New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2067939 | 221 (1.080) | 14 (0.080) | 8/138 | NT | 6.1% | intergenic (+52/‑368) | ppaC/mdlD | putative manganese‑dependent inorganic pyrophosphatase/NAD(P)‑dependent benzaldehyde dehydrogenase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2067962 | 239 (1.360) | intergenic (+75/‑345) | ppaC/mdlD | putative manganese‑dependent inorganic pyrophosphatase/NAD(P)‑dependent benzaldehyde dehydrogenase |
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
AGCATTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCCACAGATTA > USA300TCH1516_ALE/2067872‑2068052 | gCATTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCa < 2:1303655‑M2/91‑2 (MQ=255) gCATTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCa < 1:2334999‑M2/91‑2 (MQ=255) cATTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaa < 1:3851784‑M2/91‑3 (MQ=255) cATTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaa < 1:2569972‑M2/91‑3 (MQ=255) aTTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTGACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaat > 2:3678239‑M2/1‑88 (MQ=255) aaCAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaa > 2:3235727‑M2/1‑85 (MQ=255) aaCAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaa < 1:3949794‑M2/91‑7 (MQ=255) aCAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaac > 1:3469395‑M2/1‑84 (MQ=255) cAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaact < 2:1262185‑M2/91‑9 (MQ=255) cAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaact < 1:3256102‑M2/91‑9 (MQ=255) ataataCTATACTACTGTCTAATCATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAATTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGttt < 2:3024468/91‑1 (MQ=255) taataCTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACCTTCAATGAACTGtttt > 2:841085/1‑91 (MQ=255) aataCTATATTACTGTCTAATTACAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGttttt > 2:3577323/1‑91 (MQ=255) ataCTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGtttttt < 2:3863203/91‑1 (MQ=255) taCTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTttta > 1:1010319/1‑91 (MQ=255) taCTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTttta < 2:2426887/91‑1 (MQ=255) taCTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTttta > 2:1052100/1‑91 (MQ=255) taCTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTttta < 1:1848456/91‑1 (MQ=255) cTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTtttatt > 2:2337316/1‑91 (MQ=255) cTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTtttatt < 1:2615311/91‑1 (MQ=255) tACTGTCTAATTATCGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGAAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGtt > 2:2630529/1‑91 (MQ=255) tACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGtt < 1:1245803/91‑1 (MQ=255) tGTCTAATTATAGACATGTTGTATTGCACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGa < 2:3419046/91‑1 (MQ=255) cTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTa < 2:736787/91‑1 (MQ=255) aaTTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAAt > 2:2479312/1‑91 (MQ=255) aTTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAAtt > 2:402168/1‑91 (MQ=255) aTTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAAtt < 1:1443611/91‑1 (MQ=255) aTTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAAtt > 2:2998684/1‑91 (MQ=255) tataGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTGAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTCTTTACGTTTGACTAATTTa > 2:1893512/1‑91 (MQ=255) tataGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTa > 1:2490035/1‑91 (MQ=255) taGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACa < 2:1640896/91‑1 (MQ=255) taGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACa > 2:2683838/1‑91 (MQ=255) taGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACa > 1:1299237/1‑91 (MQ=255) aGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACaa < 1:2831421/91‑1 (MQ=255) aGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACaa > 2:1387721/1‑91 (MQ=255) aGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACaa < 2:3802333/91‑1 (MQ=255) aGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACaa > 1:1753885/1‑91 (MQ=255) aGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACaa > 1:3907128/1‑91 (MQ=255) gACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAc < 1:442534/91‑1 (MQ=255) gACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAc > 1:2864803/1‑91 (MQ=255) aCATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAcc < 1:522544/91‑1 (MQ=255) aCATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAcc > 1:2911183/1‑91 (MQ=255) cATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAccc > 2:225282/1‑91 (MQ=255) cATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAccc > 1:2977245/1‑91 (MQ=255) cATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAAccc > 1:1586201/1‑91 (MQ=255) aTGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCt > 1:238853/1‑91 (MQ=255) ttgtATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCtttt > 2:3107307/1‑91 (MQ=255) aTTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCaa > 2:3304074/1‑91 (MQ=255) aTTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCaa > 1:734158/1‑91 (MQ=255) ttAACTAACAGTTCATTAAAGTAGTATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAta < 2:3680629/91‑1 (MQ=255) ttAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAta > 2:1161498/1‑91 (MQ=255) taactaacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAtag < 1:3819650/91‑1 (MQ=255) taactaacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAtag < 1:2426502/91‑1 (MQ=255) actaacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAtagta > 1:1550412/1‑91 (MQ=255) actaacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAtagta > 1:3663392/1‑91 (MQ=255) actaacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAtagta > 2:2572341/1‑91 (MQ=255) ctaacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAAtagtag > 2:1365874/1‑91 (MQ=255) taacAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATagtagt < 2:537552/91‑1 (MQ=255) cAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGtttt < 2:663126/91‑1 (MQ=255) cAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGtttt > 1:725977/1‑91 (MQ=255) cAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGtttt < 2:2114371/91‑1 (MQ=255) cAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTAGTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGtttt < 2:1182097/91‑1 (MQ=255) aGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaactgctagttaaatacaacatgtctataattagacagtaatatagtattattttg < 2:3258050‑M2/91‑61 (MQ=255) gTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaactgttagttaaatacaacatgtctataattagacagtaatatagtattattttgt < 2:2955001‑M2/91‑62 (MQ=255) gTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTa < 2:371900/91‑1 (MQ=255) ttCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTAt > 1:567410/1‑91 (MQ=255) tCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTTTTTTTTTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTAtt > 2:1119331/1‑91 (MQ=255) cATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTc > 2:518337/1‑91 (MQ=255) aTTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTcc < 2:1743673/91‑1 (MQ=255) ttAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCt > 1:588762/1‑91 (MQ=255) tAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACTCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCtt > 2:3606264/1‑91 (MQ=255) aaaGTAGAATTTATTTCACTTTCaatgaactgttagttaaatacaacatgtctataattagacagtaatatagtattattttgttaatgct < 1:3183015‑M2/91‑69 (MQ=255) aaaGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCttt > 1:2358212/1‑91 (MQ=255) aaaGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCttt > 2:2808640/1‑91 (MQ=255) aaGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTTTTTTTTTTTTACTATTTTACAACCCTTTTTCATTTGTTGTTTTTTTTTCtttt > 2:1551843/1‑90 (MQ=255) aaGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCC‑TTTTCAATAGTAGTTTTTAGTCCTTTAg > 1:2131316/1‑91 (MQ=255) aGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAg > 1:932236/1‑91 (MQ=255) gTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATTTTTGTTTTTATTCCTTTAGc > 2:766581/1‑91 (MQ=255) gTAGAATGTATGGCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTAGTCCTTTAGc < 2:2533356/91‑1 (MQ=255) tAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCt < 1:86881/91‑1 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCaatgaactgttagttaaatacaacatgtctataattagacagtaatatagtattattttgttaatgcttcagtg < 1:2550388‑M2/91‑75 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCaatgaactgttagttaaatacaacatgtctataattagacagtaatatagtattattttgttaatgcttcagtg < 1:270951‑M2/91‑75 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTATTTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAc > 2:1317289/1‑91 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAc > 1:984560/1‑91 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAc > 1:1992613/1‑91 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAc > 1:2788283/1‑91 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAc > 1:3506851/1‑91 (MQ=255) gAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTCTTATTCCTTTAGCTAc > 2:1455340/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAcc > 2:274285/1‑91 (MQ=255) aaTTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTAcc < 2:3141009/91‑1 (MQ=255) aaTTTATTTCACTTTCAATGAACTGGTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTGTTTCAATAGTAGGTTTTATTCCTTTAGCTGcc > 1:1174943/1‑91 (MQ=255) ttatttCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTa > 2:2024017/1‑91 (MQ=255) tttCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAAcc < 2:3869486/91‑1 (MQ=255) ttCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACACATAATCAATAGTAGTTTTCATGCCTTTAGCTACGCTATccg < 2:579133/91‑2 (MQ=255) tCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCca > 2:2218449/1‑91 (MQ=255) tCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCca < 2:2693629/91‑1 (MQ=255) tCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTGTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCca < 2:1509400/91‑1 (MQ=255) cACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCcac > 1:3638249/1‑91 (MQ=255) cTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCCACAg > 2:1603494/1‑91 (MQ=255) ttCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCCACAGAt > 1:1267582/1‑91 (MQ=255) | AGCATTAACAAAATAATACTATATTACTGTCTAATTATAGACATGTTGTATTTAACTAACAGTTCATTAAAGTAGAATTTATTTCACTTTCAATGAACTGTTTTTTATTTACGTTTGACTAATTTACAACCCTTTTTCAATAGTAGTTTTTATTCCTTTAGCTACCCTAACCCACAGATTA > USA300TCH1516_ALE/2067872‑2068052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |