| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 19515 = | 750 (0.820) | 38 (0.040) | 13/148 | NT | 5.4% | intergenic (‑557/+881) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0024/USA300HOU_pUSA300HOUMR0027 | bacitracin ABC ATP binding cassette transporter, ABC protein/IS431mec transposase |
| ? | CP000731 | 19534 = | 651 (0.770) | intergenic (‑576/+862) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0024/USA300HOU_pUSA300HOUMR0027 | bacitracin ABC ATP binding cassette transporter, ABC protein/IS431mec transposase | |||||
Only 100 of 947 total aligned reads displayed.
CTCATAATGCAACTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACG > CP000731/19425‑19605 | tcATAATGCAACTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATaa < 1:2428645/91‑1 (MQ=255) gaacacgtgatttctaacgtgcgtaatgaagtcttacaaattgataattacacgaatcttgcactgaactatttgaaactcatgaaccaaa < 2:3801021‑M1/2‑1 (MQ=255) gaacacgtgatttctaacgtgcgtaatgaagtcttacaaattgataattacacgaatcttgcactgaactatttgaaactcatgaaccaaa < 2:3303588‑M1/2‑1 (MQ=255) acgtgatttctaacgtgcgtaatgaagtcttacaaattgataattacacgaatcttgcactgaactatttgaaactcatgaaccaAAAGAc < 2:2884179‑M1/6‑1 (MQ=255) aaTGCAACTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGAc > 2:357829/1‑91 (MQ=255) aTGCAACTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGAcc > 1:3455529/1‑91 (MQ=255) aTGCAACTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGAcc < 2:2604655/91‑1 (MQ=255) atttctaacgtgcgtaatgaagtcttacaaattgataattacacgaatcttgcactgaactatttgaaactcatgaaccaAAAGACCatgt > 1:2540758‑M1/81‑91 (MQ=255) aaCTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCatgt < 1:1039104/91‑1 (MQ=255) aaCTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCatgt < 1:3958139/91‑1 (MQ=255) aaCTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCatgt < 2:1331509/91‑1 (MQ=255) tttctaacgtgcgtaatgaagtcttacaaattgataattacacgaatcttgcactgaactatttgaaactcatgaaccaAAAGACCatgta > 2:3137947‑M1/80‑91 (MQ=255) aCTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCatgta > 2:3686287/1‑91 (MQ=255) tttgtttgATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCatgtatg < 1:3012568/91‑1 (MQ=255) tttgtttgATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCatgtatg < 2:2260890/91‑1 (MQ=255) tctaacgtgcgtaatgaagtcttacaaattgataattacacgaatcttgcactgaactatttgaaactcatgaaccaAAAGACCatgtatg > 2:2963330‑M1/78‑91 (MQ=255) tttgATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCtt > 2:1254521/1‑91 (MQ=255) tttgATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTCTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCtt > 2:3883961/1‑91 (MQ=255) tgatgatgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCtttt > 1:853274/1‑91 (MQ=255) tgatgatgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCtttt < 1:2069818/91‑1 (MQ=255) tgatgatgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCtttt < 1:3720168/91‑1 (MQ=255) atgatgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTgg < 1:58590/91‑1 (MQ=255) gatgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGtt > 1:195427/1‑91 (MQ=255) atgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTc < 1:62357/91‑1 (MQ=255) gaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGCTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCAt < 1:3233594/91‑1 (MQ=255) aaTAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATg < 1:1398705/91‑1 (MQ=255) aaTAAACTGCATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATg < 1:3781110/91‑1 (MQ=255) tAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAg > 1:946420/1‑91 (MQ=255) aCTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGttt > 2:1945882/1‑91 (MQ=255) aCTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGttt > 1:1559862/1‑91 (MQ=255) cTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTc > 1:2687698/1‑91 (MQ=255) tGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCa < 1:3912524/91‑1 (MQ=255) tGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCa < 2:1215865/91‑1 (MQ=255) tGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCa < 2:3185730/91‑1 (MQ=255) gTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCaa < 2:702229/91‑1 (MQ=255) gTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCaa > 1:1253855/1‑91 (MQ=255) gCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGt < 1:1173459/91‑1 (MQ=255) gCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGt > 2:814858/1‑91 (MQ=255) aTAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCCCTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTc > 2:3251363/1‑91 (MQ=255) aTAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTc > 1:1711813/1‑91 (MQ=255) aaCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAg < 1:179477/91‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAg < 1:2618450/91‑1 (MQ=255) aaCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAg < 2:2139298/91‑1 (MQ=255) aCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTAAACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTTAAATAGTTCAGt > 2:175501/1‑91 (MQ=255) gTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGc < 2:185589/91‑1 (MQ=255) gTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGc > 1:3517142/1‑91 (MQ=255) gTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGc < 1:1682464/91‑1 (MQ=255) gTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGc > 1:1870355/1‑91 (MQ=255) ttAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCaa > 2:2193692/1‑91 (MQ=255) aaTCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGa > 2:1676129/1‑91 (MQ=255) aTCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGAt > 1:1339115/1‑91 (MQ=255) aTCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGAt < 1:2491467/91‑1 (MQ=255) aTCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTACAAGAt < 1:3075921/91‑1 (MQ=255) tCAGTGGTTGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCCTGTCTGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGAtt > 2:494521/1‑91 (MQ=255) cAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTc < 2:2828063/91‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCg < 2:3341800/91‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCg < 2:2344918/91‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCg < 1:2937032/91‑1 (MQ=255) tGGTCGAATTAATTCTTCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCgtg > 2:559484/1‑91 (MQ=255) tGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCgtg > 2:645335/1‑91 (MQ=255) ggTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCgtgt < 1:3572658/91‑1 (MQ=255) gTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTa < 2:907158/91‑1 (MQ=255) tCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTaa > 1:339734/1‑91 (MQ=255) aattaattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTa < 1:47450/91‑1 (MQ=255) attaattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTAt > 1:3843169/1‑91 (MQ=255) ttaattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATc > 1:1099020/1‑91 (MQ=255) taattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCa > 2:1371016/1‑91 (MQ=255) attCCTCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATCTCTTTTGGTTCATGAGTTCCAAACAGCTCAGTGCACGCTTCGTGTACTTATCCAt > 2:3495712/1‑91 (MQ=255) attCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCCTTTGGTCCATGAGCTGCAAATAGTTCAGTGCAAGACTCGTGTACTTATCact > 2:2531179/1‑89 (MQ=255) ttCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAAtt > 2:3413406/1‑91 (MQ=255) ttCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAAtt > 1:3141259/1‑91 (MQ=255) tCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAAttt < 2:1607199/91‑1 (MQ=255) cATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTg > 2:11671/1‑91 (MQ=255) aTCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGt < 1:2341362/91‑1 (MQ=255) aTCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGt < 1:3311697/91‑1 (MQ=255) aTCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGt > 2:852769/1‑91 (MQ=255) cTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTaa < 2:934556/91‑1 (MQ=255) tACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAg < 1:1904150/91‑1 (MQ=255) cactcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGAc > 1:1620095/1‑91 (MQ=255) cactcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGAc > 2:3961481/1‑91 (MQ=255) actcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACt > 1:2170556/1‑91 (MQ=255) actcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACt > 1:151750/1‑91 (MQ=255) cactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCa > 1:2817144/1‑91 (MQ=255) cactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCa > 1:2217445/1‑91 (MQ=255) cactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCa > 2:2066229/1‑91 (MQ=255) actTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCAt < 2:2678643/91‑1 (MQ=255) actTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCAt < 1:3633831/91‑1 (MQ=255) actTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCAt < 2:2786209/91‑1 (MQ=255) ttCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTa < 2:1467661/91‑1 (MQ=255) tCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTAc > 1:2022248/1‑91 (MQ=255) tCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATCCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTAc < 1:737020/91‑1 (MQ=255) tCCATAAAGACCATGTATGTCTTTGGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTAc < 1:1004076/91‑1 (MQ=255) ccATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACg > 2:2455752/1‑91 (MQ=255) cATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGc > 1:2737528/1‑91 (MQ=255) aTAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCa < 2:1807948/91‑1 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc < 2:1547456/91‑1 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc < 2:1986350/91‑1 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc < 2:377132/91‑1 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc > 2:1037742/1‑91 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc > 1:808106/1‑91 (MQ=255) | CTCATAATGCAACTTTGTTTGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACG > CP000731/19425‑19605 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |