| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 418185 = | 170 (1.000) | 5 (0.030) | 4/280 | 13.6 | 2.8% | intergenic (+38/+48) | ychF/USA300HOU_RS01930 | Ribosome‑binding ATPase YchF/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 418213 = | 186 (1.160) | intergenic (+66/+20) | ychF/USA300HOU_RS01930 | Ribosome‑binding ATPase YchF/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GTACAATATGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCT > USA300TCH1516_ALE/418037‑418333 | gTACAATATGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATTGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTaga < 1:1255413/149‑1 (MQ=255) atatGGTGTGGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCAGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAgg < 2:1090297/149‑1 (MQ=255) atatGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAgg < 1:930749/149‑1 (MQ=255) tatGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGc < 1:849112/149‑1 (MQ=255) tatGGTGGCGAAAGGGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGAAAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGc < 2:623117/149‑1 (MQ=255) atGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCg < 1:504683/149‑1 (MQ=255) atGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCg < 1:980532/149‑1 (MQ=255) gtggCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGTAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTATATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGaa > 1:1045116/1‑149 (MQ=255) gtggCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAGGGTAAAGAATATATTATGCAAGGTGGCGTTATCGTTCGTTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAAATAAGTAGTCAATATGTAACAACGGCGGaa > 2:1346036/1‑149 (MQ=255) gtggCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGaa > 2:1705852/1‑149 (MQ=255) tggCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGGGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAAt > 1:1606417/1‑149 (MQ=255) gggCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAAt < 2:1257771/148‑1 (MQ=255) cGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCaa > 1:1228810/1‑149 (MQ=255) cGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCaa > 1:1012154/1‑149 (MQ=255) gggCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTTCTTCGTTTTGTTATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTc < 1:412456/148‑1 (MQ=255) cgcTAAAGAAGCGCGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGcc < 2:555901/149‑1 (MQ=255) gcTAAAGAAGGGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCct < 1:844724/149‑1 (MQ=255) aaaGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCtt > 1:642484/1‑149 (MQ=255) aaaGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGCATAGAAGATAGAGTTAAGTTAATTCATTGTTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCtt < 2:1650499/149‑1 (MQ=255) aagaagCGGGCAGACCACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCttt < 1:599377/149‑1 (MQ=255) aagaagCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATCTTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGCGTGAAGTTAATTAAATAGTCTATATGTAGAAGAGGCCGAATTAATTGTCCTCCTtttt < 2:1266950/149‑1 (MQ=255) agaagCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCtttt > 2:242174/1‑149 (MQ=255) gaagCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTa > 1:1583635/1‑149 (MQ=255) gaagCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTa > 1:1413070/1‑149 (MQ=255) agCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAAt > 2:1638986/1‑149 (MQ=255) ggCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATg < 2:954015/149‑1 (MQ=255) ggCAGACAACAGTTACAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGACATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGACGTGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATg < 1:1114773/149‑1 (MQ=255) aGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGt < 2:337482/149‑1 (MQ=255) aGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGGTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGt < 1:1009519/149‑1 (MQ=255) aCGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAt > 1:177983/1‑149 (MQ=255) cGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 1:607281/149‑1 (MQ=255) cGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 2:217305/149‑1 (MQ=255) cGATAAGAAAGGAAAGAATATATTGAGGAAGAGTGCGATATCGTTGATTTCCAATTTAATGTATAAAAGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 1:392081/149‑1 (MQ=255) aaGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTAAATTATACGCATAAttaaaagag < 1:507401/149‑8 (MQ=255) aGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTaaaa < 1:1424661/149‑1 (MQ=255) aaaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAAt < 1:1639964/149‑1 (MQ=255) aaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATg < 2:1126640/149‑1 (MQ=255) aaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGGATGAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGTAATCAATTGGTCGCCTCTTTTAAATATGCGTATAATTTATTAAAAGAATg < 2:450613/149‑1 (MQ=255) gAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGa < 2:177983/149‑1 (MQ=255) atatatTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATCCGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATACGTATAATTTATTAAAAAAATGGaat > 1:482002/1‑149 (MQ=255) tatatTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGaata < 2:388416/149‑1 (MQ=255) attatGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAAtt < 2:942379/149‑1 (MQ=255) tatGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAAtttt > 1:466473/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGCGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATCATTTTACt > 2:830288/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACt > 1:444376/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACt > 1:976605/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATATAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAAAATGGAATAATTTTACt > 2:99134/1‑149 (MQ=255) cAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTc > 1:1406261/1‑149 (MQ=255) aaGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAACTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTcc > 1:67516/1‑148 (MQ=255) agggggATATCGTTCATTTCAGATTTAATTTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGt < 2:1059838/144‑1 (MQ=255) ggCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATAACGTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTGATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTta < 1:1257929/149‑1 (MQ=255) ttCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCtt > 1:686359/1‑149 (MQ=255) ttCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGGGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCtt > 1:1673137/1‑149 (MQ=255) tCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTg > 1:608397/1‑149 (MQ=255) tCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTg > 2:1141704/1‑149 (MQ=255) cATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGa < 2:744611/149‑1 (MQ=255) cATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGAGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGa > 2:307943/1‑149 (MQ=255) aTTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAg < 2:1606417/149‑1 (MQ=255) cAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCt > 2:1299451/1‑149 (MQ=255) aGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGACAGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTAGGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTg > 1:228719/1‑149 (MQ=255) gTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGt < 1:1077090/149‑1 (MQ=255) gTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAAGGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGt < 2:270636/149‑1 (MQ=255) gTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTAGATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTCTAATTTATTAAGAGAATTGTATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGt < 2:861341/149‑1 (MQ=255) ataAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGttt > 1:284249/1‑149 (MQ=255) taAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTg > 1:483867/1‑149 (MQ=255) taaCGCTAAAGTTAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGCGGCGTAATCAATTGTTCGGCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTAATAAAAGAATGGAATAATTTTTCTCGCCTTAAGAATATCCTGAGTGCTGAAAAATCGTTTGc < 2:1398015/148‑1 (MQ=255) aaaCGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGGATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGc < 2:1365931/149‑1 (MQ=255) cGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTACATATGTAGAAGAGGCCGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAAATATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTTGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCtt < 1:1458203/149‑1 (MQ=255) aTAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCg > 1:1568521/1‑149 (MQ=255) gagTGAATTTAATTAAATAGTATCTATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGGTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCa < 2:1516989/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGATTAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGt < 1:1141860/149‑1 (MQ=255) cgAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGAGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGta < 1:307943/148‑1 (MQ=255) gAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGtaa > 2:224738/1‑148 (MQ=255) taattgaATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTATTCGCCTCTTTCAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAGTCTCACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCa < 1:1430081/149‑1 (MQ=255) taattaaATAGTATATATGTAGAAGAGGCAGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAAAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCa < 1:235050/149‑1 (MQ=255) aattaaATATTATATATGTACAAGAAGCCGAATCAATTGTTCTCCTCTTTTAATTATGCCTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTCCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAg < 2:1012154/149‑1 (MQ=255) aattaaATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTATTAGCCTTCGCCAGTATAAGCAg < 2:1228810/149‑1 (MQ=255) ttaaATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAGTATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGc > 2:499578/1‑149 (MQ=255) taaATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCTCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCCGGcc > 2:1458317/1‑148 (MQ=255) tatataTGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTCTTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGGTGTTAACAATTGTTTGCCTTCGTCAGTTAAAGCAAGCTGTAAAAc > 2:778013/1‑149 (MQ=255) tatataTGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTTTAAGCAGGCTCTaaaaa > 1:1319296/1‑148 (MQ=255) tatataTGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCATTCGCCAGTATAAGCCGGCTATAAAAc > 1:808458/1‑149 (MQ=255) tatGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGa > 2:1421140/1‑149 (MQ=255) atGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACACGAt > 1:684868/1‑149 (MQ=255) gTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTa > 1:83284/1‑149 (MQ=255) gTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTGAATTATGCGTATAATTTACTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTa > 1:945377/1‑149 (MQ=255) tAGAATAGGCCGAAGCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAACTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg < 2:1330084/149‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAGCAAGAtttg > 1:1129183/1‑147 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 1:51558/1‑149 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 2:910277/1‑149 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 2:925117/1‑149 (MQ=255) agaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGc > 1:1523650/1‑149 (MQ=255) gaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAGCAAGATTAGcc > 2:705815/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGTGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCCAAACAACTGGTGTCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:560209/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAACTTATTGGCCTGCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:897496/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAGACAAGATTAGCCt > 1:1503541/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:550349/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 2:1390750/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:704461/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCGCTCAACCAAGATTAGCCt > 1:1471915/1‑149 (MQ=255) | GTACAATATGGTGGCGAAAGTGGCGCTAAAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCT > USA300TCH1516_ALE/418037‑418333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |