| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2041621 | 207 (1.020) | 17 (0.100) | 9/138 | NT | 7.7% | intergenic (‑704/+65) | dagK/gatB_2 | Diacylglycerol kinase/Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2041645 | 230 (1.310) | intergenic (‑728/+41) | dagK/gatB_2 | Diacylglycerol kinase/Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B | |||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
AACGCATTAATAAAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTA > USA300TCH1516_ALE/2041531‑2041711 | gCATTAATAAAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGa > 2:800870/1‑91 (MQ=255) cATTAATAAAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGAt > 1:307728/1‑91 (MQ=255) ttAATAAAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTg < 2:3504051/91‑1 (MQ=255) taataaAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGc > 1:2507050/1‑91 (MQ=255) taaAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATc > 2:2598130/1‑91 (MQ=255) taaAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATc < 2:2359265/91‑1 (MQ=255) aaaTTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTa < 2:3320162/91‑1 (MQ=255) aaaTTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTa > 1:2713412/1‑91 (MQ=255) aaaTTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTa > 1:1815443/1‑91 (MQ=255) aaTTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTaa > 1:884851/1‑91 (MQ=255) aaTTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGACCTAAATAAACCCTCGATTGCATCTaa > 2:3422832/1‑91 (MQ=255) aTTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAg > 2:1963753/1‑91 (MQ=255) tAATATGTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTc < 2:1663445/91‑1 (MQ=255) aaTATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTtgattgctgacttagat < 1:2459181‑M1/91‑18 (MQ=255) aaTATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCa > 1:1746638/1‑91 (MQ=255) aaTATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCa > 2:3722135/1‑91 (MQ=255) aaTATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCa > 1:1586268/1‑91 (MQ=255) atatTTTTACCATTAAGATGTACAATGAATAAAGTTAAGAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAg < 2:3785457/91‑1 (MQ=255) atatTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAg > 2:309495/1‑91 (MQ=255) atatTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAg > 1:3764586/1‑91 (MQ=255) tatTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTtgattgctgacttagatgc < 1:2590886‑M1/91‑20 (MQ=255) atTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTtgattgctgacttagatgca < 2:3061404‑M1/91‑21 (MQ=255) atTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTtgattgctgacttagatgca < 1:2335311‑M1/91‑21 (MQ=255) atTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCa > 2:2476276/1‑91 (MQ=255) atTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCa > 1:3221405/1‑91 (MQ=255) tACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAa > 2:25083‑M2/1‑90 (MQ=255) ccATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagg < 2:3607123‑M2/91‑4 (MQ=255) ccATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACGTCTATAGATATAAATAAACCCTtgattgctgacttagatgcaatcgagg < 2:278361‑M1/91‑28 (MQ=255) aTTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAGAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCGAAGTCAGCAATCAagggt > 2:3423508‑M2/1‑86 (MQ=255) aTTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggt > 2:2797876‑M2/1‑86 (MQ=255) ttAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtt > 1:2600585‑M2/1‑85 (MQ=255) ttAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtt < 2:1845394‑M2/91‑7 (MQ=255) tAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggttt > 2:3241226‑M2/1‑84 (MQ=255) tAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggttt < 1:2787759‑M2/91‑8 (MQ=255) aaCATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggttta < 1:3233805‑M2/91‑9 (MQ=255) tGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAtttt < 2:1144650/91‑1 (MQ=255) gTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAttttt > 2:1664098/1‑91 (MQ=255) tACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAtttttt > 1:2861014/1‑91 (MQ=255) aTGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAAt > 1:117011/1‑91 (MQ=255) aTGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAAt < 1:106671/91‑1 (MQ=255) gAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCt > 1:1859447/1‑91 (MQ=255) gAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCt < 1:115759/91‑1 (MQ=255) aTAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTc > 2:3182622/1‑91 (MQ=255) aTAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTc > 1:1348322/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa > 1:3855242/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa < 1:1822342/91‑1 (MQ=255) tAAAATTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa < 1:3288108/91‑1 (MQ=255) aaaGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCAt > 2:2412205/1‑91 (MQ=255) aaGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATa > 2:449720/1‑91 (MQ=255) tAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCGAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGttt > 1:3169112/1‑91 (MQ=255) tAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGttt < 2:157961/91‑1 (MQ=255) aaaGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtga < 1:2616497/91‑1 (MQ=255) aaTTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGAtt > 2:1386703/1‑91 (MQ=255) aaTTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGAtt < 2:2310391/91‑1 (MQ=255) aaTTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGAtt > 1:1946712/1‑91 (MQ=255) aTTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGAttt > 2:1720035/1‑91 (MQ=255) gACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAGTCAAGGGTTTATTTTTTAGATCATCAAACTGTGAAGATTTaaaa < 2:319852/91‑2 (MQ=255) aCTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAAtt < 1:2137612/91‑1 (MQ=255) aCTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGCTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAAtt < 1:3345005/91‑1 (MQ=255) cTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTa < 2:2991121/91‑1 (MQ=255) ttCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTAt > 1:1439536/1‑91 (MQ=255) cTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCt > 1:353543/1‑91 (MQ=255) ataGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCttt > 2:1876205/1‑91 (MQ=255) ataGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCttt < 2:245489/91‑1 (MQ=255) gATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTAt < 2:3948291/91‑1 (MQ=255) gATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTAt > 1:761114/1‑91 (MQ=255) atatAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATc < 2:2944999/91‑1 (MQ=255) tataAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCt > 1:646369/1‑91 (MQ=255) tataAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCt > 1:3800810/1‑91 (MQ=255) tataAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAAGCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCt < 2:1172866/91‑1 (MQ=255) aaataaaCCCTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacat < 1:157051‑M1/91‑81 (MQ=255) aaataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAAt < 1:3636450/91‑1 (MQ=255) aaataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGGTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAACTTATCTTTTATCTact > 2:3406678/1‑89 (MQ=255) aataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTACATTATCTTTTATCTACtt > 2:131432/1‑91 (MQ=255) aataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAAtt > 2:2132042/1‑91 (MQ=255) gtagaccctagattgctgacttagggggaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgt < 2:1643542‑M1/87‑83 (MQ=255) ataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTc < 2:1339875/91‑1 (MQ=255) ataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTc < 1:2948849/91‑1 (MQ=255) taaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCt > 2:854234/1‑91 (MQ=255) taaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCt > 1:1305083/1‑91 (MQ=255) aaaCCCTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgtta > 2:3241225‑M1/1‑7 (MQ=255) aaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgtta < 1:122847‑M2/91‑61 (MQ=255) aCCCTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaat > 1:1021691‑M1/1‑5 (MQ=255) aCCCTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaat > 1:554290‑M1/1‑5 (MQ=255) aCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGt < 2:2892891/91‑1 (MQ=255) cccTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatg > 2:520113‑M1/1‑4 (MQ=255) cccTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatg < 2:1564803‑M1/91‑88 (MQ=255) cccTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGtt < 2:2740100/91‑1 (MQ=255) ccTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatgg < 1:1764847‑M1/91‑89 (MQ=255) ccTtgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatgg > 1:1515447‑M1/1‑3 (MQ=255) cTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggt < 1:292247‑M2/91‑66 (MQ=255) cTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggt < 2:3896008‑M2/91‑66 (MQ=255) cTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggt < 2:221758‑M2/91‑66 (MQ=255) cTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGtttt > 1:2821147/1‑91 (MQ=255) cTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGtttt > 1:580470/1‑91 (MQ=255) ttgattgctgacttagatgcaatcgagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggta < 2:884313‑M1/91‑91 (MQ=255) tCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtccatgttaatggta < 2:2428308‑M2/91‑67 (MQ=255) tCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTa > 2:618484/1‑91 (MQ=255) tCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTa > 2:1800668/1‑91 (MQ=255) tCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTCTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTa > 2:2083598/1‑91 (MQ=255) | AACGCATTAATAAAATTAATATTTTTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTA > USA300TCH1516_ALE/2041531‑2041711 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |