| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 1974 | 2842 (0.280) | 226 (0.030) | 29/138 | NT | 8.4% | intergenic (+207/+119) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | = 2041 | NA (NA) | intergenic (+274/+52) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 5544 total aligned reads displayed.
CAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTT > NC_012417/1983‑2131 | ttgtcgaatggtaggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAg > 1:1378287‑M2/39‑91 (MQ=255) tcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑TCTGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAg > 1:2897045‑M2/36‑91 (MQ=255) cgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGTCTG‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc > 1:484666‑M2/35‑91 (MQ=255) gaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAAtt > 1:1820181‑M2/34‑91 (MQ=255) ggtcggcttaatagctcacgctatgccgacCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTACGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGa > 1:3322877‑M2/31‑91 (MQ=255) cggcATAGCGTGTGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata > 1:3173174‑M2/5‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:1668623‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:1075240‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:857399‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2337422‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2042385‑M2/4‑91 (MQ=255) cggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2176157‑M2/27‑91 (MQ=255) gcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaa < 1:2647817‑M2/89‑1 (MQ=255) cttaatagctcacgctatgccgacCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:2935390‑M2/25‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:268866‑M2/2‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:1788254‑M2/2‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGATTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCACTTGGaataaat > 1:3754680‑M2/2‑91 (MQ=255) cttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTggaataaaat > 1:3869825‑M2/24‑89 (MQ=255) taGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg > 1:1205579‑M2/3‑91 (MQ=255) taatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGt > 1:3019541‑M2/22‑91 (MQ=255) aatagctcacgctatgccgacCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAACGCAATTGGAATAAATAGt > 1:1276756‑M2/22‑91 (MQ=255) aGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGt > 1:773014‑M2/2‑91 (MQ=255) gCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTa < 1:1344187/91‑1 (MQ=35) tagctcacgctatgccgacCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:1743749‑M2/20‑91 (MQ=255) tagctcacgctatgccgacCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:602557‑M2/20‑91 (MQ=255) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:3579252/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:3788888/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:344548/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc > 1:1312561/1‑91 (MQ=38) gAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAGTAGTATCTa < 1:2082901/91‑1 (MQ=255) gAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:40083/1‑91 (MQ=40) gAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:672884/1‑91 (MQ=40) gAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:3056569/1‑91 (MQ=40) acgCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:3354680/3‑91 (MQ=255) aGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa < 1:1643420/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa < 1:2578552/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa < 1:3478120/91‑1 (MQ=255) cTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg < 1:3722902/91‑1 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTCAAGt > 1:637475/1‑91 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt < 1:3976331/91‑1 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt < 1:1566611/91‑1 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt < 1:1168692/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa < 1:2386576/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa < 1:2849583/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:1709011/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:3129597/91‑1 (MQ=255) aGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc > 1:3825032/1‑91 (MQ=255) aGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 1:4145457/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:2252212/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg > 1:3908669/1‑91 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg > 1:1901086/1‑91 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:1601450/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:819872/91‑1 (MQ=255) ccGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt > 1:1000232/1‑91 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:1036678/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:2981741/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa > 1:193624/1‑91 (MQ=255) gACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:2449740/91‑1 (MQ=255) aCCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt < 1:570523/91‑1 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:3659741/91‑1 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:2207859/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:2610095/91‑1 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:961827/1‑91 (MQ=255) ATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa > 1:405547‑M2/1‑91 (MQ=255) ATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 1:73892‑M2/91‑1 (MQ=255) ATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 1:924671‑M2/91‑1 (MQ=255) ATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa > 1:2486196‑M2/1‑91 (MQ=255) TTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg > 1:3397712‑M2/1‑91 (MQ=255) TTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg < 1:3944003‑M2/91‑1 (MQ=255) TTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGCAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg > 1:3686852‑M2/1‑91 (MQ=255) TCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 1:1104086‑M2/91‑1 (MQ=255) TCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 1:3089163‑M2/91‑1 (MQ=255) CG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 1:895986‑M2/1‑91 (MQ=255) CG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 1:351058‑M2/1‑91 (MQ=255) a‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTa > 1:1537835/1‑91 (MQ=255) AGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAt < 1:1138111‑M2/91‑1 (MQ=255) AGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAt > 1:1497168‑M2/1‑91 (MQ=255) AGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAt > 1:452084‑M2/1‑91 (MQ=255) AGTTTTGGGATTGTTAAGGGGTCCAAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAt > 1:1458623‑M2/1‑91 (MQ=255) TTTTAGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg > 1:3279938‑M2/1‑91 (MQ=255) TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 1:1418600‑M2/91‑1 (MQ=255) TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 1:530851‑M2/91‑1 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc > 1:3249866/1‑91 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa < 1:2418800/91‑1 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt < 1:2549924/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:2802695/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:2763126/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:1245587/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:4100/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:251745/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:2297966/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAACTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:2119980/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTACAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt > 1:2011515/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt > 1:1862519/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 1:2717631/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt > 1:1968246/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 1:3625684/91‑1 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:706088/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:3216847/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:3548195/1‑91 (MQ=255) | CAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑A‑‑‑CAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTT > NC_012417/1983‑2131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |