| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2041621 | 207 (1.020) | 17 (0.100) | 9/138 | NT | 7.7% | intergenic (‑704/+65) | dagK/gatB_2 | Diacylglycerol kinase/Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2041645 | 230 (1.310) | intergenic (‑728/+41) | dagK/gatB_2 | Diacylglycerol kinase/Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B | |||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
TTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGAT > USA300TCH1516_ALE/2041555‑2041735 | ttACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCa < 2:2423427/91‑1 (MQ=255) tACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAa < 2:884313‑M2/91‑2 (MQ=255) ccATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagg < 1:1764847‑M2/91‑4 (MQ=255) cATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAaggg > 2:520113‑M2/1‑87 (MQ=255) aTTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggt > 1:1021691‑M2/1‑86 (MQ=255) aTTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggt > 1:1896357‑M2/1‑86 (MQ=255) aTTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggt > 2:1663509‑M2/1‑86 (MQ=255) aTTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggt > 2:2797876‑M2/1‑86 (MQ=255) ttAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtt > 2:1372076‑M2/1‑85 (MQ=255) tAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggttt > 2:3241225‑M2/1‑84 (MQ=255) aCATGTACAATGAATAACGTTAAAAGGAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttat > 2:1889295‑M2/1‑82 (MQ=255) aCATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttat < 1:1301295‑M2/91‑10 (MQ=255) tGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAtttt < 2:1144650/91‑1 (MQ=255) gTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAttttt > 1:3224707/1‑91 (MQ=255) tACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAtttttt > 2:2846867/1‑91 (MQ=255) tACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAtttttt > 1:518117/1‑91 (MQ=255) tACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTAtttttt > 1:2861014/1‑91 (MQ=255) cAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTaa < 2:3699206/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAAt < 1:106671/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAAt > 1:117011/1‑91 (MQ=255) gAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCt < 1:115759/91‑1 (MQ=255) gAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCt > 2:2311550/1‑91 (MQ=255) gAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCt > 1:1859447/1‑91 (MQ=255) aTAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTc > 1:1348132/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa < 2:3059238/91‑1 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa < 1:1822342/91‑1 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa < 1:3288129/91‑1 (MQ=255) tAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAAGCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCa < 2:1635250/91‑1 (MQ=255) aaaGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCAt > 2:2412175/1‑91 (MQ=255) aaGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATa > 2:2938804/1‑91 (MQ=255) aGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAg > 2:376501/1‑91 (MQ=255) tAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCGAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGttt > 1:3169135/1‑91 (MQ=255) aaaaGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtg > 1:2176325/1‑91 (MQ=255) aaaGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtga < 1:2616497/91‑1 (MQ=255) aaGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtgat > 2:3317459/1‑91 (MQ=255) aaGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtgat < 1:580179/91‑1 (MQ=255) aaGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtgat < 1:3542484/91‑1 (MQ=255) aGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAATCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGTGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTtgatg < 2:1288100/91‑1 (MQ=255) aTTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGAttt > 2:1720035/1‑91 (MQ=255) aTTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGACGAttt > 2:3197400/1‑91 (MQ=255) ttGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTaa > 2:455455/1‑91 (MQ=255) ttGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTaa < 1:2212096/91‑1 (MQ=255) tGACTTCTATAGATATAAATAATCCCTCGATTGCATCTAAGTCATCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTaaa < 2:2712153/91‑1 (MQ=255) gACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCATCAAACTATGAAGATTTaaaa < 2:132437/91‑2 (MQ=25) aCTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAAtt < 1:3236545/91‑1 (MQ=255) cTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTa < 2:2991121/91‑1 (MQ=255) ttCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTAt > 1:1439455/1‑91 (MQ=255) cTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTctct > 1:3062273/1‑91 (MQ=255) ataGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCttt < 2:2515625/91‑1 (MQ=255) taGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCtttt < 1:1541434/91‑1 (MQ=255) gATATAAATAAGCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTAt < 2:3459658/91‑1 (MQ=255) gATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTAt > 1:761114/1‑91 (MQ=255) tataAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCt > 1:646369/1‑91 (MQ=255) tataAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCt > 1:3800810/1‑91 (MQ=255) tataAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAAGCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCt < 2:1172866/91‑1 (MQ=255) taaataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTaa > 1:368167/1‑91 (MQ=255) taaataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTaa > 2:1868587/1‑91 (MQ=255) aaataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGGTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAACTTATCTTTTATCTact > 2:3406678/1‑89 (MQ=255) aataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAAtt > 2:2132042/1‑91 (MQ=255) ataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTc < 1:2495561/91‑1 (MQ=255) ataaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTc < 1:2948726/91‑1 (MQ=255) taaaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCt > 2:854234/1‑91 (MQ=255) aaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaa < 1:2458293‑M2/91‑62 (MQ=255) aaCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTg > 2:435757/1‑91 (MQ=255) aCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGt < 1:2000532/91‑1 (MQ=255) aCCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGt < 2:2463466/91‑1 (MQ=255) cccTCGATTGCATCTAAGCCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTCAATAGTTTGCTGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGtt > 2:1771335/1‑91 (MQ=255) cTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGtttt > 1:2821147/1‑91 (MQ=255) tCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTa < 2:1566640/91‑1 (MQ=255) cGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTaa < 2:1316576/91‑1 (MQ=255) cGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGGTTATTTTTTTAATTTTTATAGTTTGATGATTTTAATTATTTTTTTTCTAAttttttttttta > 2:3355147/1‑89 (MQ=255) gATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAAt < 1:2958795/91‑1 (MQ=255) gATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAAt > 2:77232/1‑91 (MQ=255) aTTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATa < 1:1234262/91‑1 (MQ=255) ttGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAg < 1:699914/91‑1 (MQ=255) ttGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAg > 1:1751852/1‑91 (MQ=255) tGCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggtaaaaat < 2:3946614‑M2/91‑72 (MQ=255) gCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggtaaaaata < 1:2590886‑M2/91‑73 (MQ=255) gCATCTAAGTCAGCAATCAagggtttatttatatctatagaagtcaaattacttttaactttattcattgtacatgttaatggtaaaaata < 1:2605263‑M2/91‑73 (MQ=255) aTCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGa > 2:2084036/1‑91 (MQ=255) aTCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGa > 2:2083042/1‑91 (MQ=255) aTCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGa < 2:3062247/91‑1 (MQ=255) aTCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGa > 2:3154648/1‑91 (MQ=255) aTCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGa > 2:2001316/1‑91 (MQ=255) tCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGAt < 1:2771491/91‑1 (MQ=255) aaGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTa < 2:2442209/91‑1 (MQ=255) attCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTAc < 2:3554798/89‑1 (MQ=255) tCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTa < 2:1834297/91‑1 (MQ=255) cAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTaa > 2:2948212/1‑91 (MQ=255) cAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGAGTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTaa < 2:572460/91‑1 (MQ=255) gCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTCAtt > 2:2659520/1‑91 (MQ=255) aaTCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATtgt > 1:3459804/1‑91 (MQ=255) aTCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATtgtg < 1:402905/91‑1 (MQ=255) aTCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATtgtg < 2:153742/91‑1 (MQ=255) aTCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATtgtg > 2:2218666/1‑91 (MQ=255) cANGGGTTTATTTTTTNAATCTTCATAGTNTGATGATTNAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGa < 2:1003841/91‑1 (MQ=255) cAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGa > 1:3845402/1‑91 (MQ=255) cAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGa < 1:3695130/91‑1 (MQ=255) cAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGa > 1:1451054/1‑91 (MQ=255) aaGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGAt < 1:1644433/91‑1 (MQ=255) | TTACCATTAACATGTACAATGAATAAAGTTAAAAGTAATTTGACTTCTATAGATATAAATAAACCCTCGATTGCATCTAAGTCAGCAATCAAGGGTTTATTTTTTAAATCTTCATAGTTTGATGATTTAAATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGAT > USA300TCH1516_ALE/2041555‑2041735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |