| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1199293 | 163 (0.800) | 18 (0.100) | 7/144 | NT | 9.7% | intergenic (+20/‑63) | USA300HOU_RS05980/USA300HOU_RS05985 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1199312 | 189 (1.030) | intergenic (+39/‑44) | USA300HOU_RS05980/USA300HOU_RS05985 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
TTATCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGT > USA300TCH1516_ALE/1199203‑1199384 | ttATCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGC < 2:2390633‑M1/91‑1 (MQ=255)ttATCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGC < 1:3087779‑M1/91‑1 (MQ=255) tATCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCa < 2:3359236/91‑1 (MQ=255) tCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAg < 2:2199118/91‑1 (MQ=255) tCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAg > 1:2508583/1‑91 (MQ=255) tCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAg < 2:2786616/91‑1 (MQ=255) tCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAg > 1:2081945/1‑91 (MQ=255) ttttAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGt > 1:3653296/1‑91 (MQ=255) ttttAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGt < 2:2666382/91‑1 (MQ=255) ttAGTATTATTGCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATGTTAATTCAATTACAGTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTAc < 2:3015884/91‑1 (MQ=255) tAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACa < 2:2925142/91‑1 (MQ=255) aGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACAt < 1:83754/91‑1 (MQ=255) aGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACAt > 2:470821/1‑91 (MQ=255) tattCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATAc > 1:2922694/1‑91 (MQ=255) tattCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATAc < 2:1175181/91‑1 (MQ=255) tattCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATAc > 1:2417361/1‑91 (MQ=255) tattCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATAc > 1:2285770/1‑91 (MQ=255) tCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCtaaagtatcatgtaccct < 1:135537‑M1/91‑19 (MQ=255) tCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCtaaagtatcatgtaccct < 1:3702320‑M1/91‑19 (MQ=255) ccAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTa < 2:982594/91‑1 (MQ=255) ccAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAAGTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCtaaagtatcatgtaccctt < 1:3957506‑M1/91‑20 (MQ=255) ctaccttaaaaaaattataaaataccatctattgcccttatattcagaaaaatgcatatcaaaAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAg > 1:21584‑M1/64‑91 (MQ=255) cAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCtaaagtatcatgtacccttg < 2:62214‑M1/91‑21 (MQ=255) cAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCtaaagtatcatgtacccttg < 1:1233747‑M1/91‑21 (MQ=255) aaataGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCtaaagtatgatgtacccttgc < 1:3056911‑M1/91‑22 (MQ=255) aaaaaTGGTTACTTAAAATATTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACGTAACGGGGCtaaagtatcatgtacccttgc < 2:483296‑M1/91‑22 (MQ=255) aaaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgc > 1:1906350‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc < 1:166502‑M2/91‑4 (MQ=255) aaaaGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcc < 2:1728803‑M2/91‑4 (MQ=255) gggTTACTCCAAGTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgt < 1:3032682‑M2/91‑8 (MQ=255) gggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgt < 1:639160‑M2/91‑8 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAACTTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt < 2:492908‑M2/91‑9 (MQ=255) ggTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtt > 2:228231‑M2/1‑83 (MQ=255) ttACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgtatt < 1:2869589‑M2/91‑11 (MQ=255) ttACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGtttt > 2:1395116/1‑91 (MQ=255) ttACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTCAGCCTCGtttt < 2:169680/91‑1 (MQ=255) ccAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGata > 2:3584845/1‑91 (MQ=255) cAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGatat < 2:1945556/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATg < 2:2880123/91‑1 (MQ=255) aaTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGc > 2:2420753/1‑91 (MQ=255) aTCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCa > 1:3600930/1‑91 (MQ=255) tCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAt < 1:2688614/91‑1 (MQ=255) cTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtt < 2:2475647/91‑1 (MQ=255) ttAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAtttt < 2:3101188/91‑1 (MQ=255) tAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATACAttttt > 2:3516303/1‑91 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc < 2:2720818/91‑1 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc > 2:1113580/1‑91 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc > 1:690220/1‑91 (MQ=255) aaTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTc > 1:74079/1‑91 (MQ=255) aTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCt < 1:9572/91‑1 (MQ=255) aTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCt < 1:1850336/91‑1 (MQ=255) aTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCt > 1:2972387/1‑91 (MQ=255) aTTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCt > 2:2208474/1‑91 (MQ=255) ttGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTg < 1:2217137/91‑1 (MQ=255) ggATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGaa < 2:204273/91‑1 (MQ=255) aTTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAata > 1:2575150/1‑91 (MQ=255) tttAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAAtata < 2:3058919/91‑1 (MQ=255) aaTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAgg > 1:1145145/1‑91 (MQ=255) aTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAggg < 2:739390/91‑1 (MQ=255) aTTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAggg > 1:1149579/1‑91 (MQ=255) cAATTACAATAAATTACGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCACGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCaa > 2:3140041/1‑91 (MQ=255) aTTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATa < 2:2466019/91‑1 (MQ=255) tACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGa > 1:3455513/1‑91 (MQ=255) aCAATAAATTAAGCGACAGAACGAGGCAAGGGTACATGGTACTTCAGCCTCGTTTTTGAGATGCATTTGTCTGAAGATAAGGGCAATAGAt < 2:2871109/91‑1 (MQ=255) cAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATg > 1:1329535/1‑91 (MQ=255) aaTAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATgg < 2:3302471/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAt < 2:3858421/91‑1 (MQ=255) aatAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCAGTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAttt < 2:3886843/89‑1 (MQ=255) aTTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAttt > 1:548296/1‑91 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 2:3720846/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:2363276/91‑1 (MQ=255) ttAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTAtttt < 1:1784551/91‑1 (MQ=255) aaGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtat < 1:1058803/91‑1 (MQ=255) aaGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtat > 2:3263574/1‑91 (MQ=255) aGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTtata > 2:2549230/1‑91 (MQ=255) gACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAtt < 1:473586/91‑1 (MQ=255) gACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAtt < 2:3404979/91‑1 (MQ=255) aTAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAttttt < 1:1543351/91‑1 (MQ=255) tAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAtttttt < 1:2010014/91‑1 (MQ=255) AACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAttttttt > 1:524057‑M1/1‑91 (MQ=255) AACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAAttttttt < 1:3388905‑M1/91‑1 (MQ=255) aCGAGGCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccc < 1:2829399‑M1/91‑85 (MQ=255) aCGAGGCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccc < 2:1571236‑M1/91‑85 (MQ=255) CGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTaa < 1:666063‑M1/91‑1 (MQ=255) gAGGCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctt < 2:884238‑M1/91‑87 (MQ=255) gAGGCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctt < 1:1580908‑M2/91‑68 (MQ=255) aGGCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattcaagatttggagtaacccttt > 2:3711112‑M1/1‑4 (MQ=255) aGGCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaacccttt < 2:2853542‑M1/91‑88 (MQ=255) aGGCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaacccttt > 2:403505‑M1/1‑4 (MQ=255) AGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAgg < 1:362183‑M1/91‑1 (MQ=255) ggCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttt > 1:1726117‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCtaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttt > 1:1573986‑M1/1‑3 (MQ=255) GGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGt < 2:134992‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGt > 1:2329932‑M1/1‑91 (MQ=255) GGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGt < 2:915982‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGt < 1:3796959‑M1/91‑1 (MQ=255) gCAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaacccttttt < 1:1524096‑M2/91‑71 (MQ=255) ctaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttg > 2:2277084‑M1/1‑1 (MQ=255) ctaaagtatcatgtacccttgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttg > 2:2123552‑M1/1‑1 (MQ=255) cAAGGGTACATGATACTTTAgcctcgttatgtcgcttaatttattgtaattgaattaaaatccaattaaagatttggagtaaccctttttg < 2:62380‑M2/91‑72 (MQ=255) | TTATCGTTTTAGTATTATTCCAAAAAGGGTTACTCCAAATCTTTAATTGGATTTTAATTCAATTACAATAAATTAAGCGACATAACGAGGCAAGGGTACATGATACTTTAGCCTCGTTTTTGATATGCATTTTTCTGAATATAAGGGCAATAGATGGTATTTTATAATTTTTTTAAGGTAGT > USA300TCH1516_ALE/1199203‑1199384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |