| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1662000 = | 282 (1.380) | 28 (0.160) | 18/136 | NT | 11.9% | intergenic (‑87/+68) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1662039 = | 177 (1.020) | intergenic (‑126/+29) | USA300HOU_RS08275/rpmG2_2 | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase/50S ribosomal protein L33 2 | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1662101‑1662000‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCA > USA300TCH1516_ALE/1662039‑1662128 AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT > 1:2939040/1‑91AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:3103543/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 1:3518535/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:2760584/91‑1AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT > 2:3530439/1‑91AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGT < 2:3605215/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT > 1:947961/1‑91 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 2:3075325/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 2:3334979/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 1:2056782/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 2:471365/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 1:800998/91‑1 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT > 1:947951/1‑91 AACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAAGTATCAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTT < 2:977459/91‑1 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTat > 2:688679/1‑89 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTT < 1:3717225/91‑1 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTT < 2:2460256/91‑1 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTT > 1:2996494/1‑91 ACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTT > 1:2996389/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:3707128/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:2515592/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:2515499/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:2515202/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:2905025/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC > 1:2450530/1‑91 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 1:1546994/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAAGCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:3531215/91‑1 CAAACAAACTTTACACCGGGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTC < 2:3531174/91‑1 AAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCA < 1:3532594/91‑1 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC < 2:2850858/91‑1 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC > 2:3275445/1‑91 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCAC > 2:477101/1‑91 AACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTACAC > 2:477389/1‑91 ACAAACTTTACGCCGTGAAACAATATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAGAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC < 2:3018406/91‑1 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC < 1:855153/91‑1 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC < 1:2341521/91‑1 ACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACC > 1:579552/1‑91 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT > 2:1602414/1‑91 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT > 1:775591/1‑91 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT > 1:771091/1‑91 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT < 2:3222770/91‑1 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT < 1:2512575/91‑1 CAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCT > 1:1200633/1‑91 AAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTT < 1:661956/91‑1 AAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTT < 1:1232511/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 1:538310/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 1:1114704/91‑1 AACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTT < 2:1701726/91‑1 ACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTT < 2:98353/91‑1 CTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT < 1:1858767/91‑1 CAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATGAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAA > 1:3362013/1‑91 AAAATAATCATTTAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTATTTATTGTTAATTTAAAT > 2:1050299/1‑91 AATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTAATTGTTAATTTAAATTT > 1:3696878/1‑91 AAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGACATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTATTTTATTGTTAACTTACATTTAATTTTAATGATTATT > 2:859974/1‑91 AAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTAATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTT > 1:3214972/1‑91 AACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGG > 1:968315/1‑91 AAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTT > 2:1377055/1‑91 AGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTG > 2:2566198/1‑91 GGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGT > 2:2647397/1‑91 GGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGT > 1:2221292/1‑91 GTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTT > 2:265195/1‑91 GTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTT > 2:2644152/1‑91 TGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTT > 1:1475520/1‑91 TGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTT > 1:1407152/1‑91 GAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTG > 2:1510032/1‑91 AAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGT > 1:2089602/1‑91 AAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGT > 1:3902704/1‑91 AAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGT > 1:858567/1‑91 AAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGT > 1:1333544/1‑91 CTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTC > 1:2922052/1‑91 TCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCA > 1:1996565/1‑91 TCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCA > 1:1827662/1‑91 CAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCAC > 1:3662691/1‑91 CAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCAC > 2:2870083/1‑91 AAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACG > 2:1376528/1‑91 AAAATAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACG > 2:1407281/1‑91 TAAGAGGTTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTCATGCTTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAA > 2:2111925/1‑91 TTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT > 1:917491/1‑91 TTTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATT < 2:1481608/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT < 2:3935395/91‑1 TTCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTT > 1:1271624/1‑91 TCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTC > 2:2199804/1‑91 TCACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTC > 1:1642321/1‑91 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT < 2:2828808/91‑1 CACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCT > 2:3493429/1‑91 CACCTTTTCTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTGCACAGTGTAACGCTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATATCT < 2:2396648/91‑1 ACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTT > 2:1221789/1‑91 ACCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTT < 2:622736/91‑1 CCTTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTC > 1:463511/1‑91 TTTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCAT > 1:1287227/1‑91 TTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATT > 2:220898/1‑91 TTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATT < 2:198894/91‑1 TTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATT > 2:2041544/1‑91 TTTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATT > 2:2041534/1‑91 TTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTT > 2:2958140/1‑91 TTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTT > 2:1947073/1‑91 TTTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTT > 2:2958025/1‑91 TTTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTC < 1:1816814/91‑1 TTTATAGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTC < 2:3641386/91‑1 TTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCA > 1:328431/1‑91 AAACAAACAAACTTTACACCGTGAAACAAAATAATCATTAAAATTAAATTTAAATTAACAATAAAAAAGGTGAAATCTCAAAATAAGAGGTTTCACCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1662101‑1662000‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tttcacctttttTATTGTTAATTTAAATTTAATTTTAATGATTATTTTGTTTCACGGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTCACGTGAACAGAATTTCTTCATTTCA > USA300TCH1516_ALE/1662039‑1662128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |