New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
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1:1414961/1‑141 (MQ=255) c‑TTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCCTCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAGTCTTTATTTAAATTGGCTTATGTTCTTGGa > 4:456437/1‑141 (MQ=255) c‑TTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAGTCTTTATTTAAATTGGATTATGTTATTGGa < 4:331227/141‑1 (MQ=255) | AGTAAACTATTAATCTTATTAAAGGTCTCTAGGAAGAAAAAATTTCATGCGATGAGATTGTTTTAGAAAAAGCGACGATATATATAATCTAACAATAATTTTTAAAATATTAAGAACCCCCAGCATATGCTTTATATAGC‑TTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAGTCTTTATTTAAATTGGATTATGTTATTGGA > USA300TCH1516_ALE/2057263‑2057542 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |