| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 441303 | 155 (0.760) | 24 (0.130) | 12/142 | NT | 13.8% | intergenic (+20/+93) | guaA/USA300HOU_RS02075 | GMP synthase [glutamine‑hydrolyzing]/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 441313 | 163 (0.900) | intergenic (+30/+83) | guaA/USA300HOU_RS02075 | GMP synthase [glutamine‑hydrolyzing]/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CGTCAACCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATTCATCAATAAG > USA300TCH1516_ALE/441223‑441403 | tCAACCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGgg > 2:2246401‑M2/1‑89 (MQ=255) tCAACCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGgg > 2:2569771‑M2/1‑89 (MQ=255) tCAACCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGAAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGgg > 1:2827597‑M2/1‑89 (MQ=255) aaCCGCGTAGTCTGTGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAAATGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtg > 1:3962914‑M2/1‑87 (MQ=255) aaCCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtg < 1:2349967‑M2/91‑5 (MQ=255) aCCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtgg < 2:1763688‑M2/91‑6 (MQ=255) aCCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtgg > 2:2085135‑M2/1‑86 (MQ=255) ccGCGTAGTCTATGACATTACATCAAGACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggt > 1:1243609‑M2/1‑85 (MQ=255) ccGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggt > 2:1645395‑M2/1‑85 (MQ=255) ccGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggt > 2:818479‑M2/1‑85 (MQ=255) ccGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggt < 1:707044‑M2/91‑7 (MQ=255) cgcgTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggtt < 1:1012552‑M2/91‑8 (MQ=255) cgcgTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggtt > 1:657890‑M2/1‑84 (MQ=255) cgcgTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggtt < 1:1101328‑M2/91‑8 (MQ=255) gcgTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggttt > 1:2020012‑M2/1‑83 (MQ=255) gcgTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGggtggttt > 1:1753587‑M2/1‑83 (MQ=255) gTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAAt < 1:886061/91‑1 (MQ=255) gTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAAt > 2:2500070/1‑91 (MQ=255) tCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAAtt < 1:2712758/91‑1 (MQ=255) tCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAAtt < 1:1852153/91‑1 (MQ=255) cTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAAttt < 1:592042/91‑1 (MQ=255) cATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGagtag > 1:512596/1‑91 (MQ=255) cATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGagtag < 1:3954672/91‑1 (MQ=255) ttACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGtt < 1:2669950/91‑1 (MQ=255) tACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTAGAGTAGTTg < 1:1979460/91‑1 (MQ=255) aCATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTgg > 1:735704/1‑91 (MQ=255) aCATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTgg > 1:2615514/1‑91 (MQ=255) aCATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTgg < 2:3677516/91‑1 (MQ=255) aTCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGaa > 2:3203296/1‑91 (MQ=255) tCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGaaa < 2:1907674/91‑1 (MQ=255) tCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGaaa > 2:2417663/1‑91 (MQ=255) tCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGaaa > 1:2093068/1‑91 (MQ=255) tCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGaaa > 1:2868722/1‑91 (MQ=255) aaCCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTa > 1:1282822/1‑91 (MQ=255) accaccAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTAc < 1:470406/91‑1 (MQ=255) accaccAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTAc > 1:2643796/1‑91 (MQ=255) caccaAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACaa > 2:2850090/1‑91 (MQ=255) ccaAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATa > 2:1266967/1‑91 (MQ=255) ccaAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATa > 2:115964/1‑91 (MQ=255) ccaAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATa > 2:2876132/1‑91 (MQ=255) caAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATaa > 2:1705059/1‑91 (MQ=255) aaGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAg > 2:1511940/1‑91 (MQ=255) aGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAgg > 1:1879742/1‑91 (MQ=255) aGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAgg > 2:3177883/1‑91 (MQ=255) gCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGa > 1:3750376/1‑91 (MQ=255) cacaATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGAc < 1:3546398/91‑1 (MQ=255) cacaATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGAc < 2:1347388/91‑1 (MQ=255) aaTTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCTCCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGa < 1:1793774/91‑1 (MQ=255) aTTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGaa > 1:240851/1‑91 (MQ=255) aTTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGaa > 2:2811031/1‑91 (MQ=255) ttGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGaaa < 2:197100/91‑1 (MQ=255) ttGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGaaa < 1:2287583/91‑1 (MQ=255) ttGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGaaa < 1:989022/91‑1 (MQ=255) gTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAggg > 2:571070/1‑91 (MQ=255) gTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGGGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAggg > 1:1812589/1‑91 (MQ=255) tGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAgggg < 2:3764968/91‑1 (MQ=255) gggAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGt > 1:1789291/1‑91 (MQ=255) ggAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTa > 2:1453011/1‑91 (MQ=255) aataatTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGTAAAAGGGGTAAg < 1:3040499/91‑1 (MQ=255) ttATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGCCAAGGGGTAAGGCGtt > 2:709316/1‑91 (MQ=255) ttATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGtt > 1:1084393/1‑91 (MQ=255) tatatataATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTc < 2:3492698/91‑1 (MQ=255) tatatataATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGGTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGGAAGGTGTTc > 2:3551432/1‑91 (MQ=255) atatataATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCt > 1:3760600/1‑91 (MQ=255) tatataATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTa > 2:27693/1‑91 (MQ=255) atataATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTaa > 1:300860/1‑91 (MQ=255) atataATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTaa > 1:3354582/1‑91 (MQ=255) taataaAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGtt < 2:2316643/91‑1 (MQ=255) taataaAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGtt > 1:3478370/1‑91 (MQ=255) aataaAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGttt < 2:431231/91‑1 (MQ=255) ataaAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTg > 2:1545132/1‑91 (MQ=255) ataaAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTg < 1:3150971/91‑1 (MQ=255) taaAACCACCTGTTTGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggttttgatgtaatatcatagactac < 1:3626438‑M2/91‑72 (MQ=255) ataaCCGCCTGTTTGCACGGGTGGTTTGTAAGTTGAGCAGTTGGAACATTAAGAGCAGGACGGAATAGGGGTAAGCTGTTCTAAGTTTTCg < 2:3337874/89‑1 (MQ=255) aaaaCCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCg < 1:2905614/91‑1 (MQ=255) aaCCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGtt < 1:3487124/91‑1 (MQ=255) aaCCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAAAAAAAAAAAAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGtt < 2:2930444/91‑1 (MQ=255) accaccTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGttt > 1:2254376/1‑91 (MQ=255) ccaccTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGtttt > 1:3654630/1‑91 (MQ=255) ccaccTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGtttt > 1:219151/1‑91 (MQ=255) caccTGTTTGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggtcttgatgtaatgtcatagactacgcggtt < 2:2385876‑M2/91‑78 (MQ=255) accTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTaa > 2:88950/1‑91 (MQ=255) accTGTTTGCACGGGTGGGTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTag > 2:629106/1‑90 (MQ=255) accTGTTTGCACGGGTGGCTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTaa < 2:230960/91‑1 (MQ=255) cTGTTTGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggttttgatgtaatgtcatagactacgcggttgac < 2:3081846‑M2/91‑81 (MQ=255) tGTTTGTACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtc > 1:3072677/1‑91 (MQ=255) tGTTTGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggttttgatgtaatgtcatagactacgcggttgacg < 2:2621064‑M2/91‑82 (MQ=255) tGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAATGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtc < 2:3880797/91‑1 (MQ=255) tGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtc < 2:2278353/91‑1 (MQ=255) tGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtc > 2:2459050/1‑91 (MQ=255) gTTTGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggttttgatgtaatgtcatagactacgcggttgacgt < 1:392533‑M2/91‑83 (MQ=255) tttGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggttttgatgtaatgtcatagactacgcggttgacgtg < 2:2259442‑M2/91‑84 (MQ=255) tttGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtcaa > 2:3930501/1‑90 (MQ=255) ttGCACGggtggttttattatatataattattcccactcaattgtgcttggtggttttgatgtaatgtcatagactacgcggttgacgtga < 2:2367648‑M2/91‑85 (MQ=255) ttGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtcatc > 2:3306300/1‑91 (MQ=255) tGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATtcatca < 2:3262852/91‑1 (MQ=255) gCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATTCATCaa > 1:1562285/1‑91 (MQ=255) cACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATTCATCAAt > 2:172357/1‑91 (MQ=255) cGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATTCATCAATaa < 1:2716095/91‑1 (MQ=255) cGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGCGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATTCATCAATaa > 1:1150463/1‑91 (MQ=255) | CGTCAACCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAATAAAACCACCTGTTTGCACGGGTGGTTTTTAATTTGAGTAGTTGGAAAATTACAATAAGGACGGAAAAGGGGTAAGGTGTTCTAAGTTTGCGTTTTAATTCATCAATAAG > USA300TCH1516_ALE/441223‑441403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |