141‑1 (MQ=255) cAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTg < 4:418757/141‑1 (MQ=255) aGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGa > 1:773874/1‑141 (MQ=255) aGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGa > 2:245175/1‑141 (MQ=255) ataAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTg < 1:229764/141‑1 (MQ=255) aaTCAGTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAAt < 3:10511/141‑1 (MQ=255) cactCTACTCTGTGACTACAGAAAGCGCATACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTCTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAGATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGtt < 2:670710/138‑1 (MQ=255) ttCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTg < 4:61796/141‑1 (MQ=255) ttCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCGTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTg < 2:260555/141‑1 (MQ=255) tataaaatttaaacagctAAAGCGCAAATCTAACTTCAA‑TAGGGTTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATg < 3:360612‑M1/118‑1 (MQ=255) tataaaatttaaacagctAAAGCGCAAATCTAACTTCAA‑TAGGGTTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATg > 4:360612‑M1/19‑136 (MQ=255) tactaTTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCa > 3:23540/1‑141 (MQ=255) atttaaacagctaaagcgcaaatctaacttcaatagggtttgcgctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTaa > 1:843759‑M2/49‑141 (MQ=255) aCTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTa > 1:210489/1‑141 (MQ=255) aCTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTa > 2:348314/1‑141 (MQ=255) cTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTaa > 2:946983/1‑141 (MQ=255) tAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAac > 2:225327/1‑141 (MQ=255) GCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTGGCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTg > 1:267681‑M1/1‑141 (MQ=255) CGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGc < 4:307681‑M1/141‑1 (MQ=255) CGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGc < 3:149060‑M1/141‑1 (MQ=255) CGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGc < 3:23735‑M1/141‑1 (MQ=255) CGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGc < 1:642629‑M1/141‑1 (MQ=255) CGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTCTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGc < 2:431935‑M1/141‑1 (MQ=255) cgcaaatctaacttcaatagggtttgcgctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGc > 1:978546‑M2/33‑141 (MQ=255) GCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCa > 2:108705‑M1/1‑141 (MQ=255) GCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCa > 2:292922‑M1/1‑141 (MQ=255) CAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCAc < 2:1057849‑M1/141‑1 (MQ=255) CAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCAc < 1:566117‑M1/141‑1 (MQ=255) CAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCAc < 1:592176‑M1/141‑1 (MQ=255) AACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAAGAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCg > 2:17145‑M1/1‑141 (MQ=255) cccTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGc < 1:1058858/141‑1 (MQ=255) ccTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCg < 2:541085/141‑1 (MQ=255) a‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑CAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGttt > 1:574447/1‑141 (MQ=255) tGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGttttt < 1:986000/141‑1 (MQ=255) gAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTa < 2:415128/141‑1 (MQ=255) ttAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAAtct < 1:827535/141‑1 (MQ=255) ttAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAAtct < 2:631210/141‑1 (MQ=255) tAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAAtctt < 2:125722/141‑1 (MQ=255) gATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAAtcttct < 1:775411/141‑1 (MQ=255) gATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAAtcttct > 2:389919/1‑141 (MQ=255) ttgcgctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGtt < 3:152999‑M2/132‑1 (MQ=255) cgctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTAt < 1:60309‑M2/135‑1 (MQ=255) cgctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTAt < 1:992944‑M2/135‑1 (MQ=255) gctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATc < 1:886421‑M2/136‑1 (MQ=255) ctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATCa < 1:502314‑M2/137‑1 (MQ=255) ctttAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATCa < 3:262057‑M2/137‑1 (MQ=255) aGCTGTTTAAATTTTATTAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATCaata > 3:137920/1‑141 (MQ=255) aGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATCaataa > 3:111701/1‑141 (MQ=255) | TTCACTTAAAAAAACGCCATCAACATCAAATAAAATTTTCTTCACAATCCCCACTCCATTTCTGAAAATTCAGATATAAATCATTCTACTATTTGACTAAAAAAAGCGCAAACCCTA‑TTGAAGTTAGATTTGCGCTTTAGCTGTTTAAATTTTA‑TAAATGTTTTTCAATTTCATCAGCAACCTGCTGTACGTGTGTACCGACAATAACTTGAGTTGAATGTTTGCCATTAACAGTAACACCAACTGCACCGGCGTTTTTAATCTTCTGTTTATCAATAA > USA300TCH1516_ALE/1838152‑1838430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |