| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 580753 | 144 (0.710) | 13 (0.080) | 7/130 | NT | 9.6% | intergenic (+47/‑34) | USA300HOU_RS02805/sigH | hypothetical protein/RNA polymerase sigma‑H factor |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 580772 | 129 (0.780) | intergenic (+66/‑15) | USA300HOU_RS02805/sigH | hypothetical protein/RNA polymerase sigma‑H factor | |||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
ACGAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGT > USA300TCH1516_ALE/580682‑580862 | cGAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGg > 1:1885439‑M2/1‑90 (MQ=255) gAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAATTTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGgg > 2:3482931‑M2/1‑89 (MQ=255) gAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGgg < 1:28190‑M2/91‑3 (MQ=255) gAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGgg > 2:121356‑M2/1‑89 (MQ=255) gAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGgg > 2:300014‑M2/1‑89 (MQ=255) gAAGAGGACATCATAAGAAATGACAGTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGgg > 2:2388276‑M2/1‑89 (MQ=255) aaGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggt > 1:810698‑M2/1‑88 (MQ=255) aaGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggt < 2:2675987‑M2/91‑4 (MQ=255) agagGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggtt > 1:2997777‑M2/1‑87 (MQ=255) gagGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggtta > 2:2562847‑M2/1‑86 (MQ=255) ttgcattgttacgtttgattgtactgtcttgagttgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAg > 2:2953420‑M1/52‑91 (MQ=255) gACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtt > 1:1051412‑M2/1‑83 (MQ=255) cattgttacgtttgattgtactgtcttgagttgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGttt > 1:2045403‑M1/49‑91 (MQ=255) cattgttacgtttgattgtactgtcttgagttgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGttt > 1:3039504‑M1/49‑91 (MQ=255) cattgttacgtttgattgtactgtcttgagttgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGttt > 1:2114658‑M1/49‑91 (MQ=255) acggcatAAGAAAGGACATTTCCGTCATCGTGAAATTTTGGATGTAACAATATTAAACTAACCTAAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGgtt < 2:2243024/87‑1 (MQ=255) cttgttacgtttgattgtactgtcttgagttgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTa > 2:3927729‑M1/48‑91 (MQ=255) catcatAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagttta < 1:3342630‑M2/91‑11 (MQ=255) catcatAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagttta > 2:487309‑M2/1‑81 (MQ=255) ttgttacgtttgattgtactgtcttgagttgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTaa > 1:139765‑M1/47‑91 (MQ=255) atcatAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaa > 1:975215‑M2/1‑80 (MQ=255) atcatAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaa > 1:2940779‑M2/1‑80 (MQ=255) catAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaata < 2:3417624‑M2/91‑14 (MQ=255) catAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATCTTAGATAGAAGGggttagtttaata < 2:2893248‑M2/91‑14 (MQ=255) aaGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAAATTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATAttt < 2:3256011/91‑1 (MQ=255) aGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTg > 2:1351128/1‑91 (MQ=255) gAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTATATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGa < 2:3277606/91‑1 (MQ=255) aaaTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGaa > 2:2714265/1‑91 (MQ=255) aaaTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGaa < 2:2376772/91‑1 (MQ=255) aaTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGaaa < 2:1769880/91‑1 (MQ=255) aTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAAt < 2:1873785/91‑1 (MQ=255) aTGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAAt < 2:849172/91‑1 (MQ=255) tGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATa < 1:3605977/91‑1 (MQ=255) tGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATa > 2:3734375/1‑91 (MQ=255) gattgtactgtcttgaattgtcaaatcgtatttcaAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATa > 2:3041195‑M1/36‑91 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg > 1:2290495/1‑91 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg < 1:1194414/91‑1 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg > 2:417415/1‑91 (MQ=255) aCATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACg < 1:2926588/91‑1 (MQ=255) cATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATGAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGa > 1:3152711/1‑91 (MQ=255) aTTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGAt < 2:591130/91‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGAt < 2:2785180/91‑1 (MQ=255) cGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGAc < 2:182687/91‑1 (MQ=255) cGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGAc < 1:2656612/91‑1 (MQ=255) aTCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACt > 2:1133630/1‑91 (MQ=255) cTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCa < 1:1906872/91‑1 (MQ=255) gAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGa > 2:3589591/1‑91 (MQ=255) aaaTTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGAc > 2:2045984/1‑91 (MQ=255) aaaTTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGAc < 1:977647/91‑1 (MQ=255) ttttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGt > 1:89933/1‑91 (MQ=255) ttttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGt < 1:1648660/91‑1 (MQ=255) tttGAATGTAACAATATTAAACTATCCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTa < 2:3664280/91‑1 (MQ=255) tttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTa < 1:51655/91‑1 (MQ=255) tttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTa < 1:3745382/91‑1 (MQ=255) ttGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTAc < 1:3094712/91‑1 (MQ=255) tGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACa > 1:1925765/1‑91 (MQ=255) tGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACa > 2:1589664/1‑91 (MQ=255) aTGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATc < 1:3233326/91‑1 (MQ=255) tGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCa < 2:280674/91‑1 (MQ=255) tGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCa < 2:380752/91‑1 (MQ=255) gTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCaa < 1:747454/91‑1 (MQ=255) tAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCaaa > 1:482987/1‑91 (MQ=255) tAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCaaa < 1:1365175/91‑1 (MQ=255) aaCAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAAc < 1:2171534/91‑1 (MQ=255) aaCAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAAc > 2:444757/1‑91 (MQ=255) aCAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACg > 1:2243451/1‑91 (MQ=255) aCAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACg < 1:167427/91‑1 (MQ=255) AATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTa > 2:3889890‑M1/1‑91 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCGAACGTaa < 1:1970772‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTaa < 1:2492824‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTaa > 1:2685793‑M1/1‑91 (MQ=255) ATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACATaa < 1:3065090‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACa < 2:1689604‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACa > 2:242476‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACa < 1:135071‑M1/91‑1 (MQ=255) TTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACaa > 1:2548027‑M1/1‑91 (MQ=255) tcAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGCTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACACTCAAACGTAACAAt < 2:546260‑M1/89‑1 (MQ=255) tAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaatattgttacattcaaaatttcaagatgacggaaatgtcatttcttatgatg < 1:2851446‑M2/91‑63 (MQ=255) TAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAAt < 2:1712688‑M1/91‑1 (MQ=255) aCTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaatattgttacattcaaaatttcaagatgacggaaatgtcatttcttatgatgtcc < 1:3877923‑M2/91‑66 (MQ=255) ACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCa > 1:2674259‑M1/1‑91 (MQ=255) aaCCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaatattgttacattcaaaatttcaagatgacggaaatgtcatttcttatgatgtcctct < 2:1219409‑M2/91‑69 (MQ=255) AACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATa > 2:2126786‑M1/1‑91 (MQ=255) aCCTTAAATTTTAGATAGAAGGggttagtttaatattgttacattcaaaatttcaagatgacggaaatgtcatttcttatgatgtcctctt < 1:771415‑M2/91‑70 (MQ=255) ACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAGTaa < 1:3553849‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATaaa < 1:1077275‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATaaa < 1:704296‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAAt > 2:2450436‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATaa > 2:1925858/1‑91 (MQ=255) aTTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATaa < 2:1468646/91‑1 (MQ=255) ttAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGa < 1:96124/91‑1 (MQ=255) tagatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGAc < 1:1168686/91‑1 (MQ=255) agatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACt > 1:3530217/1‑91 (MQ=255) agatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACt < 1:454033/91‑1 (MQ=255) gatagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACtt < 2:2136007/91‑1 (MQ=255) tagaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCg > 1:2453560/1‑91 (MQ=255) agaAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGa > 1:1752806/1‑91 (MQ=255) aGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTCACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGaaaa > 2:1074587/1‑91 (MQ=255) aGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGaaaa > 1:2643450/1‑91 (MQ=255) aGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGGAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGaaaa > 1:3363489/1‑91 (MQ=255) | ACGAAGAGGACATCATAAGAAATGACATTTCCGTCATCTTGAAATTTTGAATGTAACAATATTAAACTAACCTTAAATTTTAGATAGAAGGGGTTAGTTTAATATTTGAAATACGATTTGACAACTCAAGACAGTACAATCAAACGTAACAATGCAATAAATGATAAAGACTTCGAAAAGT > USA300TCH1516_ALE/580682‑580862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |