| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2008942 = | 91 (0.930) | 14 (0.170) | 7/132 | NT | 17.4% | intergenic (+70/+121) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2008991 = | 58 (0.710) | intergenic (+119/+72) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTCA > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2009032 | gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaa > 1:2983051/1‑91 (MQ=255)gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaa > 1:800628/1‑91 (MQ=255)gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaa < 1:268461/91‑1 (MQ=255)gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATC‑TTACCAATTAATCCCACAATGAGATCAGCTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaa > 1:3318261/1‑91 (MQ=255) gcattcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagaa > 1:1231007‑M1/90‑91 (MQ=255) agaagaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaaaa < 1:2397344/91‑1 (MQ=255) gaagaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaaaaa > 1:471143/1‑91 (MQ=255) gaagaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaaaaa > 1:3831743/1‑91 (MQ=255) attcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagaaaa < 1:1563314‑M1/4‑1 (MQ=255) aagaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTaaaaaa < 1:3632566/91‑1 (MQ=255) aCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCa > 1:1980963/1‑91 (MQ=255) aCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCa > 1:1980906/1‑91 (MQ=255) aCTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCa > 1:3304178/1‑91 (MQ=255) aaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCa < 1:596725‑M1/8‑1 (MQ=255) ttGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTa < 1:1012505/91‑1 (MQ=255) aacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGt < 1:4085791‑M1/10‑1 (MQ=255) aacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGt < 1:3002400‑M1/10‑1 (MQ=255) aacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGt < 1:4008978‑M1/10‑1 (MQ=255) tGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTaa < 1:1206898/91‑1 (MQ=255) acttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTa > 1:1271201‑M1/81‑91 (MQ=255) gATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGTAGTAAg > 1:1706047/1‑91 (MQ=255) gATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAg > 1:2665347/1‑91 (MQ=255) gATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAg > 1:817928/1‑91 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa < 1:1629271‑M1/12‑1 (MQ=255) ttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAg > 1:2832601‑M1/79‑91 (MQ=255) aTTTATAGCATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGa < 1:2079423/91‑1 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 1:395170/91‑1 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 1:395207/91‑1 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 1:394896/91‑1 (MQ=255) tttATAACATTAAAAAAATTCCTAT‑AATTAATTCCACAATGAGATAAAGTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 1:1377463/91‑1 (MQ=255) aaaaCAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAAtt < 1:3843071/91‑1 (MQ=255) aaaCAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTa < 1:1082052/91‑1 (MQ=255) aaaCAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTa < 1:1081459/91‑1 (MQ=255) aCAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAg > 1:21591/1‑91 (MQ=255) aTT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGACTCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGaaa > 1:3562910/1‑91 (MQ=255) aTT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGaaa > 1:3563074/1‑91 (MQ=255) tt‑ttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGaaaa > 1:2527820/1‑91 (MQ=255) tgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGAG‑ATTTTCAATTAAGaaaa > 1:2670706‑M1/60‑91 (MQ=255) t‑ttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAt < 1:555087/91‑1 (MQ=255) acttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAt > 1:226777‑M1/58‑91 (MQ=255) aTCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTTAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAAtctc < 1:3481451/91‑1 (MQ=255) tCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATctct < 1:1323633/91‑1 (MQ=255) cagtacaatcttgcagagaaaatttgtaacaggatggtggggtgataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATctct > 1:4146897‑M1/54‑91 (MQ=255) aaTTAATGCGACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTa < 1:3726059/91‑1 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTa < 1:498389/91‑1 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTa < 1:3773252/91‑1 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTa > 1:1990727/1‑91 (MQ=255) aaTCAATGCTACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTa < 1:3725759/91‑1 (MQ=255) tacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTAc > 1:2490350‑M1/51‑91 (MQ=255) aTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTAc > 1:2273966/1‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:2800141‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:2136591‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:2506758‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:1808733‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:3074147‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:3074217‑M1/48‑91 (MQ=255) aatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc > 1:1066874‑M1/48‑91 (MQ=255) aaTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGc < 1:4008526/91‑1 (MQ=255) aTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCt < 1:1923823/91‑1 (MQ=255) aTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCt > 1:744842/1‑91 (MQ=255) tGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCtt < 1:1911747/91‑1 (MQ=255) gCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCttt < 1:4098297/91‑1 (MQ=255) ccACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCtttt > 1:1669991/1‑91 (MQ=255) aaTGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTa < 1:2963463/91‑1 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg < 1:2278722/91‑1 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg > 1:2427653/1‑91 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg > 1:2575364/1‑91 (MQ=255) agaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGtt < 1:1004397/91‑1 (MQ=255) agaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGtt < 1:1004317/91‑1 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa > 1:3117900/1‑91 (MQ=255) cTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAccc < 1:2707855/91‑1 (MQ=255) cTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAccc < 1:2811875/91‑1 (MQ=255) tAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAcccc < 1:1148404/91‑1 (MQ=255) aaTATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCcca > 1:3391877/1‑91 (MQ=255) atatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccac < 1:1747210/91‑1 (MQ=255) atTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacca < 1:2178569/91‑1 (MQ=255) ttGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCAt > 1:3282714/1‑91 (MQ=255) gAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATcc > 1:1321766/1‑91 (MQ=255) aTCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTg > 1:3042609/1‑91 (MQ=255) ctcGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGtt < 1:2878780/91‑1 (MQ=255) ctcGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGtt < 1:340461/91‑1 (MQ=255) ctcGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGtt < 1:262319/91‑1 (MQ=255) gggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTAc > 1:1566984‑M1/15‑91 (MQ=255) cGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTAc < 1:3559880/91‑1 (MQ=255) aattaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaaa < 1:2096520/91‑1 (MQ=255) aattaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaaa < 1:2096182/91‑1 (MQ=255) aattaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaaa > 1:3447451/1‑91 (MQ=255) ttaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAAtt < 1:2828695/91‑1 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc < 1:4109955/91‑1 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc < 1:3470735/91‑1 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc > 1:1074621/1‑91 (MQ=255) attTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtct > 1:428954/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc < 1:1393811/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc < 1:3114170/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc < 1:3698521/91‑1 (MQ=255) ttAAAAACGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTctct < 1:2084495/91‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCtt < 1:1832889/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTc < 1:463194/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTc < 1:464110/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTc < 1:533739/91‑1 (MQ=255) | GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATT‑TTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTCA > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2009032 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |