| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTANAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCTAAATCATTAAATAAATGTAAAGCTA > CP000731/1‑174 | aaataaacatccatcaacctttttatcaagggtttatgaaaggtttatgatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTCATATAACaaa < 1:11957‑M1/34‑1 (MQ=255) aataaacatccatcaacctttttatcaagggtttatgaaaggtttatgatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACaaaa < 1:578289‑M1/35‑1 (MQ=255) taaacatccatcaacctttttatcaagggtttatgaaaggtttatgatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAAc > 1:602405‑M1/105‑141 (MQ=255) taaacatccatcaacctttttatcaagggtttatgaaaggtttatgatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAAc > 1:483346‑M1/105‑141 (MQ=255) gtaagaggtaataaaacgtttttatttagctttacatttatttaatgatttaggtgcttgcactaagatattattcattatataatacaagtatcgaaaattatataaataaacagtttctaaacgttttattaccAAAcc > 1:774346‑M1/137‑141 (MQ=255) gtaagaggtaataaaacgtttttatttagctttacatttatttaatgatttaggtgcttgcactaagatattattcattatataatacaagtatcgaaaattatataaataaacagtttctaaacgttttattaccAAAcc < 1:719879‑M1/5‑1 (MQ=255) aaacatccatcaacctttttatcaagggtttatgaaaggtttatgatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAAcc > 1:655936‑M1/104‑141 (MQ=255) aagaggtaataaaacgtttttatttagctttacatttatttaatgatttaggtgcttgcactaagatattattcattatataatacaagtatcgaaaattatataaataaacagtttctaaacgttttattaccAAAcccc < 2:229248‑M1/7‑1 (MQ=255) aagaggtaataaaacgtttttatttagctttacatttatttaatgatttaggtgcttgcactaagatattattcattatataatacaagtatcgaaaattatataaataaacagtttctaaacgttttattacaAAAcccc > 1:623242‑M1/135‑141 (MQ=255) catccatcaacctttttatcaagggtttatgaaaggtttatgatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCa < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |