| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 3781 | 387 (0.700) | 42 (0.090) | 16/140 | NT | 10.8% | intergenic (+397/‑87) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0005/USA300HOU_pUSA300HOUMR0006 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP000731 | = 3794 | 353 (0.730) | intergenic (+410/‑74) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0005/USA300HOU_pUSA300HOUMR0006 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 942 total aligned reads displayed.
AGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGTTATGG > CP000731/3691‑3871 | aGTTTTGGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC > 1:3014759‑M1/1‑91 (MQ=255)aGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACC < 1:957091‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTAccc > 2:802428/1‑91 (MQ=255) tttAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCa > 1:2813506/1‑91 (MQ=255) ttAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAg < 1:2442669/91‑1 (MQ=255) gATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATa < 2:897627/91‑1 (MQ=255) atatAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATaa > 1:597244/1‑91 (MQ=255) tataAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATaaa < 1:1764081/91‑1 (MQ=255) ataAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAg > 1:1498374/1‑91 (MQ=255) taAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGt > 2:1101962/1‑91 (MQ=255) cccataacttttttgaattacatcgacgatacggcgtcgaaagaaaaataaatagaccgtatgaaagaAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGa > 2:2669223‑M1/69‑91 (MQ=255) cccataacttttttgaattacatcgacgatacggcgtcgaaagaaaaataaatagaccgtatgaaagaAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGa > 1:486733‑M1/69‑91 (MQ=255) aaaCTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGa > 2:2637963/1‑91 (MQ=255) tcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttttcagggcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAg > 1:3590758‑M2/61‑91 (MQ=255) aCTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAgg > 2:2049341‑M2/1‑89 (MQ=255) cTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCtcactttatctggggt < 1:3810178‑M1/91‑17 (MQ=255) cTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCtcactttatctggggt < 2:2723835‑M1/91‑17 (MQ=255) atatGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtag > 2:94499‑M2/1‑86 (MQ=255) aacttttttgaattacatcgacgatacggggccgaaagaaaaataaatagaccgtatgaaagaAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAg > 1:3107088‑M1/64‑91 (MQ=255) tatGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagc < 1:778079‑M2/91‑7 (MQ=255) tatGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTATTAAAAATCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagc > 2:3107966‑M2/1‑85 (MQ=255) atGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagct < 2:1874072‑M2/91‑8 (MQ=255) atGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagct < 2:410876‑M2/91‑8 (MQ=255) gAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagcttt < 2:1563254‑M2/91‑10 (MQ=255) ttttgaattacatcgacgatacggcgtcgaaagaaaaataaatagaccgtatgaaagaAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCtttt > 1:3526010‑M1/59‑91 (MQ=255) aaTCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCtcactttatctggggtagctttt < 2:2125783‑M1/91‑24 (MQ=255) aaTCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCtcactttatctggggtagctttt < 1:2050699‑M1/91‑24 (MQ=255) aaTCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagctttt < 2:3565602‑M2/91‑11 (MQ=255) tCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTtttc < 2:105367/91‑1 (MQ=255) tCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTtttc > 2:2481630/1‑91 (MQ=255) aCCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTtttctt < 1:3702745/91‑1 (MQ=255) aCCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTtttctt > 1:219945/1‑91 (MQ=255) ccccTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTtttcttt > 2:1909153/1‑91 (MQ=255) cTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCAt < 1:583154/91‑1 (MQ=255) tAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATa > 2:686953/1‑91 (MQ=255) aaTCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACg > 2:3384565/1‑91 (MQ=255) cTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCGTACGGTc > 2:3435648/1‑91 (MQ=255) cTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTc > 1:2538118/1‑91 (MQ=255) cTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTc < 2:173813/91‑1 (MQ=255) tttAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCt < 2:1277782/91‑1 (MQ=255) ttAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCta > 2:3006030/1‑91 (MQ=255) tAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCtat > 1:3370564/1‑91 (MQ=255) tttatgcccttattttgaattttaagagggcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCtatt > 1:2570529‑M2/34‑91 (MQ=255) aaaTGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCtattt < 2:3302580/91‑1 (MQ=255) aaaTGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCtattt > 1:2716092/1‑91 (MQ=255) TGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCtatttatt < 2:1246167‑M1/91‑1 (MQ=255) gcccttattttgaattttaagagggcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTatttattt > 2:367609‑M2/29‑91 (MQ=255) GCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTatttattt < 1:19624‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTatttattt < 2:1812687‑M1/91‑1 (MQ=255) cccttattttgaattttaagagggcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTAtttt > 1:451262‑M2/28‑91 (MQ=255) ctTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTtttctt > 2:1437258/1‑91 (MQ=255) ttAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTtttcttt < 2:19624/91‑1 (MQ=255) ttAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTtttcttt > 1:833466/1‑91 (MQ=255) tAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTtttctttc < 2:3349473/91‑1 (MQ=255) tAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTtttctttc < 1:713414/91‑1 (MQ=255) tCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGcc < 1:343863/91‑1 (MQ=255) cAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCg < 1:514821/91‑1 (MQ=255) aaaaTAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGt < 2:1505294/91‑1 (MQ=255) aaaTAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCATATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTATCTTTCGACGCCGTa < 1:3314285/91‑1 (MQ=255) aaTAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcatttt < 1:2662420‑M2/91‑51 (MQ=255) aaTAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAt < 2:562690/91‑1 (MQ=255) aaTAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAt > 1:2883131/1‑91 (MQ=255) aaTAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAt > 1:2040034/1‑91 (MQ=255) tAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAtcg > 2:2244908/1‑91 (MQ=255) tAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAtcg > 2:2792732/1‑91 (MQ=255) aaGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAtcgt > 1:1001965/1‑91 (MQ=255) agggcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAtcgtc > 2:392261‑M2/8‑91 (MQ=255) agggcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTAtcgtc < 2:2549908‑M2/84‑1 (MQ=255) gcatAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGAt > 2:24138‑M2/5‑91 (MQ=255) catAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATg < 1:1452928‑M2/88‑1 (MQ=255) catAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATg < 1:1823469‑M2/88‑1 (MQ=255) atAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGt > 1:1663372‑M2/3‑91 (MQ=255) aaaTAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTc < 2:2165837/91‑1 (MQ=255) aaTAAAAGCTACGCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCa > 1:2968561/1‑91 (MQ=255) aTAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCaa > 1:671360/1‑91 (MQ=255) aaaaGCTACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaatattaagagggcattttaaagatttaggggtgatt > 1:3185768‑M1/1‑10 (MQ=255) AAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCaaaa > 1:1563254‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaGCTACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattc < 1:2581536‑M1/91‑83 (MQ=255) aaaGCTACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattc < 2:1355862‑M1/91‑83 (MQ=255) AAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGTCGCCGTATCGTCGATGTAATTCaaaaa < 2:2358120‑M1/91‑1 (MQ=255) aaGCTACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttgagagggcattttaaagatttaggggtgattca < 2:3808398‑M1/91‑84 (MQ=255) aGCTACCtcattttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcat < 2:2882615‑M1/91‑85 (MQ=255) aGCTACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtcattcat > 2:3729930‑M1/1‑7 (MQ=255) AGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAg > 1:1154174‑M1/1‑91 (MQ=255) GCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAACAAAGt < 1:400229‑M1/91‑1 (MQ=255) GCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGt < 1:1191686‑M1/91‑1 (MQ=255) CTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGtt < 2:3266830‑M1/91‑1 (MQ=255) tACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatata > 1:17380‑M1/1‑4 (MQ=255) tACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatata > 1:1272947‑M1/1‑4 (MQ=255) tACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcat > 2:2305128‑M1/1‑4 (MQ=255) tACCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtg < 1:2378276‑M1/82‑79 (MQ=255) tACCCCAGATAAAGTGAggtagcttttattttttattcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatata < 2:3199593‑M2/91‑75 (MQ=255) tACCCCAGATAAAGTGAggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatata < 1:1349281‑M2/91‑75 (MQ=255) aCCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatatag > 2:1649481‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCtcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatatag > 1:1083068‑M1/1‑3 (MQ=255) ACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTACGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGTTAt < 2:3062815‑M1/91‑1 (MQ=255) cctcactttatctggggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatatagt > 2:2853546‑M1/1‑2 (MQ=255) ccccAGATAAAGTGAggtagcttttattttttatgcccttattttgaattttaagagggcattttaaagatttaggggtgattcatatagt < 1:2116292‑M2/91‑77 (MQ=255) CCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGTTATg < 1:3243952‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGTTATg < 1:2301887‑M1/91‑1 (MQ=255) | AGTTTTAGATATAAAACTATATGAATCACCCCTAAATCTTTAAAATGCCCTCTTAAAATTCAAAATAAGGGCATAAAAAATAAAAGCTACCCCAGATAAAGTGAGGTAGCTTTTTCTTTCATACGGTCTATTTATTTTTCTTTCGACGCCGTATCGTCGATGTAATTCAAAAAAGTTATGG > CP000731/3691‑3871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |