New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 425019 | 196 (0.960) | 13 (0.070) | 10/146 | NT | 6.8% | intergenic (+34/‑392) | USA300HOU_RS01985/gpmA_1 | hypothetical protein/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 425031 | 176 (0.950) | intergenic (+46/‑380) | USA300HOU_RS01985/gpmA_1 | hypothetical protein/2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GGTTCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/424929‑425109 | gTTCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATgg > 2:769331/1‑91 (MQ=255) gTTCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATgg < 2:3537646/91‑1 (MQ=255) ttaaaTTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGc < 2:3739892/88‑1 (MQ=255) ttCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGc > 1:3885383/1‑91 (MQ=255) aTTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTc > 1:1814688/1‑91 (MQ=255) ttATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCa > 1:1215350/1‑91 (MQ=255) tATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAg < 2:2349843/91‑1 (MQ=255) aTCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaa < 1:1065728‑M1/91‑10 (MQ=255) aTCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGt > 2:3139191/1‑91 (MQ=255) aTCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGt < 1:553164/91‑1 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 2:997681/1‑91 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt < 2:561088/91‑1 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 2:1600238/1‑91 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 1:60178/1‑91 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 1:534185/1‑91 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 1:3554475/1‑91 (MQ=255) tCTTAATTGCAATCGTAACGTCAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGtt > 2:197028/1‑91 (MQ=255) ttAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGt < 1:2740260/91‑1 (MQ=255) tAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgcc < 1:2702224‑M1/91‑14 (MQ=255) tAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTc > 1:939598‑M2/1‑90 (MQ=255) aTTGCGATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccat < 2:3210635‑M1/91‑16 (MQ=255) aTTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcat > 1:3078374‑M2/1‑88 (MQ=255) aTTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGATATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcat > 2:226539‑M2/1‑88 (MQ=255) tGCAATCGTAAGGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatct < 2:1647795‑M1/91‑18 (MQ=255) tGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatct < 1:3145308‑M1/91‑18 (MQ=255) tGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatct > 2:599221‑M2/1‑86 (MQ=255) gCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctt < 2:2165344‑M1/91‑19 (MQ=255) gaatCGTAACGTTAATTTTAAGAGGTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTcatcttt > 2:1681171‑M2/2‑84 (MQ=255) aaTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCtttt < 2:3329599/91‑1 (MQ=255) aTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCttttt > 1:133563/1‑91 (MQ=255) aTCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCttttt < 1:729123/91‑1 (MQ=255) gcgTAAAGTTAAGTTTAAGAGATATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatt < 2:1158729‑M1/90‑23 (MQ=255) tAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGacaactgaatgccatctttatttca < 2:1626727‑M1/91‑26 (MQ=255) tAACGTTAATTTTAAGAGCTATGAGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTAtt < 2:3480129/91‑1 (MQ=255) cGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGc > 1:2771681/1‑91 (MQ=255) cGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGc > 2:139296/1‑91 (MQ=255) cGTTAATTTTAAGAGCTATGCGGAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGc < 2:3178948/91‑1 (MQ=255) gTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCg > 1:309492/1‑91 (MQ=255) gTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCg > 2:1826321/1‑91 (MQ=255) gTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCg < 1:1755753/91‑1 (MQ=255) gTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCg > 2:3269745/1‑91 (MQ=255) tAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTg < 1:2407030/91‑1 (MQ=255) ttttAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGaaa < 1:1862389/91‑1 (MQ=255) ttAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAAt < 1:3003872/91‑1 (MQ=255) ttAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAAt < 2:1280748/91‑1 (MQ=255) aaGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATgg > 1:165837/1‑91 (MQ=255) aaGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATgg > 2:477185/1‑91 (MQ=255) agagCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGt > 1:3495869/1‑91 (MQ=255) agagCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGt > 1:1162632/1‑91 (MQ=255) agagCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGt < 2:1085256/91‑1 (MQ=255) agagCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGt > 2:1909436/1‑91 (MQ=255) gCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCaa < 1:3050879/91‑1 (MQ=255) cTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAat > 2:2523239/1‑91 (MQ=255) gCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGt > 1:3865508/1‑91 (MQ=255) cGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGta > 1:1385658/1‑91 (MQ=255) cGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGta < 2:887/91‑1 (MQ=255) tAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGtatt < 1:3809825/91‑1 (MQ=255) ataataAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATtata > 2:1507465/1‑91 (MQ=255) ataataAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATAGTCAATATGTATtata > 2:3032731/1‑91 (MQ=255) aataaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTataat > 1:2640360/1‑91 (MQ=255) aataaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTataat > 2:2789695/1‑91 (MQ=255) ataaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGGGAAAATGGTCAATATGTATTataata < 2:2239699/91‑1 (MQ=255) taaAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAatat < 2:1180493/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAtt > 1:3463023/1‑91 (MQ=255) aaaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAtt < 1:3852725/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATAtt < 2:2537209/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTg > 2:1250186/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGa > 2:1326250/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGa > 2:1327137/1‑91 (MQ=255) aaTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCAGTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGaaa < 2:3553840/91‑1 (MQ=255) aTTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGaaaa < 1:3168141/91‑1 (MQ=255) tCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATg > 1:3523930/1‑91 (MQ=255) cAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGt > 1:372441/1‑91 (MQ=255) cAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGt > 2:1457152/1‑91 (MQ=255) cAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGt < 2:2044393/91‑1 (MQ=255) aaTTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGACAATGTa > 2:2647990/1‑91 (MQ=255) aaTTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTa > 2:2991507/1‑91 (MQ=255) ttGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTaga < 1:3467959/91‑1 (MQ=255) tGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagat > 1:974267/1‑91 (MQ=255) tGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagat < 1:3663790/91‑1 (MQ=255) ggAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagata < 1:1009886/91‑1 (MQ=255) tcgAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTagataagata > 2:1134240/3‑91 (MQ=255) tGAAATATAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAg < 2:3509913/91‑1 (MQ=255) aaaTAAAGATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacg < 2:300990‑M2/91‑69 (MQ=255) aaTAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGAt > 1:224088/1‑91 (MQ=255) aaTAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGAt > 1:2865474/1‑91 (MQ=255) aTAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGAtt > 2:38145/1‑91 (MQ=255) tAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTa > 1:157939/1‑91 (MQ=255) aaaGATGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttttttttttctcatagctcttaaaattaacgttacgattg > 2:917009‑M1/1‑7 (MQ=255) aaaGATGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattt > 2:407695‑M1/1‑7 (MQ=255) gATGGCATTCAGTTGTcatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagttcttaaaattaacgttacgattgcaa < 2:1424020‑M2/91‑76 (MQ=255) gATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATAATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTaaaaa < 2:3415065/91‑1 (MQ=255) aTGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaat < 2:513372‑M1/91‑89 (MQ=255) aTGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaat < 2:74001‑M1/91‑89 (MQ=255) aTGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaat < 2:274144‑M1/91‑89 (MQ=255) tGacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaatt > 2:3323688‑M1/1‑2 (MQ=255) tGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGt > 2:104476/1‑91 (MQ=255) ggCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATACTATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGtc > 2:3921298/1‑90 (MQ=255) ggCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGta > 1:254735/1‑91 (MQ=255) gacaactgaatgccatctttatttcaatttccaattgaatttttttattatttacgcatagctcttaaaattaacgttacgattgcaatta > 1:3278501‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTTCAATTATCTTAATTGCAATCGTAACGTTAATTTTAAGAGCTATGCGTAAATAATAAAAAAATTCAATTGGAAATTGAAATAAAGATGGCATTCAGTTGTCATCTTTTTTATTTGCGTGAAAATGGTCAATATGTATTATAATATTTGAAAATGTAGATAAGATAGGATTAAAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/424929‑425109 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |