New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 602 total aligned reads displayed.
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g‑ACATTAGTGTTGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCt > 1:52278/1‑141 (MQ=255) aCATTAGTGTTGACTAATG‑TCTGTTTTGTAGATATTTTATAAAAAAGTACTGTGTTCTATGAAGAACACATCCTATCTGCATTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCtt < 2:400308/141‑1 (MQ=255) ttAGTGTTGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGt < 1:255221/141‑1 (MQ=255) gtgtTGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAATACAGTACAGCTTTGTATg > 2:123239/1‑141 (MQ=255) gtgtTGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATg > 1:353849/1‑141 (MQ=255) tgtTGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGa > 1:348796/1‑141 (MQ=255) ttGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACACATCATATATGTATTGTAACACACTTTTAAGTAATTCAATATATTGTGTCACAAAAATACGACAGTACAGCTTTGTATGata > 1:389780/1‑141 (MQ=255) gACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTTAACTGACGTAGGCAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATc > 1:95574/1‑141 (MQ=37) | AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG‑ACATTAGTGTTGACTAATG‑TCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATC > NC_012417/861‑1141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |