New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1392266 = | 121 (1.230) | 11 (0.130) | 9/140 | NT | 10.1% | intergenic (+40/‑460) | alsT/glcT | Amino‑acid carrier protein AlsT/GlcA/glcB genes antiterminator |
? | USA300TCH1516_ALE | 1392308 = | 90 (1.050) | intergenic (+82/‑418) | alsT/glcT | Amino‑acid carrier protein AlsT/GlcA/glcB genes antiterminator |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TTTGGAATTAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAG > USA300TCH1516_ALE/1392176‑1392356 | tttGGAATTAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATa < 1:432037/91‑1 (MQ=255) aaataaatctcaaccttactatattaatatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaaa > 1:3918809‑M1/90‑91 (MQ=255) tGGAATTAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATaaa > 1:1647311/1‑91 (MQ=255) aatctcaaccttactatattaatatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCt < 1:1980840‑M1/7‑1 (MQ=255) aatctcaaccttactatattaatatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCt < 1:3565454‑M1/7‑1 (MQ=255) aTTAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCt > 1:529595/1‑91 (MQ=255) ttAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTg < 1:627846/91‑1 (MQ=255) atctcaaccttactatattaatatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTg < 1:1332794‑M1/8‑1 (MQ=255) tAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGa > 1:3708753/1‑91 (MQ=255) tAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGa > 1:3708599/1‑91 (MQ=255) ctcaaccttactatattaatatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAg < 1:1284727‑M1/10‑1 (MQ=255) aGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAg > 1:3659250/1‑91 (MQ=255) aGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAg < 1:345537/91‑1 (MQ=255) gTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTTATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAgg > 1:3025187/1‑91 (MQ=255) gTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAgg > 1:1380703/1‑91 (MQ=255) gTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAgg > 1:1176081/1‑91 (MQ=255) gTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAgg > 1:3025312/1‑91 (MQ=255) gTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAgg < 1:1869423/91‑1 (MQ=255) gTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAgg > 1:1846992/1‑91 (MQ=255) gCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGtt > 1:1587356/1‑91 (MQ=255) gCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGtt > 1:1651505/1‑91 (MQ=255) tGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTc > 1:3186614/1‑91 (MQ=255) ttactatattaatatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCa > 1:2411811‑M1/75‑91 (MQ=255) ggggCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCa > 1:1592789/1‑91 (MQ=255) ggCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCaaa > 1:1913960/1‑91 (MQ=255) gcgcTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAAt > 1:2740776/1‑91 (MQ=255) cgcTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAAtt < 1:2564213/91‑1 (MQ=255) aCAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGc < 1:1295793/91‑1 (MQ=255) aaaTATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGa > 1:1894407/1‑91 (MQ=255) tatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGaa > 1:830669‑M1/63‑91 (MQ=255) tatataatcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGaa > 1:604201‑M1/63‑91 (MQ=255) aaTATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGaa > 1:2393616/1‑91 (MQ=255) atatAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGaaa > 1:1936001/1‑91 (MQ=255) aaGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAAtct > 1:3982100/1‑91 (MQ=255) aaGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAAtct > 1:806504/1‑91 (MQ=255) atcaaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAAtctc > 1:1566676‑M1/57‑91 (MQ=255) gAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCa > 1:1810341/1‑91 (MQ=255) gAACTCTGATAAATAAATATTTTTAACGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCa < 1:2693839/91‑1 (MQ=255) aaCTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAg > 1:1420011/1‑91 (MQ=255) aaatcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAgg > 1:1308997‑M1/54‑91 (MQ=255) aCTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAgg < 1:1880136/91‑1 (MQ=255) aCTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAgg < 1:1217915/91‑1 (MQ=255) tctGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGt < 1:4117141/91‑1 (MQ=255) tctGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGt < 1:1628087/91‑1 (MQ=255) tctGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGt < 1:200143/91‑1 (MQ=255) tctGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGt < 1:1175975/91‑1 (MQ=255) tctGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGt > 1:823316/1‑91 (MQ=255) tcttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGtt > 1:3969743‑M1/51‑91 (MQ=255) tGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGttt < 1:1396332/91‑1 (MQ=255) tGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGttt < 1:2157154/91‑1 (MQ=255) tGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGttt < 1:2251526/91‑1 (MQ=255) cttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGttt > 1:2641219‑M1/50‑91 (MQ=255) gATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGtttt > 1:1323684/1‑91 (MQ=255) ataaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAtt < 1:1027155/91‑1 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 1:2728249/1‑91 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 1:2183824/1‑91 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 1:3844859/1‑91 (MQ=255) tttttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTc > 1:3270131/1‑91 (MQ=255) tttttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTc > 1:3270355/1‑91 (MQ=255) tttttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTc < 1:104267/91‑1 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 1:2740273/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa < 1:2286867/91‑1 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 1:1889172/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 1:2231305/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 1:1142940/1‑91 (MQ=255) ttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAt < 1:2841957/91‑1 (MQ=255) tAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAtt < 1:2946808/91‑1 (MQ=255) tAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAtt > 1:2408670/1‑91 (MQ=255) tAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAtt > 1:2408555/1‑91 (MQ=255) tAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAtt > 1:201735/1‑91 (MQ=255) aaTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTa > 1:552049/1‑91 (MQ=255) aTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTat < 1:222975/91‑1 (MQ=255) aTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTat > 1:1306226/1‑91 (MQ=255) aTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTat < 1:438189/91‑1 (MQ=255) tGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatc < 1:1949664/91‑1 (MQ=255) gTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatca < 1:3352902/91‑1 (MQ=255) cGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTg > 1:1092896/1‑91 (MQ=255) cGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTg > 1:1092645/1‑91 (MQ=255) cGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTg > 1:1383575/1‑91 (MQ=255) gATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGt < 1:25754/91‑1 (MQ=255) ttCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTAt < 1:1915597/91‑1 (MQ=255) ttCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTAt < 1:2293210/91‑1 (MQ=255) tCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATc < 1:383877/91‑1 (MQ=255) tCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATc > 1:2042127/1‑91 (MQ=255) tCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATc > 1:2042304/1‑91 (MQ=255) cATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCa > 1:1589550/1‑91 (MQ=255) aTTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCAt < 1:908066/91‑1 (MQ=255) tatataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTa > 1:702553/1‑91 (MQ=255) tataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATcaca > 1:3213953/1‑91 (MQ=255) tataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTaca > 1:2003541/1‑91 (MQ=255) tataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTaca < 1:246068/91‑1 (MQ=255) aaaaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTa > 1:3654357/1‑91 (MQ=255) aaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGtt < 1:509217/91‑1 (MQ=255) tCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTaa < 1:3512316/91‑1 (MQ=255) tCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTaa < 1:903615/91‑1 (MQ=255) tCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAACTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTaa < 1:3849606/91‑1 (MQ=255) aaTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCt > 1:1259057/1‑91 (MQ=255) aTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTa > 1:1709137/1‑91 (MQ=255) aTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTa > 1:2140562/1‑91 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg < 1:1125527‑M1/91‑1 (MQ=255) | TTTGGAATTAGTGCTTGGGGCGCTAACAAATATAAGAACTCTGATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAG > USA300TCH1516_ALE/1392176‑1392356 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |