New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
ACTGTGTTACGCGGTTGCAAACCGTACTATGTTGAAAACGGCGCATTTTCAGGTGCTATTGGTGCATTATATTTAGAAAAATAGAAAAAGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAGTTTTTAAAT > USA300TCH1516_ALE/2248123‑2248403 | aCTGTGTTACGCGGTTGCAAACCGTACTATGTTGAAAACGGCGCATTTTCAGGTGCTATTGGTGCATTATATTTAGAAAAATAGAAACAGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCtttta > 2:246145/1‑141 (MQ=255) tgtgTTACGCGGTTGCAAACCGTACTATGTTGAAAACGGCGCATTTTCAGGTGCTATTGGTGCATTATATTTAGAAAAATAGAAAAAGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCttttatt < 1:463127/141‑1 (MQ=255) tgtTACGCGGTTGCAAACCGTACTATGTTGAAAACGGCGCATTTTCAGGTGCTATTGGTGCATTATATTTAGAAAAATAGAAAAAGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCttttatttt < 1:665490/141‑1 (MQ=255) attttaattgaattgagttgtaagtaattaagtgataataaatggaacaatacgtattcaaaacacttagaccataaaataaaaggccatttatatagcgtttatttaaaacaacgcgcatataaatggtcttttatttta < 2:761794‑M2/6‑1 (MQ=255) 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aaatagaaaaaGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAATCACTAGATAAGTTGCGGTGTATGTTAGTGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTaaaa < 1:915504/141‑1 (MQ=255) tagaaaaaGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAATTGTCCTTCTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTACATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCATTTaaattct > 2:771699/1‑137 (MQ=255) tagaaaaaGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGt > 2:238096/1‑141 (MQ=255) tagaaaaaGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGt > 4:327598/1‑141 (MQ=255) agaaaaaGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTACGTGTTTTGGAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGt < 3:160679/141‑1 (MQ=255) aaaaaGACCATTTATATACGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTAATGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAg < 3:962/141‑1 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tataAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTaccaacca > 3:279920/1‑141 (MQ=255) ataAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCAc > 3:39191/1‑141 (MQ=255) ataAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCAc < 4:8782/141‑1 (MQ=255) taAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACg < 3:271904/141‑1 (MQ=255) aaTGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGcc < 4:259115/141‑1 (MQ=255) aaTGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGcc < 3:202904/141‑1 (MQ=255) aaTGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGcc < 1:498512/141‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAACCAATTGTACCAACCACGCCAg < 1:21212/141‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAg > 4:214990/1‑141 (MQ=255) ggCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAGt > 3:146377/1‑141 (MQ=255) ttttATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAGttttt < 2:927870‑M2/137‑1 (MQ=255) tATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAGTTTTTaaa > 1:732304‑M2/2‑141 (MQ=255) attttatGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAGTTTTTAAAt > 2:614979/1‑141 (MQ=255) | ACTGTGTTACGCGGTTGCAAACCGTACTATGTTGAAAACGGCGCATTTTCAGGTGCTATTGGTGCATTATATTTAGAAAAATAGAAAAAGACCATTTATATGCGCGTTGTTTTAAATAAACGCTATATAAATGGCCTTTTATTTTATGGTCTAAGTGTTTT‑GAATACGTATTGTTCCATTTATTATCACTTAATTACTTACAACTCAATTCAATTAAAATGTAAGTTCATTAGACAATTTTTGCGCTGAAACAATTGTACCAACCACGCCAGTTTTTAAAT > USA300TCH1516_ALE/2248123‑2248403 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |