New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1676788 | 167 (0.820) | 15 (0.080) | 8/156 | NT | 8.7% | intergenic (‑344/‑75) | ccpN/glyQS | Transcriptional repressor CcpN/Glycine‑‑tRNA ligase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1676835 | 154 (0.780) | intergenic (‑391/‑28) | ccpN/glyQS | Transcriptional repressor CcpN/Glycine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTGGT > USA300TCH1516_ALE/1676746‑1676925 | cGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGc < 1:366488‑M2/91‑2 (MQ=255) aaCTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGtt > 1:1015855/1‑91 (MQ=255) aCTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGttt < 2:1636763/91‑1 (MQ=255) aCTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGttt > 1:3471820/1‑91 (MQ=255) aCTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGttt > 1:2926585/1‑91 (MQ=255) cTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGtttt > 1:3224828/1‑91 (MQ=255) cTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGtttt < 2:2628370/91‑1 (MQ=255) cTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGtttt > 2:3420366/1‑91 (MQ=255) ttagtttGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTc < 1:3557526/87‑1 (MQ=255) ttATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTc > 1:846011/1‑91 (MQ=255) ttATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTc < 2:390391/91‑1 (MQ=255) ttATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTc > 2:3721541/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCAt > 1:2143216/1‑91 (MQ=255) ttttGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATg > 2:3265036/1‑91 (MQ=255) tttGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGt < 2:3411269/91‑1 (MQ=255) ttGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTa < 1:2294397/91‑1 (MQ=255) gTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATg > 2:3655147/1‑91 (MQ=255) gTATTATATACAATTTAAAATATTAAATCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATg > 2:2247078/1‑91 (MQ=255) attatATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGCATgag > 2:3208548/1‑91 (MQ=255) tataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGgaga > 1:2461781/1‑91 (MQ=255) ataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGagag > 1:382753/1‑91 (MQ=255) ataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGagag > 2:1060455/1‑91 (MQ=255) ataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGATTTCATGTATGAGGagag > 2:1436853/1‑91 (MQ=255) taCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAgg < 2:2530424/91‑1 (MQ=255) aCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGt > 2:418207/1‑91 (MQ=255) aTTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAAt > 2:167024/1‑91 (MQ=255) tAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTAt > 1:3163359/1‑91 (MQ=255) tAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTAt > 1:1196372/1‑91 (MQ=255) aaTATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaa < 1:1139153‑M2/91‑33 (MQ=255) aaTATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGc < 2:101267/91‑1 (MQ=255) atTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCaaa < 1:1632684/91‑1 (MQ=255) ttAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCaaaa > 1:2759102/1‑91 (MQ=255) aaCTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGa < 2:1783132/91‑1 (MQ=255) aaCTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGa < 2:2732043/91‑1 (MQ=255) cTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGTGAGGTAATTATGGCAAAAGata > 1:646992/1‑91 (MQ=255) tCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGatat > 1:1555488/1‑91 (MQ=255) tCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGatat < 1:2237258/91‑1 (MQ=255) cGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATg < 1:281234/91‑1 (MQ=255) tCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGa > 2:167981/1‑91 (MQ=255) cccATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGAt < 1:3304741/91‑1 (MQ=255) aTGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACa < 1:3908507/91‑1 (MQ=255) tGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCAGGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACaa < 2:107645/91‑1 (MQ=255) ggAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaa < 1:482146‑M2/91‑51 (MQ=255) ggAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAAt < 1:2726959/91‑1 (MQ=255) ggAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAAt < 2:1271261/91‑1 (MQ=255) ggAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAAt < 2:349699/91‑1 (MQ=255) gAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaac < 1:2071543‑M2/91‑52 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTg < 1:1038215/91‑1 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaaccc < 1:387941‑M2/91‑54 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaaccc < 2:138237‑M2/91‑54 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaaccc < 1:1851882‑M2/91‑54 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGt > 2:2219363/1‑91 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGt > 2:2331765/1‑91 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCACGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGt > 1:3140212/1‑91 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGAcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaaccc < 1:2602455‑M2/91‑54 (MQ=255) gTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACACTTGtt > 2:2471447/1‑91 (MQ=255) gTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGtt < 1:1410615/91‑1 (MQ=255) gTAAAGCATATTGACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatatcttaaattgtatataatacaacataagttacctcttcaacccg < 2:2664253‑M2/91‑55 (MQ=255) acaGCATAGTAAATATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCACCAGATATGGACACAATTGTTTc > 2:3261837/3‑91 (MQ=255) aaaGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTc > 2:901253/1‑91 (MQ=255) aaGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCa < 1:3518772/91‑1 (MQ=255) aGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCAt > 2:2323036/1‑91 (MQ=255) atatTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAg < 2:664629/91‑1 (MQ=255) tatTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGc > 2:3951409/1‑91 (MQ=255) tatTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGc < 2:1999229/91‑1 (MQ=255) tttACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCaa > 1:1497589/1‑91 (MQ=255) tACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGCGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGATTCATTAGCaaaa > 2:1199205/1‑91 (MQ=255) tACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCaaaa > 1:2658244/1‑91 (MQ=255) tACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCaaaa > 2:1973233/1‑91 (MQ=255) cTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGTCGAGGCACTTCTGGCAAGCGATATGGATACAATTGTGTCATTAGCAAAaca > 2:836984/1‑91 (MQ=255) cTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAaca > 2:2446598/1‑91 (MQ=255) cTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAaca < 2:468280/91‑1 (MQ=255) tATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAacac > 1:3093160/1‑91 (MQ=255) tATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAacac > 2:3005860/1‑91 (MQ=255) aTGGTGTTATTTTCCATGGGGCGTTGTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACGATTGTTTCATTAGCAAAAcaca < 2:1308453/91‑1 (MQ=255) aTGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAAcaca < 1:379555/91‑1 (MQ=255) aTGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAAcaca > 2:1517288/1‑91 (MQ=255) tGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACag < 1:3733079/91‑1 (MQ=255) cTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACagag < 1:1616437/91‑1 (MQ=255) cTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACagag > 1:2462608/1‑91 (MQ=255) gTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGt > 1:890870/1‑91 (MQ=255) gTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGt < 2:37276/91‑1 (MQ=255) gTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGt > 2:2807172/1‑91 (MQ=255) tATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGttt < 1:3713633/91‑1 (MQ=255) aTTTTGCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtttt < 2:3202674/91‑1 (MQ=255) aTTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtttt > 2:894731/1‑91 (MQ=255) aTTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTACGAGGCGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAACTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGattt > 2:748531/1‑91 (MQ=255) tttCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTtgt > 2:33574/1‑91 (MQ=255) ttCCATGGGGCGTTTTCAGGTATGCGGAGGGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTtgtg > 1:306921/1‑91 (MQ=255) ccATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGtt > 1:2196025/1‑91 (MQ=255) ccATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGtt < 1:813296/91‑1 (MQ=255) cATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTc < 1:2414415/91‑1 (MQ=255) cATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTc > 1:732545/1‑91 (MQ=255) aTGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTcc > 1:2871729/1‑91 (MQ=255) tGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTccc > 2:158216/1‑91 (MQ=255) ggggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCt < 1:2745220/91‑1 (MQ=255) gggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTg > 2:2722227/1‑91 (MQ=255) gggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTg > 1:1935887/1‑91 (MQ=255) ggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTgg < 2:1708497/91‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTgg > 1:2222382/1‑91 (MQ=255) | CGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTGGT > USA300TCH1516_ALE/1676746‑1676925 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |