| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2431245 = | 103 (1.050) | 3 (0.030) | 3/276 | 11.6 | 3.2% | coding (285/693 nt) | birA_2 | Bifunctional ligase/repressor BirA |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2431338 = | 83 (0.910) | coding (378/693 nt) | birA_2 | Bifunctional ligase/repressor BirA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTATCAGCCTTATTTTTAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTTGTG > USA300TCH1516_ALE/2431191‑2431484 | aTTATCAGCCTTATTTTTAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATAtt < 1:825581/148‑1 (MQ=255) tCAGCCTTATTTTTAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAAt < 1:402992/148‑1 (MQ=255) cccgctgtATGTTTAGTGCGTAATGAAAGTCAGGCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAACCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAAt < 1:466807/141‑1 (MQ=255) ccatccTTATTTTTACTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCACCGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAAt < 2:973028/144‑1 (MQ=255) cAGCCTTATTTTTAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAACCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAAtt < 1:382848/148‑1 (MQ=255) gtttttAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGac < 2:604541/147‑1 (MQ=255) aTTTTTAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGac > 1:862227/1‑148 (MQ=255) ttttAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGacac < 2:720994/148‑1 (MQ=255) ttttAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGacac < 2:16556/148‑1 (MQ=255) tAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGAcacaca < 2:638016/148‑1 (MQ=255) tAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGAcacaca < 2:468796/148‑1 (MQ=255) aGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCAGACAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACacaa < 1:922492/148‑1 (MQ=255) gtccTTAATCAAACTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACacaac < 1:837622/145‑1 (MQ=255) gTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAACCACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACacaac < 1:344775/148‑1 (MQ=255) atGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACATGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACacaac < 1:658427/147‑1 (MQ=255) gCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACat > 2:925309/1‑148 (MQ=255) ttACTGAAAGCCAGGCGTACTCGACATTACCATACAAATGCTAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACatat < 2:769194/148‑1 (MQ=255) ttAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACatat < 1:273788/148‑1 (MQ=255) ttAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACatat < 1:878447/148‑1 (MQ=255) ttAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAACTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACatat < 1:719841/148‑1 (MQ=255) aaTGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACCCAACATATGa > 2:317787/1‑148 (MQ=255) tGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGaca > 1:185891/1‑148 (MQ=255) gAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGacac > 1:915612/1‑148 (MQ=255) gAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGacac > 1:371692/1‑148 (MQ=255) aaaGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACt < 2:649865/148‑1 (MQ=255) aaGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTc > 2:424597/1‑148 (MQ=255) cATTACCATATAAAGGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCGAATGCTGTTTTCCGa > 1:620810/1‑148 (MQ=255) tataAAAGCGAAATGAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTaa < 2:306192/148‑1 (MQ=255) aaaaGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACCTTTTAAttt > 2:408277/1‑148 (MQ=255) aaaaGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGATTAAACGCATGAACTTTTATATTAAATTTGATAACACACAACATAGGACACGCCCAAGACTATTTTCCGACATTTTAAttt > 2:933934/1‑148 (MQ=255) aaaaGCGAAATCAACGCAATCATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAAttt < 1:10923/148‑1 (MQ=255) aaaGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTa > 2:574388/1‑148 (MQ=255) aGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTAtt < 2:340293/148‑1 (MQ=255) aGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTAtt < 2:531966/148‑1 (MQ=255) gCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTGTAATTTAttt > 2:893261/1‑147 (MQ=255) gCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATAGCTTAAACGCATGGACTATAATATTAAATTAGATGACACCCAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCTACATTTTAATTTAttt > 2:322318/1‑147 (MQ=255) cGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGt < 1:173230/148‑1 (MQ=255) aaaTCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACAAACACCATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTAAATTTATTGTaa > 1:509438/1‑147 (MQ=255) aaaTCAACGCAATTATAAAACAACGTATAAGTCTTCCACAAACACACTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTAc > 1:555102/1‑148 (MQ=255) aTCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAg < 1:375222/148‑1 (MQ=255) aaCGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAAc < 2:370437/148‑1 (MQ=255) aaCGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTGTTCCAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTAGTGTACAGAAc < 2:450853/148‑1 (MQ=255) gCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGaa > 2:161199/1‑148 (MQ=255) gCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGaa > 2:161218/1‑148 (MQ=255) gCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATATTAATTTATTGTACAGAACGaa > 2:201368/1‑148 (MQ=255) gCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACAGTTTAATTTATTGTACAGAACGaa > 1:925751/1‑148 (MQ=255) aaaaCAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACACATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACACAATATGACACTCCCAATGATGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGACCGAAAtgtgctt > 2:220668/1‑145 (MQ=255) aaCAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGtt < 2:19615/148‑1 (MQ=255) aaCAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATAGAACACCCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATAAATTGTACAGAACGAAATGTGATGtt > 1:286872/1‑148 (MQ=255) aCAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTta > 1:986102/1‑148 (MQ=255) aCAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTta > 1:124157/1‑148 (MQ=255) cAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTCTTGTACCGAACGAAATGTGATGTtag > 2:243078/1‑148 (MQ=255) gTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGa < 2:605525/148‑1 (MQ=255) gTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGa < 2:923706/148‑1 (MQ=255) ttAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTtagta < 1:101920/144‑1 (MQ=255) ttAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTtagta > 2:101920/1‑144 (MQ=255) gTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAg < 1:890472/148‑1 (MQ=255) gTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAg > 1:445272/1‑148 (MQ=255) ccACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTtg > 1:749398/1‑148 (MQ=255) ccACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACAATCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATGATAGAGAACGAAATGTGATGTTACTAGATAATAGGGGtg > 1:921880/1‑148 (MQ=255) caccAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTtga < 2:424832/148‑1 (MQ=255) caAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTtgatg < 2:900488/148‑1 (MQ=255) caAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTtgatg < 1:82174/148‑1 (MQ=255) aaCACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTgatgat > 1:699843/1‑148 (MQ=255) aaCACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGGTAGTAGATCATAGGGCTgattat > 1:244252/1‑148 (MQ=255) acacGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGata < 1:177037/148‑1 (MQ=255) acacGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATAATAGGGTTAATGata > 2:583558/1‑148 (MQ=255) acacGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGAACATAGGGTTGATGata > 2:306096/1‑148 (MQ=255) cacGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAAATCATAGGGTTGATGataa > 2:871819/1‑148 (MQ=255) aaGAAAATTGCTTAAACGCATTGACTATTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATCTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGCTGATAATATTaaa > 1:647022/1‑148 (MQ=255) aaGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTaaa > 2:756839/1‑148 (MQ=255) aaaaTTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGcg > 1:144730/1‑147 (MQ=255) aaaTTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTg > 2:155403/1‑148 (MQ=255) gCTTAAACGCATGGTCTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACCTATGACACTCCCAATGCTGTTGTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGAGGATAATATTAAAGCTGAAAAc < 2:609598/148‑1 (MQ=255) cTTAAACGCATGTACTTTTATATTAAATTTGATTACACAAAACATCTGTCACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAACTGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACg < 1:438793/148‑1 (MQ=255) cTTAAACGCATGTACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACg < 1:903728/148‑1 (MQ=255) cTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACg < 1:363382/148‑1 (MQ=255) cTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACg < 2:339997/148‑1 (MQ=255) ttAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTCGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGt < 2:954293/148‑1 (MQ=255) ttAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATGTTAAAGCTGAAAACGt < 2:862227/148‑1 (MQ=255) gCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGCGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTAtatt < 2:620810/148‑1 (MQ=255) gCATGGACTTTTACATTAAATTTAATAACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTAtatt < 1:424597/148‑1 (MQ=255) ggACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAGCGTTAtatttatt > 2:715213/1‑148 (MQ=255) ttATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCtt > 1:957448/1‑148 (MQ=255) ttATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCtt < 2:398080/148‑1 (MQ=255) ttAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTtgtg < 1:582178/148‑1 (MQ=255) ttAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTtgtg > 1:183921/1‑148 (MQ=255) ttAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTtgtg < 1:582006/148‑1 (MQ=255) ttAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTtgtg < 2:480250/148‑1 (MQ=255) ttAAATTTGATGAAACAAAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTtgtg < 1:406753/148‑1 (MQ=255) | ATTATCAGCCTTATTTTTAGTGCTTAATGAAAGTCAGTCGTACTCGACATTACCATATAAAAGCGAAATCAACGCAATTATAAAACAATGTTTAAGTCTTCCACAAACACGCTTAAGAAAATTGCTTAAACGCATGGACTTTTATATTAAATTTGATGACACACAACATATGACACTCCCAATGCTGTTTTCCGACATTTTAATTTATTGTACAGAACGAAATGTGATGTTAGTAGATCATAGGGTTGATGATAATATTAAAGCTGAAAACGTTATATTTATTGGCCTTTTGTG > USA300TCH1516_ALE/2431191‑2431484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |