New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 418185 = | 170 (1.000) | 5 (0.030) | 4/280 | 13.6 | 2.8% | intergenic (+38/+48) | ychF/USA300HOU_RS01930 | Ribosome‑binding ATPase YchF/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 418213 = | 186 (1.160) | intergenic (+66/+20) | ychF/USA300HOU_RS01930 | Ribosome‑binding ATPase YchF/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
AAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGAAT > USA300TCH1516_ALE/418065‑418361 | aagaagCGGGCAGACCACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCttt < 1:599377/149‑1 (MQ=255) agCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAACGAAGACAATATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAAt > 2:1657326/1‑149 (MQ=255) agCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAAt > 2:1638986/1‑149 (MQ=255) ggCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATg < 2:954015/149‑1 (MQ=255) aGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGt < 2:337482/149‑1 (MQ=255) aGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTATTCCAACTATTCGt < 2:1488602/149‑1 (MQ=255) aGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGGTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGt < 1:1009519/149‑1 (MQ=255) atgATTAGAAGGTAAAGAAGATATTATGCAAGGTGGCGATAGCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAt < 1:352992/147‑1 (MQ=255) aCGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAt > 2:1061580/1‑149 (MQ=255) aCGATTAGAAGGTAAAAAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTAATTTAAGATTTGATGTATAAACGAAAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAAATATGCGTATAAt > 2:1270561/1‑149 (MQ=255) cGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 1:1411005/149‑1 (MQ=255) cGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 2:217305/149‑1 (MQ=255) cGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 1:607458/149‑1 (MQ=255) cGATAAGAAAGGAAAGAATATATTGAGGAAGAGTGCGATATCGTTGATTTCCAATTTAATGTATAAAAGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAAtt < 1:392081/149‑1 (MQ=255) aTTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATtta < 1:958058/149‑1 (MQ=255) aGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTaaaa < 1:1424661/149‑1 (MQ=255) aaaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAAt < 1:1435611/149‑1 (MQ=255) gaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTCCAGATTTAATGTGTAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGTCGGAATCAATTGTTCGCCGCTTTTAATTATGCGTATAATTAATTAAAAGAATg < 2:1047730/148‑1 (MQ=255) aaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATg < 2:1126640/149‑1 (MQ=255) aaGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGGATGAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGTAATCAATTGGTCGCCTCTTTTAAATATGCGTATAATTTATTAAAAGAATg < 2:450613/149‑1 (MQ=255) aaGAATATATTAGGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATg < 2:745045/149‑1 (MQ=255) gAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGa < 2:177983/149‑1 (MQ=255) atatatTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATCCGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATACGTATAATTTATTAAAAAAATGGaat > 1:482002/1‑149 (MQ=255) attatGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAAtt < 2:942379/149‑1 (MQ=255) tatGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAAtttt > 1:466473/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGCGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATCATTTTACt > 2:830288/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACt > 1:444376/1‑149 (MQ=255) gCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATATAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAAAATGGAATAATTTTACt > 2:99134/1‑149 (MQ=255) cAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTc > 1:699273/1‑149 (MQ=255) cAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTc > 1:1287413/1‑149 (MQ=255) cAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTc > 1:1406261/1‑149 (MQ=255) aaGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAACTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTcc > 1:67516/1‑148 (MQ=255) aGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTcgc > 2:1262924/1‑149 (MQ=255) gATGGGGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGCAAAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATAAATGTAGACGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTcgcg < 1:109815/149‑1 (MQ=255) ttCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCtt > 1:264181/1‑149 (MQ=255) ttCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGGGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCtt > 1:1673137/1‑149 (MQ=255) cATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGAGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGa > 2:307943/1‑149 (MQ=255) ttCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTg > 1:840917/1‑149 (MQ=255) cAGATTTAATGTATAAACGATAGAGAGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGATTGCt > 2:1008750/1‑149 (MQ=255) ttAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGaaaa > 1:285006/1‑149 (MQ=255) gTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGt < 2:66424/149‑1 (MQ=255) gTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGt < 2:554727/149‑1 (MQ=255) gTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAAGGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGt < 2:270636/149‑1 (MQ=255) taAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTg > 1:483867/1‑149 (MQ=255) taaCGCTAAAGTTAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGCGGCGTAATCAATTGTTCGGCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTAATAAAAGAATGGAATAATTTTTCTCGCCTTAAGAATATCCTGAGTGCTGAAAAATCGTTTGc < 2:1398015/148‑1 (MQ=255) aaaCGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGc > 2:152272/1‑149 (MQ=255) aaaCGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGc > 1:63943/1‑149 (MQ=255) cGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCtt < 1:1547612/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGt < 2:1372215/149‑1 (MQ=255) tGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGta > 2:894929/1‑149 (MQ=255) gAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGtaa > 2:224738/1‑148 (MQ=255) taattaaATAGTCTATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGATCGACTCCTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAACAATGGTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCa < 1:1430069/149‑1 (MQ=255) taattaaATAGTATATATGTAGAAGAGGCAGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAAAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCa < 1:235050/149‑1 (MQ=255) taattaaATAATAGATATGTAGAAGAGGCGGAAACAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCa < 1:774257/149‑1 (MQ=255) taatgaaATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATTCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCa < 2:85919/149‑1 (MQ=255) ttaaATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAGTATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGc > 2:499578/1‑149 (MQ=255) aGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTaaa > 2:382993/1‑149 (MQ=255) atatatGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATACTTTTACTCGCGTTAATAATACCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCATAGCCAGTATAAGCATGCTCTacaaca > 1:934546/1‑149 (MQ=255) tatGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACgaga > 1:506607/1‑149 (MQ=255) atGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACACGAt > 1:684868/1‑149 (MQ=255) tAGAATAGGCCGAAGCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAACTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg < 2:1330084/149‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATATTATTGTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTACAACAAGATTAg > 1:823294/1‑149 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAGCAAGAtttg > 1:1129183/1‑147 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACa < 1:125571/142‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 2:257699/1‑149 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 2:1348162/1‑149 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 2:925117/1‑149 (MQ=255) tAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg > 1:51558/1‑149 (MQ=255) gagaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTGTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAg < 2:1216477/148‑1 (MQ=255) agaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTCCTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAACTTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGAGTAGc > 1:1577531/1‑149 (MQ=255) agaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGc > 2:143664/1‑149 (MQ=255) agaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGc > 1:1523650/1‑149 (MQ=255) gaagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAGCAAGATTAGcc > 2:705815/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGTGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCCAAACAACTGGTGTCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:560209/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAGACAAGATTAGCCt > 1:1503541/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:550349/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCt > 1:220827/1‑149 (MQ=255) aagaGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCGCTCAACCAAGATTAGCCt > 1:1471915/1‑149 (MQ=255) agagGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCtt > 1:1049003/1‑149 (MQ=255) agGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTg > 1:370857/1‑149 (MQ=255) agGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTg > 1:322432/1‑149 (MQ=255) agGCGGAATCAAATGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAATATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTg > 1:1169957/1‑149 (MQ=255) ggCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGc < 2:1479716/149‑1 (MQ=255) cGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGcac > 2:169026/1‑149 (MQ=255) cGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTGTGcac > 1:418887/1‑149 (MQ=255) cGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTACCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGcac > 1:539454/1‑149 (MQ=255) aaTCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAAt > 1:981712/1‑149 (MQ=255) tCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATaa > 2:1239484/1‑149 (MQ=255) tCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATaa < 1:1638986/149‑1 (MQ=255) tCAATTGTTCGCCTCTTGTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATaa < 1:1657326/149‑1 (MQ=255) tCAAGTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTGCTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATaa < 2:482002/149‑1 (MQ=255) cAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGAATAAATGGTGGAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGAATAGCCATTGCACaaaaaa > 2:794099/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCAtt > 1:1229303/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCAtt > 1:70677/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCAtt > 1:1482572/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCAtt > 1:1419518/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCAtt > 1:1437498/1‑149 (MQ=255) tCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCCCAATAAAGCCATTc > 1:107290/1‑149 (MQ=255) ttttAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGa < 1:174330/149‑1 (MQ=255) ttttAAGTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGa < 1:1591621/149‑1 (MQ=255) | AAGAAGCGGGCAGACAACGATTAGAAGGTAAAGAATATATTATGCAAGATGGCGATATCGTTCATTTCAGATTTAATGTATAAACGATAGAGTGAAGTTAATTAAATAGTATATATGTAGAAGAGGCGGAATCAATTGTTCGCCTCTTTTAATTATGCGTATAATTTATTAAAAGAATGGAATAATTTTACTCGCGTTAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGAAT > USA300TCH1516_ALE/418065‑418361 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |