New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1974 | 2842 (0.280) | 226 (0.030) | 29/138 | NT | 8.4% | intergenic (+207/+119) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 2041 | NA (NA) | intergenic (+274/+52) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 9654 total aligned reads displayed.
GGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTC > NC_012417/1884‑2060 | ggAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC < 1:2785919‑M1/91‑1 (MQ=255) ggAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC < 1:4085657‑M1/91‑1 (MQ=255) ggAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC < 1:3691383‑M1/91‑1 (MQ=255) gaagaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACt > 1:2253344/1‑91 (MQ=255) gaagaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACt < 1:881325/91‑1 (MQ=255) gaagaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACt > 1:1499643/1‑91 (MQ=255) gaagaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACt < 1:3173554/91‑1 (MQ=255) aagaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTa < 1:2097203/91‑1 (MQ=255) aagaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCAGTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTa > 1:3295657/1‑91 (MQ=255) agaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTaa > 1:2021838/1‑91 (MQ=255) agaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTaa > 1:182820/1‑91 (MQ=255) gaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTaaa > 1:1000396/1‑91 (MQ=255) gaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTaaa > 1:670125/1‑91 (MQ=255) aaaaaTATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAAc > 1:1721218/1‑91 (MQ=255) aaaaTATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACt < 1:2583433/91‑1 (MQ=255) aaaaTATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACt > 1:1645343/1‑91 (MQ=255) tatGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCa > 1:960426/1‑91 (MQ=255) tGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGa < 1:1970562/91‑1 (MQ=255) tGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGa < 1:3967805/91‑1 (MQ=255) tGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGa < 1:2401174/91‑1 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 1:2429806‑M1/91‑1 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC > 1:110611‑M1/1‑91 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC > 1:471883‑M1/1‑91 (MQ=255) tATCATGAAGATAATCAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTCGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA > 1:3529286‑M1/1‑91 (MQ=255) tATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCCGACatt < 1:2359758‑M1/91‑4 (MQ=255) tATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA < 1:118436‑M1/91‑1 (MQ=255) tATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA > 1:2183338‑M1/1‑91 (MQ=255) aTCATGAAGATAAGAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAGAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT < 1:4143484‑M1/91‑1 (MQ=255) cATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GT > 1:253558‑M1/1‑91 (MQ=255) aTGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCcgacattcgtc < 1:3808541‑M1/91‑12 (MQ=255) gAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGG > 1:1902292‑M1/1‑91 (MQ=255) gAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGACGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCcgacattcgtctg < 1:3590753‑M1/91‑14 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGC > 1:345432‑M1/1‑91 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGC < 1:1071657‑M1/91‑1 (MQ=255) gATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCAt < 1:3136260/91‑1 (MQ=255) ataataAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGATCCCTTAACTAAACTTGCcgacattcgtctgcaag < 1:1346115‑M1/91‑18 (MQ=255) ataataAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATa < 1:836355/91‑1 (MQ=255) taataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAg < 1:1299744/91‑1 (MQ=255) aataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGc < 1:3628168/91‑1 (MQ=255) aataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGc > 1:1426015/1‑91 (MQ=255) aataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGc > 1:3097994/1‑91 (MQ=255) aataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGc < 1:3889865/91‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGct < 1:2215716/91‑2 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCg > 1:2657596/1‑91 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCg > 1:923333/1‑91 (MQ=255) taaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGctc < 1:2620308/91‑3 (MQ=255) aaacaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGa < 1:3218207/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTCAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGa > 1:2980044/1‑91 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAg < 1:1755373/91‑1 (MQ=255) aaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCCGAC‑ATTCGTCTgcaagtttagttaa > 1:73859‑M2/1‑77 (MQ=255) aTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTa < 1:1864461/91‑1 (MQ=255) aTAGACGACGCATTTAGGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTATCTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTa < 1:3499108/91‑1 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTAt < 1:3926693/91‑1 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTAt < 1:3659271/91‑1 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTAt > 1:1265251/1‑91 (MQ=255) aGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTAtt > 1:405201/1‑91 (MQ=40) agacacgcattTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑tcggcttaatagctcacgcta < 1:275655‑M1/87‑22 (MQ=255) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:411558/1‑91 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:1463989/1‑91 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:2821561/1‑91 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:1539894/1‑91 (MQ=37) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 1:2728087/1‑91 (MQ=38) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg > 1:401298‑M2/1‑90 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg > 1:3771989‑M2/1‑90 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 1:80690‑M2/91‑2 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGTAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc > 1:3559714‑M2/1‑89 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑Ggtcggcttaatagctcacgctatg < 1:1931297‑M1/91‑25 (MQ=255) cgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccg < 1:3259210‑M2/91‑5 (MQ=255) cgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccg > 1:701510‑M2/1‑87 (MQ=255) gCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑Ggtcggcttaatagctcacgctatgccg < 1:1613399‑M1/91‑28 (MQ=255) cATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑Ggtcggcttaatagctcacgctatgccga < 1:21440‑M1/91‑29 (MQ=255) aTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACc > 1:340886‑M2/1‑90 (MQ=255) tttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACca > 1:434349‑M2/1‑89 (MQ=255) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑Ggtcggcttaatagctcacgctatgccgacat < 1:3334535‑M1/91‑32 (MQ=255) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAGCTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattc < 1:2902600‑M2/91‑6 (MQ=255) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcg < 1:3019498‑M2/91‑7 (MQ=255) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcg > 1:1573607‑M2/1‑85 (MQ=255) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcg < 1:1685065‑M2/91‑7 (MQ=255) GCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa > 1:114988‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:509825‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa > 1:624465‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:1030801‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:1385691‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:2466350‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAGACTTGCAGACGAAC‑GTCGGCATAGCGTCAGCTATTAAGCCGACCATTCGACaa < 1:3851682‑M1/91‑1 (MQ=255) tGATGTTGAGAAGAACCCTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag < 1:2284797‑M1/91‑69 (MQ=255) aTGTTGAGAAGAACCCTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagtt < 1:545244‑M1/91‑71 (MQ=255) tGAGAAGAACCCTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagg < 1:1791647‑M1/91‑75 (MQ=255) gaaCCCTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttctt < 1:3059075‑M1/91‑81 (MQ=255) aaCCCTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttc > 1:775618‑M1/1‑10 (MQ=255) aCCCTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttct < 1:2323303‑M1/91‑83 (MQ=255) aCCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑tcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaac < 1:337324‑M1/91‑65 (MQ=255) cccTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctc > 1:2939164‑M1/1‑8 (MQ=255) cccTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctc < 1:2692521‑M1/91‑84 (MQ=255) ccTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctca > 1:586452‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctca > 1:2501159‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctca > 1:2061882‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTTAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaaggattcttctca > 1:3731457‑M1/1‑7 (MQ=255) ttAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaac > 1:1224674‑M1/1‑5 (MQ=255) tAACaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaaca < 1:2860550‑M1/91‑88 (MQ=255) | GGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTC > NC_012417/1884‑2060 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |