BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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   ggaaaGGGGATGACAGTAAAAAATTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTTGTTTATTAATATTAGcaacaa                                                                                         >  2:2299630/4‑91 (MQ=255)

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      aaGGGGATGACAGTAAAAAATTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTGGTTTATTAATATTAGCAACAAATg                                                                                      >  2:2884175/1‑91 (MQ=255)

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            aTGACAGTAAAAAATTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTGGTTTATTAATATTAGCAACAAATGAAGATg                                                                                <  2:1364653/91‑1 (MQ=255)

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                cAGTAAAAAATTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTGGTTTATTAATATTAGCAACAAATGAAGATGCGCt                                                                            >  1:2786898‑M2/1‑90 (MQ=255)

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                 aGTAAAAAATTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTGGTTTATTAATATTAGCAACAAATGAAGATGCGCtt                                                                           <  1:2397198‑M2/91‑3 (MQ=255)

                    aaaaaaTTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTGGTTTATTAATATTAGCAACAAATGAAGATGCGCttgct                                                                        >  1:1078274‑M2/1‑86 (MQ=255)

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                                                                                          acaaATGAAGATGCGCTTGCTAAGGTACATAAAACAATTAATACGCTTAACGCGATAAATGTATCAACTGAAGATACTTATAAAAAGaaaa  >  1:763030/1‑91 (MQ=255)

                                                                                          acaaATGAAGATGCGCTTGCTAAGGTACATAAAACAATTAATACGCTTAACGCGATAAATGTATCAACTGAAGATACTTATAAAAAGaaaa  >  1:883622/1‑91 (MQ=255)

GTGGGTAAGGGGATGACAGTAAAAAATTTATTTTTAGGCTTTGTTGCTGTAATATTAACCGTTTGTTTAATTGGTTTATTAATATTAGCAACAAATGAAGATGCGCTTGCTAAGGTACATAAAACAATTAATACGCTTAACGCGATAAATGTATCAACTGAAGATACTTATAAAAAGAAAA  >  USA300TCH1516_ALE/769694‑769874

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.