| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1678311 | 179 (0.880) | 18 (0.110) | 9/132 | NT | 9.9% | intergenic (+57/+93) | glyQS/recO | Glycine‑‑tRNA ligase/DNA repair protein RecO |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1678323 | 179 (1.070) | intergenic (+69/+81) | glyQS/recO | Glycine‑‑tRNA ligase/DNA repair protein RecO | |||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
AGAAGCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTA > USA300TCH1516_ALE/1678221‑1678401 | aGAAGCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAATACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGG < 2:3478781‑M1/91‑1 (MQ=255) aGCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTa > 2:2401477/1‑91 (MQ=255) aGCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTa > 1:2589307/1‑91 (MQ=255) gCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAg < 2:3950020/91‑1 (MQ=255) gCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAg < 2:304603/91‑1 (MQ=255) gCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAg < 1:762037/91‑1 (MQ=255) gCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAg < 2:3562583/91‑1 (MQ=255) cTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGt < 2:11181/91‑1 (MQ=255) cTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGt < 2:1330251/91‑1 (MQ=255) cTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGt > 2:3313361/1‑91 (MQ=255) cTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGt < 2:1679964/91‑1 (MQ=255) ttCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACGTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTaa > 1:3339917/1‑91 (MQ=255) tCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTaaa < 1:1250667/91‑1 (MQ=255) actaaaCTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTaaa < 2:3706442/87‑1 (MQ=255) ttAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAAt < 2:3832017/91‑1 (MQ=255) tAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAAtt > 2:319003/1‑91 (MQ=255) aaCTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGcaattttactaa < 1:2983758‑M1/91‑13 (MQ=255) aCTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCGTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGcaattttactaac < 2:82771‑M1/91‑14 (MQ=255) aCTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGcaattttactaac < 1:1003096‑M1/91‑14 (MQ=255) aCTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGc < 2:2674141‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaaCAAAATTCTAGTTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGCCTATATAATGTATAAAAAGAGATACTGGcaattttactaaccagtat < 2:271920‑M1/91‑20 (MQ=255) aaaaCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtat < 2:616278‑M2/91‑8 (MQ=255) aaaaCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtat > 2:1994150‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatc > 2:862410‑M2/1‑83 (MQ=255) aaCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatct < 1:3621818‑M2/91‑10 (MQ=255) aCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctc > 1:2026617‑M2/1‑81 (MQ=255) aCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctc > 2:646541‑M2/1‑81 (MQ=255) aCAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctc < 2:1591103‑M2/91‑11 (MQ=255) cAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGcaattttactaaccagtatctct < 1:1130610‑M1/91‑24 (MQ=255) cAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTGATGAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGcgagtatctct < 2:145675‑M2/91‑12 (MQ=255) aaaTTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctcttt < 1:2512662‑M2/91‑14 (MQ=255) aaTTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttt < 2:2364728‑M2/91‑15 (MQ=255) aaTTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttt > 1:3618662‑M2/1‑77 (MQ=255) aaTTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttt > 2:1369666‑M2/1‑77 (MQ=255) aaTTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttt < 2:1045724‑M2/91‑15 (MQ=255) ttCTAATTAAAAAGACTTTCCACCCTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTATTCt > 2:1273169/1‑91 (MQ=255) tCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTa > 1:1441498/1‑91 (MQ=255) tCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTAAATAAAAAATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTa < 2:681427/91‑1 (MQ=255) tCTAATTAAAAAGACCTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTa < 1:3201060/91‑1 (MQ=255) cTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTAt > 2:1872321/1‑91 (MQ=255) cTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTAt < 1:1462067/91‑1 (MQ=255) cTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTAt < 1:2013736/91‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGTCTATATAATTTATAAAAAGAGATGCTGGcaattttactaaccagtatctctttttataaat < 2:1519111‑M1/91‑34 (MQ=255) aTTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCa > 1:830211/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCa > 1:1025309/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCa > 1:2142649/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTACAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCaaa > 2:1605080/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCaaa < 1:1934771/91‑1 (MQ=255) aaaaGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCaaaaa > 2:1707223/1‑91 (MQ=255) aaGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGACAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAgg < 2:3281311/91‑1 (MQ=255) aGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGt > 1:2556845/1‑91 (MQ=255) aGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGt > 2:1543966/1‑91 (MQ=255) aGACGTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGt < 2:436974/91‑1 (MQ=255) aCTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTAt < 1:1365249/91‑1 (MQ=255) ttCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCa < 1:3479074/91‑1 (MQ=255) tCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCaa > 2:1223105/1‑91 (MQ=255) tCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGCATCTCTTTTCTATTCCAAAAGGTATTCaa > 2:1430365/1‑91 (MQ=255) ccaccaTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCaaa > 1:1136628/1‑91 (MQ=255) accaTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATa > 2:912683/1‑91 (MQ=255) tatGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAaca > 2:3226915/1‑91 (MQ=255) tatGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAaca > 1:1669930/1‑91 (MQ=255) tatGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAaca > 1:2937433/1‑91 (MQ=255) tgtgGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAAcaca < 1:2377299/91‑1 (MQ=255) tggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATc > 1:3556096/1‑91 (MQ=255) ggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaa < 1:3701270‑M2/91‑47 (MQ=255) ggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTAtg < 1:854659/91‑1 (MQ=255) gCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTAtgt < 2:2493959/91‑1 (MQ=255) cTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTAtgtg < 1:3278150/91‑1 (MQ=255) atataATTTATAAAAATAGATACAGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTAAATAAAAAAAAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGc < 2:3033001/91‑1 (MQ=255) tataATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCt > 1:422303/1‑91 (MQ=255) aaTTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACt < 2:2288524/91‑1 (MQ=255) aTTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACtt < 2:22549/91‑1 (MQ=255) aTTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACtt > 1:1815032/1‑91 (MQ=255) ttATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGa < 2:2266017/91‑1 (MQ=255) aaaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATAcc > 2:773320/1‑91 (MQ=255) aaaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATAcc < 2:2918505/91‑1 (MQ=255) aaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAGTAGCCACATAGATGTGTTTATTTGAATACCt < 2:297898/91‑1 (MQ=17) aaGAGATACTGGcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaatttt < 1:3598875‑M1/91‑80 (MQ=255) aaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCtt > 2:3371905/1‑91 (MQ=255) agagagACTGGcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttg < 2:3640789‑M1/91‑81 (MQ=255) agagATACTGGcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttg < 1:2246757‑M1/91‑81 (MQ=255) agagATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCttt < 2:711512/91‑1 (MQ=255) gagaTACTGGcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgt < 2:1591102‑M1/91‑82 (MQ=255) agagACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTAGCTAAAAAATAAAAAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTtta < 2:469532/91‑1 (MQ=255) agaTACTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgtt < 1:3761989‑M2/91‑71 (MQ=255) agaTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTtta < 1:1722614/91‑1 (MQ=255) gaTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTttat < 2:2766482/91‑1 (MQ=255) aTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTttatt < 1:631055/91‑1 (MQ=255) tACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACGTCTATGTGGCTACTTGAATACCTTttatta > 1:2828585/1‑91 (MQ=255) aCTGGcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgtttttt < 2:2625934‑M1/91‑87 (MQ=255) aCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTtattat < 2:3782915/91‑1 (MQ=255) cTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgttttttc < 1:3870277‑M2/91‑76 (MQ=255) cTGGTTAGTAAAATTGccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgttttttc < 1:422484‑M2/91‑76 (MQ=255) cTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTattatt > 2:2597795/1‑91 (MQ=255) cTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTattatt > 2:2165149/1‑91 (MQ=255) tGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTAttt < 2:2909241/91‑1 (MQ=255) ggcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgttttttcag > 2:2006752‑M1/1‑2 (MQ=255) ggcaattttactaaccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgttttttcag > 1:1989768‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTTAGTAAAATTGccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgttttttcag < 1:1529760‑M2/91‑78 (MQ=255) gTTAGTAAAATTGccagtatctctttttataaattatatagccaccacatatggtggaaagtctttttaattagaattttgttttttcagt < 1:1003294‑M2/91‑79 (MQ=255) | AGAAGCTTTCTTAACTGAAAAAACAAAATTCTAATTAAAAAGACTTTCCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTA > USA300TCH1516_ALE/1678221‑1678401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |