| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2684290 | 146 (0.720) | 17 (0.100) | 9/136 | NT | 11.5% | intergenic (+49/+121) | mvaS/ogt | Hydroxymethylglutaryl‑CoA synthase/Methylated‑DNA‑‑protein‑cysteine methyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2684307 | 138 (0.800) | intergenic (+66/+104) | mvaS/ogt | Hydroxymethylglutaryl‑CoA synthase/Methylated‑DNA‑‑protein‑cysteine methyltransferase | |||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
AATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGACACATTATTGA > USA300TCH1516_ALE/2684200‑2684380 | tatTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCa > 1:2787781/1‑91 (MQ=255) atTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCAc < 2:915498/91‑1 (MQ=255) ttGAATATAACGGTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACt < 2:3645543/91‑1 (MQ=255) tGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACtt < 2:1283400/91‑1 (MQ=255) tGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACtt < 2:389014/91‑1 (MQ=255) gAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTc < 2:2723616/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCt < 2:2110093/91‑1 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa < 1:272685/91‑1 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa < 2:2945877/91‑1 (MQ=255) aaaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTa < 2:3327970/91‑1 (MQ=255) aaTAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTaa < 2:2434313/91‑1 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaatta < 2:2074163‑M1/91‑12 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAAtt < 1:3933196/91‑1 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAAtt < 1:3719437/91‑1 (MQ=255) tAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAAtt < 1:1927625/91‑1 (MQ=255) aaCGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTg > 2:3912333/1‑91 (MQ=255) aCGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTATAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACATCTAATTGa > 2:2998378/1‑91 (MQ=255) aCGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGa > 1:96917/1‑91 (MQ=255) tCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtg < 1:2896962‑M1/91‑18 (MQ=255) ttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATc > 1:1260826‑M1/63‑91 (MQ=255) ttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATc > 2:3920226‑M1/63‑91 (MQ=255) ttcaataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATc > 2:1408942‑M1/63‑91 (MQ=255) gTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggt < 1:3626001‑M1/91‑20 (MQ=255) gTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggt < 2:2227701‑M1/91‑20 (MQ=255) gTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggt < 1:3809828‑M1/91‑20 (MQ=255) caataatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGt > 2:558835‑M1/61‑91 (MQ=255) gAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtct > 1:3854860‑M2/1‑87 (MQ=255) taatgtgtcaaataggcataatgaattcattcaatacgaagtgttataaatagagaaCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCtt > 1:3655388‑M1/58‑91 (MQ=255) tatCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttac < 1:519515‑M2/91‑8 (MQ=255) tCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactg < 1:1901104‑M1/91‑27 (MQ=255) tCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactg < 1:1901118‑M1/91‑27 (MQ=255) acaGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgct < 1:346439‑M2/91‑12 (MQ=255) acaGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgct > 1:3574673‑M2/1‑80 (MQ=255) caGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctg < 1:1711936‑M2/91‑13 (MQ=255) caGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctg < 2:2130216‑M2/91‑13 (MQ=255) caGACCAGAGTAATCTGTGTATTTGAAAGACATTTAAATATAACCTAAAAACAGCAGTAAGACCACTTCTCATTGAAATCGTCTTActgct < 2:2298881/91‑1 (MQ=255) ccAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtct > 2:1533201/1‑91 (MQ=255) cAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtctc < 2:1701546/91‑1 (MQ=255) cAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTtctc < 1:2360405/91‑1 (MQ=255) gagTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTa > 1:2018741/1‑91 (MQ=255) gagTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTa > 2:3691514/1‑91 (MQ=255) agtagtCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTAt > 1:337605/1‑91 (MQ=255) gtagtCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTAtt > 1:1420566/1‑91 (MQ=255) tagtCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGGTGTTCTCTAttt < 1:3026129/91‑1 (MQ=255) tagtCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTAttt > 2:61571/1‑91 (MQ=255) gtCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTtat < 1:2328671/91‑1 (MQ=255) gtCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTtat > 2:859063/1‑91 (MQ=255) cGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATaa > 2:2806730/1‑91 (MQ=255) ggTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAac < 1:2579937/91‑1 (MQ=255) ggTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAac < 1:912953/91‑1 (MQ=255) gtgtATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAaca < 2:710487/91‑1 (MQ=255) tgtATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAacac < 1:1034874/91‑1 (MQ=255) tATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACtt < 1:3115864/91‑1 (MQ=255) tATTTAAAACACATAC‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACtt > 2:1943727/1‑91 (MQ=255) tttAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCg > 2:234282/1‑91 (MQ=255) aaaaCACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTAt > 1:455924/1‑91 (MQ=255) aaCACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtg > 1:1508241/1‑91 (MQ=255) aaCACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtg < 2:1550671/91‑1 (MQ=255) acacATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtga < 2:3713319/91‑1 (MQ=255) cacaTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaa < 1:1006092/91‑1 (MQ=255) acaTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaat > 1:3438066/1‑91 (MQ=255) caTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaat > 2:3402675‑M1/1‑32 (MQ=255) caTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgactg > 2:1123959/1‑91 (MQ=255) caTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaatg > 1:82514/1‑91 (MQ=255) caTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaatg > 1:26607/1‑91 (MQ=255) caTAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaatg > 2:1123868/1‑91 (MQ=255) tat‑aATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATtgaatgaa < 2:1589195/91‑1 (MQ=255) at‑aataAAACCTAAAAGCAGCAGTACGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTCTTTATAACACTTCGTATTgaatgaat > 2:2549491/1‑91 (MQ=255) at‑aataAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTgaatgaat < 2:3281022/91‑1 (MQ=255) at‑aataAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTgaatgaat < 1:2471481/91‑1 (MQ=255) aataaAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTc < 1:2129884/91‑1 (MQ=255) aataaAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTc < 1:3553628/91‑1 (MQ=255) aaaCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTa < 1:2204010/91‑1 (MQ=255) aaaCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTa < 1:2222634/91‑1 (MQ=255) aaaCCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTa < 1:2474284/91‑1 (MQ=255) ccTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGc > 1:1116981/1‑91 (MQ=255) cTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGcc < 1:2811531/91‑1 (MQ=255) tAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGCACTCATTATGCCt > 2:669273/1‑91 (MQ=255) aaaaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTa > 2:127338/1‑91 (MQ=255) aaaaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTa > 2:353734/1‑91 (MQ=255) aaaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAt < 1:381565/91‑1 (MQ=255) aaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAtt > 2:2481758/1‑91 (MQ=255) aaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAtt > 2:1687848/1‑91 (MQ=255) aaGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCCATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAtt > 2:3945739/1‑91 (MQ=255) agcagcAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAttt < 1:508447/91‑1 (MQ=255) agcagcAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTAttt > 1:2396605/1‑91 (MQ=255) gcagcaGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTg < 2:1794230/91‑1 (MQ=255) cagcagTAAGGCgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctg < 1:1784062‑M1/91‑80 (MQ=255) agcagTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgt < 2:1261399‑M1/91‑81 (MQ=255) agcagTAAGACgatttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggatttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgg > 2:53831‑M1/1‑11 (MQ=255) cagTAAGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgtga < 1:1901144‑M2/91‑66 (MQ=255) CAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGacac < 2:1999110‑M1/91‑1 (MQ=255) agTAAGACggtttcaattagaagtggtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgtgat < 1:3788171‑M1/91‑84 (MQ=255) AGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGAcaca < 2:2055099‑M1/91‑1 (MQ=255) AGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGAcaca < 1:3449773‑M1/91‑1 (MQ=255) aGACCACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgtgatattc < 1:1904488‑M2/91‑71 (MQ=255) ACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGACACATTATTg > 2:970001‑M1/1‑91 (MQ=255) ccACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgtgatattcacg < 1:1774974‑M2/91‑74 (MQ=255) ccACTTCTAATTGAAATCgtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgtgatattcacg < 2:3829745‑M2/91‑74 (MQ=255) ccACATCTAATTGAAATCgtcttactgctgcttttaggttttattatatgtgttttaaatacaccgactactctggtctgtgatatttacg < 1:3121452‑M2/91‑74 (MQ=255) | AATATTGAAAATAACGTTCGTGAATATCACAGACCAGAGTAGTCGGTGTATTTAAAACACATAT‑AATAAAACCTAAAAGCAGCAGTAAGACCACTTCTAATTGAAATCGTCTTACTGCTGTTCTCTATTTATAACACTTCGTATTGAATGAATTCATTATGCCTATTTGACACATTATTGA > USA300TCH1516_ALE/2684200‑2684380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |