New junction evidence | |||||||||||
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tttcaggttaGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATttg < 1:1087025‑M2/131‑1 (MQ=255) caggttaGTGTAATGTAAAGGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAAAATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTCTTACTTTCTTCTCATCTCGCAAtttgttc > 4:61632‑M2/8‑140 (MQ=255) aggttaGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTtgttgt > 1:661737‑M2/7‑141 (MQ=255) ggttaGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTgttgtt < 1:581929‑M2/136‑1 (MQ=255) ggttaGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTgttgtt > 1:220262‑M2/6‑141 (MQ=255) gttaGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGttt > 3:221669‑M2/5‑141 (MQ=255) ttaGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGTTTa < 1:199405‑M2/138‑1 (MQ=255) aGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTTGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGTTTatt > 4:191432‑M2/2‑140 (MQ=255) aGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGTTTATc < 2:410258‑M2/140‑1 (MQ=255) aGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGTTTATc < 2:674716‑M2/140‑1 (MQ=255) gtgtAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGTTTAtct < 1:1003444/141‑1 (MQ=255) | ATTAATTATCTAATTATAACCTTAGTTACGTTATTACATAATATAAAAATATATAATAACTTATTTGCTTGCTCCTTTCACTTTTTAAGAGTAAAAAATAACCTGAAACATAGACTTTAACATCCAAGTTTCAGGTTAGTGTAATGTAAATGATTTACTTTGTTATATTATGATTAAACATCTAATTCTCTGCTTGTAAGTGCTTTAATCATCTCTGGATCAGCATGTGAGAAAAATTGGCTATTACTTTCTTCTAATGTCGCAATTTGTTGTTTATCT > USA300TCH1516_ALE/2336327‑2336605 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |