| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1279936 = | 101 (1.030) | 16 (0.240) +TTTGAAAATTATACGCAATATTAAC |
6/110 | NT | 18.5% | intergenic (+29/‑233) | cdsA/USA300HOU_RS06360 | Phosphatidate cytidylyltransferase/Putative zinc metalloprotease |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1279975 = | 104 (1.060) | intergenic (+68/‑194) | cdsA/USA300HOU_RS06360 | Phosphatidate cytidylyltransferase/Putative zinc metalloprotease | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ACCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTT > USA300TCH1516_ALE/1279846‑1280026 | aCCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAaga < 1:203481/91‑1 (MQ=255)aCCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAaga > 1:2947808/1‑91 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag < 1:395051/91‑1 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAAGGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag < 1:107772/91‑1 (MQ=255) gATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACACATCAATAAACGTAAAgagga > 1:1514654/1‑91 (MQ=255) gATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagga > 1:3032314/1‑91 (MQ=255) gATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagga > 1:1698931/1‑91 (MQ=255) taattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAg > 1:3010214‑M1/87‑91 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt < 1:3086836‑M1/6‑1 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 1:3610334‑M1/86‑91 (MQ=255) aatttgcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 1:2153239‑M1/86‑91 (MQ=255) ttGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGtt > 1:708224/1‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGtt < 1:3250820‑M1/7‑1 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGtt > 1:1714474‑M1/85‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGtt > 1:2696282‑M1/85‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGtt > 1:608438‑M1/85‑91 (MQ=255) tGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTg > 1:1573671/1‑91 (MQ=255) tGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTg < 1:373835/91‑1 (MQ=255) gACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGc > 1:3818701/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCt > 1:300165/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCt > 1:3146276/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCt > 1:3903772/1‑91 (MQ=255) cAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTg > 1:3278155/1‑91 (MQ=255) aGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTga > 1:505122/1‑91 (MQ=255) tttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGAt > 1:2393071/1‑91 (MQ=255) tttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGAt > 1:637380/1‑91 (MQ=255) agttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGAt > 1:397282‑M1/77‑91 (MQ=255) ttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATa < 1:2428554/91‑1 (MQ=255) ttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATa < 1:2434214/91‑1 (MQ=255) tATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATaa < 1:797911/91‑1 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAGTAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt > 1:3323754/1‑91 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt < 1:3601635/91‑1 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt > 1:270809/1‑91 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt > 1:1161218/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTaa < 1:1751518/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTaa < 1:3718550/91‑1 (MQ=255) tgtgTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAAt > 1:1458545/1‑91 (MQ=255) tgtgTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAAt < 1:427700/91‑1 (MQ=255) gtgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGTACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGAGAATTTAATg > 1:147801/1‑91 (MQ=255) gtgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATg > 1:2532957/1‑91 (MQ=255) gtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAt > 1:1142878‑M1/65‑91 (MQ=255) gtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAt > 1:2438639‑M1/65‑91 (MQ=255) aCCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAAGAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtct < 1:4147297/91‑1 (MQ=255) aCCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtct > 1:698707/1‑91 (MQ=255) aCCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtct > 1:3435965/1‑91 (MQ=255) ccATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtctc > 1:916252/1‑91 (MQ=255) ccATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtctc > 1:916219/1‑91 (MQ=255) cATTCTTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCa > 1:3281084/1‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAg > 1:3809960‑M1/60‑91 (MQ=255) attattAAATATTGTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAGTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAg < 1:4148886/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa < 1:918143/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa > 1:2829244/1‑91 (MQ=255) ttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAAc > 1:2937138‑M1/57‑91 (MQ=255) ttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAAc > 1:1486430‑M1/57‑91 (MQ=255) ttaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTGAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCCGAACt > 1:3864447/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTcc > 1:3844240/1‑91 (MQ=255) aaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCt > 1:2076626/1‑91 (MQ=255) aaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCt > 1:2827963/1‑91 (MQ=255) atatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtt < 1:329726/91‑1 (MQ=255) atatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtt > 1:391926/1‑91 (MQ=255) tatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCttt > 1:1342755/1‑91 (MQ=255) ttattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaa > 1:3396759/1‑91 (MQ=255) ttattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaa > 1:1975237/1‑91 (MQ=255) tattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaaa < 1:3706225/91‑1 (MQ=255) attaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaaaa > 1:270304/1‑91 (MQ=255) ttaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAAt > 1:2223513/1‑91 (MQ=255) tACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATtata < 1:356230/91‑1 (MQ=255) aCAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATAc > 1:8864/1‑91 (MQ=255) aCAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATAc < 1:680628/91‑1 (MQ=255) cAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACg < 1:3906605/91‑1 (MQ=255) aaTCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTACACGc > 1:3459989/1‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCaa > 1:4099149‑M1/35‑91 (MQ=255) ttAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAata > 1:366691/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 1:3247566/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 1:3738429/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 1:3453839/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 1:1983896/1‑91 (MQ=255) aTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 1:2921841/1‑91 (MQ=255) tGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTaa < 1:4019417/91‑1 (MQ=255) tGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTaa > 1:390017/1‑91 (MQ=255) gCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAAc > 1:398816/1‑91 (MQ=255) cTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATAGGCAATATTAACt < 1:3203860/91‑1 (MQ=255) cTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACt < 1:878658/91‑1 (MQ=255) cTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTAAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACt < 1:350205/91‑1 (MQ=255) aCAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCAGAGATAATTTAATGAATTTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGaaa > 1:3063910/1‑91 (MQ=255) aaTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAAtt < 1:2693450/91‑1 (MQ=255) aaTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAAtt < 1:2693451/91‑1 (MQ=255) aaTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAAtt > 1:329818/1‑91 (MQ=255) cAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATtata < 1:190343/91‑1 (MQ=255) aaTAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATAc > 1:1875446/1‑91 (MQ=255) aTAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACg < 1:1863086/91‑1 (MQ=255) aTAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACg > 1:3840688/1‑91 (MQ=255) aCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAat < 1:589418/91‑1 (MQ=255) aCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAat < 1:590815/91‑1 (MQ=255) cGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAata > 1:152580/1‑91 (MQ=255) cGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAata < 1:687962/91‑1 (MQ=255) cGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAata > 1:2729295/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 1:3120573/1‑91 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt < 1:2367544/91‑1 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 1:206743/1‑91 (MQ=255) | ACCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTT > USA300TCH1516_ALE/1279846‑1280026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |