| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 749035 | 77 (0.780) | 10 (0.110) | 9/142 | NT | 12.6% | intergenic (+163/‑38) | oxyR/setC | Hydrogen peroxide‑inducible genes activator/Sugar efflux transporter C |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 749050 | 71 (0.810) | intergenic (+178/‑23) | oxyR/setC | Hydrogen peroxide‑inducible genes activator/Sugar efflux transporter C | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGC > USA300TCH1516_ALE/748945‑749125 | cacaAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCT < 1:835382‑M1/91‑1 (MQ=255) cAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaat > 1:3302771/1‑91 (MQ=255) cAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaat < 1:3267405/91‑1 (MQ=255) aaCAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaatt > 1:3561549/1‑91 (MQ=255) aaCAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaatt > 1:1213355/1‑91 (MQ=255) aaCAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaatt > 1:3856827/1‑91 (MQ=255) cAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaattaa > 1:2015928/1‑91 (MQ=255) cAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaattaa > 1:547541/1‑91 (MQ=255) cAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCtaattaa > 1:1806448/1‑91 (MQ=255) aaaaGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGTGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATaaa < 1:3322179/91‑1 (MQ=255) aaGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttatta < 1:2179310‑M1/91‑13 (MQ=255) aaGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAAtt > 1:922392/1‑91 (MQ=255) agagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTa < 1:122078/91‑1 (MQ=255) agagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTa < 1:3625129/91‑1 (MQ=255) gagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaat < 1:2584457‑M1/91‑15 (MQ=255) gCCCCTAATTAATAAATTACAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAa < 1:2523631‑M2/91‑2 (MQ=255) gCCCCTAATTAATAAATTACAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAa < 1:2524079‑M2/91‑2 (MQ=255) gCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaatta < 1:2123016‑M1/91‑17 (MQ=255) gCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAa < 1:2348069‑M2/91‑2 (MQ=255) ccccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAag > 1:877480‑M2/1‑89 (MQ=255) ccccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAag < 1:438196‑M2/91‑3 (MQ=255) cccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaattagg < 1:1260670‑M1/91‑19 (MQ=255) ccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaattaggg < 1:1189594‑M1/91‑20 (MQ=255) cTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaattagggg < 1:1108257‑M1/91‑21 (MQ=255) taattaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaattaggggc < 1:2104047‑M1/91‑22 (MQ=255) taattaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggc < 1:2417042‑M2/91‑7 (MQ=255) aattaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTtttaatttattaattaggggct < 1:2354598‑M1/91‑23 (MQ=255) attaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggctc > 1:2231862‑M2/1‑83 (MQ=255) attaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggctc > 1:383118‑M2/1‑83 (MQ=255) ttaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggctct > 1:3800161‑M2/1‑82 (MQ=255) taataaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTa < 1:3796216/91‑1 (MQ=255) aataaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaa > 1:3428320/1‑91 (MQ=255) taaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaaga > 1:2748093/1‑91 (MQ=255) taaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaaga > 1:1285768/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaagaa > 1:1881814/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaagaa > 1:1451778/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaagaa > 1:3946262/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTaagaa > 1:3946274/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGc > 1:2822917/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGc > 1:1822926/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGc > 1:1822738/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGc < 1:833664/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCg < 1:618454/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCg < 1:618502/91‑1 (MQ=255) ttAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCg < 1:1344731/91‑1 (MQ=255) ggggACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTa > 1:2200371/1‑91 (MQ=255) ggggACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTa > 1:2178371/1‑91 (MQ=255) ggACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATg > 1:1703200/1‑91 (MQ=255) gACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATgg < 1:2365547/91‑1 (MQ=255) cAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGat > 1:2561071/1‑91 (MQ=255) aaaGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGata < 1:4091312/91‑1 (MQ=255) aaGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGatat > 1:1547762/1‑91 (MQ=255) ggAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTGATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGt < 1:3295035/91‑1 (MQ=255) aaTACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGttt > 1:84952/1‑91 (MQ=255) aaTACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGttt > 1:174947/1‑91 (MQ=255) aaTACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGttt > 1:174125/1‑91 (MQ=255) tACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGc < 1:1678876/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGc < 1:1678902/91‑1 (MQ=255) tACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGc > 1:2696211/1‑91 (MQ=255) cAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAg < 1:1058085/91‑1 (MQ=255) cAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAg > 1:3640815/1‑91 (MQ=255) gTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCg > 1:1603940/1‑91 (MQ=255) aTGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGttatt < 1:2461656/91‑1 (MQ=255) cTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACa > 1:2976323/1‑91 (MQ=255) cTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACa < 1:2166440/91‑1 (MQ=255) cTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACa > 1:387129/1‑91 (MQ=255) aCGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAAt > 1:2402456/1‑91 (MQ=255) gcatccAACTGTATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATa > 1:2283120/5‑91 (MQ=255) aCTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAAtt > 1:3976995/1‑91 (MQ=255) aCTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAAtt > 1:2499359/1‑91 (MQ=255) cTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATta > 1:3628971/1‑91 (MQ=255) tGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATtat < 1:3131014/91‑1 (MQ=255) gCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATtata > 1:1617264/1‑91 (MQ=255) aTAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATaaa < 1:3635096/91‑1 (MQ=255) tAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAAc < 1:1080835/91‑1 (MQ=255) tAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAAc < 1:3632382/91‑1 (MQ=255) agagCCCCTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaa > 1:3800161‑M1/1‑9 (MQ=255) agagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAActc > 1:3155572/1‑91 (MQ=255) agagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAActc > 1:2153128/1‑91 (MQ=255) gagCCCCTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaat > 1:383118‑M1/1‑8 (MQ=255) gagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAActct > 1:1670627/1‑91 (MQ=255) gagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAActct > 1:1670651/1‑91 (MQ=255) agCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaatt < 1:2354598‑M2/91‑70 (MQ=255) agCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaatt < 1:2354744‑M2/91‑70 (MQ=255) gCCCCTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttactttattaatta > 1:109363‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCCCTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaatta < 1:2417042‑M1/91‑86 (MQ=255) gCCCCTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaatta > 1:3722886‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCCCTAATTAATAAATTAAAaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaatta < 1:2104047‑M2/91‑71 (MQ=255) gCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCttt > 1:21465/1‑91 (MQ=255) gCCCATAATTAATAAATGAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCttt < 1:2699450/91‑1 (MQ=255) ccccTAATTAATAAATTAAAaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaattag < 1:1108257‑M2/91‑72 (MQ=255) cccTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTttgt > 1:1913081/1‑91 (MQ=255) cccTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTttgt > 1:1393000/1‑91 (MQ=255) ccTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaattaggg > 1:57041‑M1/1‑3 (MQ=255) ccTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaattaggg < 1:743593‑M1/91‑89 (MQ=255) ccTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaattaggg > 1:286099‑M1/1‑3 (MQ=255) cTtttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaattagggg < 1:438196‑M1/91‑90 (MQ=255) cTAATTAATAAATTAAAaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttttaatttattaattagggg < 1:460441‑M2/91‑75 (MQ=255) cTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTttgttg < 1:3881065/91‑1 (MQ=255) ttttaatttattaattaggggctcttatgcagttggtgcgttagcatccaactgtattcctttgtccccttgtaatttattaattaggggc < 1:2523631‑M1/91‑91 (MQ=255) | CACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGC > USA300TCH1516_ALE/748945‑749125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |