| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1307 total aligned reads displayed.
TTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAA > CP000731/1475‑1771 | tACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGAGAGAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTTTGTTACAAAGTGCTGACCTATTTTTGTGATAAAAACTGTCTGTCGTGTCACACCAGGGTTACACTACAg > 2:1102063/1‑149 (MQ=17) aCCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGc > 1:1469017/1‑149 (MQ=255) cggaaTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCtt < 1:1503573/146‑1 (MQ=255) cGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCtt 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aTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGGCCCTACAGCTTTGTa > 1:63221/1‑149 (MQ=255) aTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTa < 2:1618546/149‑1 (MQ=255) ttGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATg > 1:1723300/1‑149 (MQ=255) ttGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATg < 2:78169/149‑1 (MQ=255) aaTTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGatct > 2:1878158/1‑147 (MQ=255) aTTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATc < 1:136763/149‑1 (MQ=255) tttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGTCAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCa < 1:175198/149‑1 (MQ=255) tttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACACAAGTGTGAAACTGCAGCTTTGTGTGATATCa > 2:1051890/1‑149 (MQ=255) tttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCa < 1:85725/149‑1 (MQ=255) tCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATccct > 1:109348/1‑146 (MQ=255) 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tCACAAAATTGTGACACTACAGCTTGGGATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAt > 2:478948/1‑149 (MQ=255) tCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAt > 1:1954792/1‑149 (MQ=255) tCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAt > 2:916254/1‑149 (MQ=255) cacaAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGCTATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATGTTAGAGGTAAATTAAAAtt > 2:303032/1‑149 (MQ=255) acaAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAttt > 2:1658258/1‑149 (MQ=255) acaAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAAttt < 2:153636/149‑1 (MQ=255) aaaaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACAGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCt > 2:747835/1‑149 (MQ=255) aaaaGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCACTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTTAATTAAAAGTTCt > 2:1443832/1‑149 (MQ=255) tgtgACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAACTTTCCCTTATTATCTTACGGAGATTTTAGAGCTAAATTAAAATTTCTAAGtt > 2:680499/1‑149 (MQ=255) cTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGACTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATa < 1:1985319/149‑1 (MQ=255) aGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGaa > 1:1442031/1‑149 (MQ=255) | TTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGATAACTGATGTCTTTTTTTATTGTTTTTCTGTAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAGTGTGACACTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAACTTAAAACCCTTGGAATGTCTGGCCTTGCCAGATCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTTCCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGTTAAATTAAAATTTCTAAGTTTTTGATAAGAA > CP000731/1475‑1771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |