| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 3781 | 387 (0.700) | 42 (0.090) | 16/140 | NT | 10.8% | intergenic (+397/‑87) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0005/USA300HOU_pUSA300HOUMR0006 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP000731 | = 3794 | 353 (0.730) | intergenic (+410/‑74) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0005/USA300HOU_pUSA300HOUMR0006 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GCATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000731/3682‑3781‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagctaccTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGTT < CP000731/3794‑3705 CATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAA > 1:922105/1‑91 CATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAA < 1:2549181/91‑1 CATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAA > 1:2298567/1‑91 CATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAAATAAAAATAAGGGCATAAAAAATAA < 2:2152966/91‑1 ATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAA < 1:1449152/91‑1 ATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAA > 2:2076625/1‑91 TATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAA > 1:630935/1‑91 TATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAA < 1:2595647/91‑1 TATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAA < 2:2148118/91‑1 TATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAA < 2:2512049/91‑1 TATATAAGTTTTAGATACAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAA < 1:3323794/91‑1 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC > 1:1918921/1‑91 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC > 2:929020/1‑91 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC < 1:1845510/91‑1 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC < 2:3734779/91‑1 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC > 2:761956/1‑91 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC > 1:2538332/1‑91 TATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGC > 1:150359/1‑91 ATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCT < 1:1283089/91‑1 ATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCT > 1:2934128/1‑91 ATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCT < 1:2906945/91‑1 ATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCT > 1:2508296/1‑91 TAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAATATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTA > 1:3620115/1‑91 TAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTA > 2:541913/1‑91 TAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTA > 1:487957/1‑91 TAAGTTATAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTA > 2:1352682/1‑91 AAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTAC > 2:486182/1‑91 AAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTAC > 2:1515178/1‑91 AAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTAC > 1:2726326/1‑91 AGTTTTGGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC > 1:3014759/1‑91 AGTTTTATATCTAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC > 2:1799055/1‑91 AGTTTTATATCTAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC > 1:2830281/1‑91 AGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC < 1:332116/91‑1 ATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATC < 2:3160850/91‑1 AAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTG < 2:124862/91‑1 AAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGAGAATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGG < 2:3285676/91‑1 ACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGG < 1:2116292/91‑1 CTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGT < 1:1061190/91‑1 TATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTA < 2:2381784/91‑1 TATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTA < 1:113333/91‑1 TATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTA < 1:1349281/91‑1 TATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGAATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTA < 2:3199593/91‑1 ATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGTGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAG < 2:2866842/91‑1 TATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAAGGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGC < 2:1072252/91‑1 ATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCT < 2:2247671/91‑1 TGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTT < 1:44541/91‑1 GAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTT < 1:1664827/91‑1 AATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTT < 2:2125817/91‑1 AATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTT < 1:585729/91‑1 AATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTT < 1:2050581/91‑1 AATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTT < 1:740320/91‑1 AATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTT < 2:3076124/91‑1 ATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTA < 1:3239139/91‑1 ATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTA < 1:3835432/91‑1 CACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATT < 2:1918589/91‑1 AAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATT < 1:2662420/91‑1 AAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATT < 2:1372238/91‑1 AAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATT < 1:1516926/91‑1 AAAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATATTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATT > 1:3185768/1‑91 AAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGTCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTC > 2:222703/1‑91 AAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTC > 2:337632/1‑91 AAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTC < 2:1563254/91‑1 AAAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTC < 1:2581529/91‑1 AAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGCTTTAGGGGTGATTCA > 1:1810641/1‑91 AAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCA < 1:2265825/91‑1 AAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCA < 1:513718/91‑1 AAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCA < 2:1883472/91‑1 AAGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCA < 2:717097/91‑1 AGCTACCTCATTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:2882615/91‑1 AGCTACCTCATTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:3727634/91‑1 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:2315704/91‑1 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:3533281/91‑1 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:2603662/91‑1 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT > 2:3343052/1‑91 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:1874072/91‑1 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT > 1:300065/1‑91 AGCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 2:410876/91‑1 AGCGACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCAT < 1:3493730/91‑1 GCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATA > 1:2398839/1‑91 GCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATA > 1:2862986/1‑91 GCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATA < 1:96811/91‑1 GCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATA < 2:400615/91‑1 GCTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATA < 1:778079/91‑1 CTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATAT > 2:234985/1‑91 CTACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATAT > 1:3165878/1‑91 TACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATA > 2:3304449/1‑91 TACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATA > 2:265168/1‑91 TACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATA < 2:3418328/91‑1 TACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATA > 1:2175630/1‑91 TACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATA > 1:17380/1‑91 ACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGGATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAG < 2:270750/91‑1 ACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAG < 1:328393/91‑1 ACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAG > 2:3030072/1‑91 ACCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAG > 2:1649481/1‑91 CCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGT > 2:3661167/1‑91 CCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGT > 1:1980670/1‑91 CCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGT > 2:2853546/1‑91 CCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGT > 1:2344945/1‑91 CCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGT > 1:416905/1‑91 CCTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGT < 1:1238943/91‑1 GCATATATAAGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000731/3682‑3781‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagctaccTCACTTTATCTGGGGTAGCTTTTATTTTTTATGCCCTTATTTTGAATTTTAAGAGGGCATTTTAAAGATTTAGGGGTGATTCATATAGTT < CP000731/3794‑3705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |