| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2850830 | 70 (0.710) | 6 (0.070) | 4/132 | NT | 9.2% | intergenic (+29/+90) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2850851 | 60 (0.740) | intergenic (+50/+69) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTT > USA300TCH1516_ALE/2850740‑2850920 | ggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTaa > 1:25360‑M1/78‑91 (MQ=255) aGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAt > 1:222490/1‑91 (MQ=255) aGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAt < 1:671347/91‑1 (MQ=255) gCCATTGAAGCTATTTCTACTGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGGATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAtt > 1:2445387/1‑91 (MQ=255) gCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAtt > 1:2908457/1‑91 (MQ=255) ccATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAttt < 1:2888014/91‑1 (MQ=255) cATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTg < 1:3148522/91‑1 (MQ=255) cATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGACACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTg < 1:3283647/91‑1 (MQ=255) aTTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGt > 1:885725/1‑91 (MQ=255) aTTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGt < 1:1650451/91‑1 (MQ=255) aTTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGt < 1:3896326/91‑1 (MQ=255) ttGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGtt > 1:1621867/1‑91 (MQ=255) tGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTa < 1:964931/91‑1 (MQ=255) aGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGtt > 1:574109/1‑91 (MQ=255) gCTATTTCTAATGGTGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAAGGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGttt < 1:4149146/91‑1 (MQ=255) aagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTa > 1:4108066‑M1/66‑91 (MQ=255) tttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGt > 1:1564628/1‑91 (MQ=255) tttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGt > 1:2416803/1‑91 (MQ=255) tttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGt > 1:1641777/1‑91 (MQ=255) ttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTc < 1:3614302/91‑1 (MQ=255) ttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTc < 1:2550193/91‑1 (MQ=255) tCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCt < 1:3263520/91‑1 (MQ=255) tCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCt > 1:1436503/1‑91 (MQ=255) tCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCt > 1:2706425/1‑91 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTa > 1:602149/1‑91 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTa > 1:601958/1‑91 (MQ=255) taaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAc > 1:304481‑M1/58‑91 (MQ=255) atgatgAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACt > 1:1508529/1‑91 (MQ=255) aaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACt > 1:493279‑M1/57‑91 (MQ=255) caatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTa > 1:3827928‑M1/54‑91 (MQ=255) caatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTa > 1:1090478‑M1/54‑91 (MQ=255) tgaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattag < 1:1773366‑M1/91‑26 (MQ=255) tgaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttag > 1:2132167‑M2/1‑87 (MQ=255) atgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAgg > 1:2683358‑M1/52‑91 (MQ=255) tgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAggg > 1:2754366‑M1/51‑91 (MQ=255) aGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattaggg < 1:2038494‑M1/91‑28 (MQ=255) aGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattaggg < 1:1884149‑M1/91‑28 (MQ=255) aGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttaggg < 1:3286326‑M2/91‑7 (MQ=255) gtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGt > 1:2179272‑M1/50‑91 (MQ=255) gtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGt > 1:2179822‑M1/50‑91 (MQ=255) gATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtg > 1:1610379‑M2/1‑83 (MQ=255) cgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGc > 1:1328885‑M1/48‑91 (MQ=255) cgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGc > 1:2767063‑M1/48‑91 (MQ=255) cgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGc > 1:2766893‑M1/48‑91 (MQ=255) tACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtgcttt < 1:1122121‑M2/91‑13 (MQ=255) tACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtgcttt < 1:3528214‑M2/91‑13 (MQ=255) acacCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtgctttt > 1:1351053‑M2/1‑78 (MQ=255) cacCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtgcttttg > 1:1618995‑M2/1‑77 (MQ=255) tAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgatg > 1:1067098/1‑91 (MQ=255) tAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgatg > 1:3809235/1‑91 (MQ=255) aGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgatga > 1:57495/1‑91 (MQ=255) aGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgatga > 1:3108171/1‑91 (MQ=255) gCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTCGgatgat > 1:2064786/1‑91 (MQ=255) gCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTAGgatgat > 1:2064235/1‑91 (MQ=255) gCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTAGgatgat > 1:2064680/1‑91 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAg > 1:1502518/1‑91 (MQ=255) aCGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtt > 1:3995963/1‑91 (MQ=255) cGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt < 1:1207060/91‑1 (MQ=255) cGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt < 1:1207248/91‑1 (MQ=255) cGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt > 1:1395927/1‑91 (MQ=255) aaTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc > 1:2850429/1‑91 (MQ=255) aTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACt < 1:911820/91‑1 (MQ=255) gTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtata > 1:2379301/1‑91 (MQ=255) ataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatg > 1:2259541/1‑91 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat > 1:3642801/1‑91 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg > 1:1970606/1‑91 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg < 1:394772/91‑1 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg < 1:3396981/91‑1 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg < 1:3396982/91‑1 (MQ=255) gTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGt > 1:3011975/1‑91 (MQ=255) cacaAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtt > 1:2566727/1‑91 (MQ=255) cacaAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtt > 1:2566513/1‑91 (MQ=255) acaaacaaAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTAGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAttt < 1:3496665/91‑1 (MQ=255) aacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAg > 1:1118850/1‑91 (MQ=255) caaaAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtg < 1:3819585‑M1/91‑78 (MQ=255) caaaAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtg < 1:920821‑M1/91‑78 (MQ=255) caaaAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtg < 1:568047‑M1/91‑78 (MQ=255) caaaAGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtg < 1:2288056‑M1/91‑78 (MQ=255) aaaaGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgt < 1:3248946‑M1/91‑79 (MQ=255) aaaaGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgt < 1:3246687‑M1/91‑79 (MQ=255) aaaaGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgt < 1:4076604‑M1/91‑79 (MQ=255) aaaaGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgt > 1:1351053‑M1/1‑13 (MQ=255) AAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTa > 1:3333329‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTa < 1:797732‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTa > 1:2111218‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgta > 1:1300622‑M1/1‑12 (MQ=255) aaGCACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaa < 1:731730‑M1/91‑81 (MQ=255) AAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTaaa > 1:780986‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAAc < 1:4039043‑M1/91‑1 (MQ=255) cACCCTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatc > 1:1610379‑M1/1‑8 (MQ=255) ACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGAc < 1:948520‑M1/91‑1 (MQ=255) cccTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatcct < 1:1884149‑M2/91‑65 (MQ=255) CCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACa < 1:2159971‑M1/91‑1 (MQ=255) ccTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatcctc > 1:855379‑M1/1‑5 (MQ=255) cTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatcctca > 1:1596947‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatcctca < 1:2824166‑M1/91‑88 (MQ=255) cTAAagttagacttaaactaacaaattagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatcctca > 1:916575‑M1/1‑4 (MQ=255) aaTTTGTTAGTTTAAGTCTAACTttagggtgcttttgtttgtgcacttataactattccgttgtgcccagggctaggtgtaaatcctcatc < 1:3896306‑M2/91‑69 (MQ=255) ATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGtt < 1:1743708‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGtt > 1:1809504‑M1/1‑91 (MQ=255) | CAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTT > USA300TCH1516_ALE/2850740‑2850920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |