| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 19515 = | 750 (0.820) | 38 (0.040) | 13/148 | NT | 5.4% | intergenic (‑557/+881) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0024/USA300HOU_pUSA300HOUMR0027 | bacitracin ABC ATP binding cassette transporter, ABC protein/IS431mec transposase |
| ? | CP000731 | 19534 = | 651 (0.770) | intergenic (‑576/+862) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0024/USA300HOU_pUSA300HOUMR0027 | bacitracin ABC ATP binding cassette transporter, ABC protein/IS431mec transposase | |||||
Only 100 of 935 total aligned reads displayed.
TGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTTCAT > CP000731/19444‑19624 | tgatgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGt < 1:1582295/91‑1 (MQ=255) atgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTc < 1:3442529/91‑1 (MQ=255) atgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTc < 2:764439/91‑1 (MQ=255) tgaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCa > 2:1334580/1‑91 (MQ=255) gaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCAt < 1:3518831/91‑1 (MQ=255) gaATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCAt < 1:41224/91‑1 (MQ=255) aaTAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATg < 1:2461403/91‑1 (MQ=255) aaTAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATg < 1:1428013/91‑1 (MQ=255) aaaCTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGACTTTTGGTTCATGAGt > 2:3777886/1‑91 (MQ=255) aCTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGttt > 2:1789342/1‑91 (MQ=255) cTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTc > 1:549237/1‑91 (MQ=255) tGTATCGCATTTCGTTTAATCAGTCGTCGACTTCCTTGATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCa < 2:2864128/91‑1 (MQ=255) tGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCa < 1:754444/91‑1 (MQ=255) tGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCa < 1:842672/91‑1 (MQ=255) tATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCaaa < 2:1114082/91‑1 (MQ=255) aTCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAAt > 2:1743524/1‑91 (MQ=255) aTCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTCGGTTCATGAGTTTCAAAt > 2:1181774/1‑91 (MQ=255) cGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAg < 1:3651484/91‑1 (MQ=255) gCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGt < 1:2755407/91‑1 (MQ=255) gCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGt > 2:1670756/1‑91 (MQ=255) tAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCa > 1:617899/1‑91 (MQ=255) aaCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAg < 2:903112/91‑1 (MQ=255) aCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGt > 1:198861/1‑91 (MQ=255) aCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGt > 1:1032504/1‑91 (MQ=255) aCGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTGCAGt < 1:2593615/91‑1 (MQ=255) aCGTTTAATCAGCGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGTCCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGt > 1:1295751/1‑91 (MQ=255) gTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGc < 1:1682464/91‑1 (MQ=255) gTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGc < 2:456427/91‑1 (MQ=255) tAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAg > 2:1025059/1‑91 (MQ=255) tAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAg > 1:1090380/1‑91 (MQ=255) aTCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGAt < 1:3077199/91‑1 (MQ=255) cAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTc < 2:2827779/91‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCg < 2:2344918/91‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCg < 1:734908/91‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCg < 1:2937032/91‑1 (MQ=255) tGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCgtg > 2:645416/1‑91 (MQ=255) ggTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCgtgt < 1:3572658/91‑1 (MQ=255) gTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTa > 1:2708290/1‑91 (MQ=255) tCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTaa > 2:3324603/1‑91 (MQ=255) cGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAAt < 2:3897096/91‑1 (MQ=255) attaattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTAt > 2:835763/1‑91 (MQ=255) taattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCa > 2:1371016/1‑91 (MQ=255) aattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCaa < 1:2194633/91‑1 (MQ=255) aattCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCaa < 1:2506210/91‑1 (MQ=255) attCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAAt > 1:1757160/1‑91 (MQ=255) ttCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAAtt > 1:2142702/1‑91 (MQ=255) cATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTg > 2:3401911/1‑91 (MQ=255) cATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTg < 1:3850486/91‑1 (MQ=255) tCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTa < 2:1244097/91‑1 (MQ=255) tCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTa > 2:1522806/1‑91 (MQ=255) cTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTaa < 2:3280273/91‑1 (MQ=255) cTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTaa < 2:934556/91‑1 (MQ=255) cTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTGTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTaa < 1:3242257/91‑1 (MQ=255) acacTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGa > 2:3166870/1‑91 (MQ=255) cactcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGAc > 2:2607499/1‑91 (MQ=255) cactcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGAc > 2:2230913/1‑91 (MQ=255) cactcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGAc > 1:1620095/1‑91 (MQ=255) actcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACt < 2:3480907/91‑1 (MQ=255) actcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACt > 1:151750/1‑91 (MQ=255) ctcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACtt > 2:3223167/1‑91 (MQ=255) tcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTc < 2:3594141/91‑1 (MQ=255) tcactTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTc < 2:1460221/91‑1 (MQ=255) catgaaccaaaagacatacatggtctttaTGG‑AAGTGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCa > 1:2379162‑M2/30‑91 (MQ=255) actTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCAt < 2:2678643/91‑1 (MQ=255) actTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCAt < 2:2786209/91‑1 (MQ=255) ctTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTCAGACTTCAtt > 2:2544526/1‑91 (MQ=255) ttCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTa > 2:1973721/1‑91 (MQ=255) ttCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTa > 1:3021363/1‑91 (MQ=255) ttCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTa < 1:3780170/91‑1 (MQ=255) ttCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTa < 1:1881570/91‑1 (MQ=255) tAAATACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc > 2:1596573/1‑91 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc > 2:546196/1‑91 (MQ=255) tAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCAc > 2:2056168/1‑91 (MQ=255) AAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACg > 1:2046384‑M1/1‑91 (MQ=255) GACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTa < 1:1155896‑M1/91‑1 (MQ=255) ACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAg > 1:2831921‑M1/1‑91 (MQ=255) catacatggtctttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGCCTCGTGTAATTATCAACTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGa > 2:3696709‑M2/15‑91 (MQ=255) catacatggtctttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGa > 2:2963330‑M2/15‑91 (MQ=255) cATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGaa < 1:3200498/91‑1 (MQ=255) atacatggtctttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGaa > 1:3308184‑M2/14‑91 (MQ=255) atacatggtctttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGaa > 1:1942437‑M2/14‑91 (MQ=255) tacatggtctttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGaaa > 1:3914638‑M2/13‑91 (MQ=255) atgtatgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGaaa < 1:471825/91‑1 (MQ=255) tgtatgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAAt < 1:3709156/91‑1 (MQ=255) tgtatgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAAt < 1:181964/91‑1 (MQ=255) tgtatgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAAt < 2:3847194/91‑1 (MQ=255) gtatgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATc > 2:3125773/1‑91 (MQ=255) gtatgtCTTTTGGTCCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGCCTTCACTACGCACGTTAGAAATc > 2:2451763/1‑91 (MQ=255) atgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCAc > 1:862204/1‑91 (MQ=255) atgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCAc > 1:120060/1‑91 (MQ=255) atgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCAc > 2:1834559/1‑91 (MQ=255) atgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAACTTGTAAGACTTCATTACGCACGTCAGACATCAc > 2:599257/1‑91 (MQ=255) tgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACg < 1:952857/91‑1 (MQ=255) tgtCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGAAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACg < 1:1002780/91‑1 (MQ=255) ctttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACgtgt > 2:706577‑M2/5‑91 (MQ=255) ttTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTTc > 1:262675‑M2/3‑91 (MQ=255) tTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTTCa < 1:2288265‑M2/90‑1 (MQ=255) tTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTTCa > 1:1350911‑M2/2‑91 (MQ=255) tTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTTCa > 2:2104111‑M2/2‑91 (MQ=255) tGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTtcat > 2:1882397/1‑91 (MQ=255) | TGATGATGAATAAACTGTATCGCATAACGTTTAATCAGTGGTCGAATTAATTCATCTACACTCACTTCCATAAAGACCATGTATGTCTTTTGGTTCATGAGTTTCAAATAGTTCAGTGCAAGATTCGTGTAATTATCAATTTGTAAGACTTCATTACGCACGTTAGAAATCACGTGTTCAT > CP000731/19444‑19624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |