| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 88662 = | 238 (1.250) | 10 (0.070) | 6/126 | NT | 5.7% | intergenic (+35/‑730) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 88722 = | 143 (0.960) | intergenic (+95/‑670) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/88768‑88662‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC > USA300TCH1516_ALE/88722‑88811 TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGAT > 2:2405118/1‑91 TTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATT < 1:105062/91‑1 TTTGATAAATGTCATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATT > 1:2977425/1‑91 TTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTA > 2:3824973/1‑91 TTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTA > 2:730430/1‑91 TTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTA > 1:774824/1‑91 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAA > 2:2631521/1‑91 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAA > 2:698828/1‑91 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAA > 1:1591202/1‑91 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAA < 2:1367517/91‑1 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAA < 1:1203543/91‑1 TGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATCTAAATTATTGATTAA > 2:864979/1‑91 GATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAG > 1:176548/1‑91 GATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAG > 2:3771229/1‑91 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGG < 2:679085/91‑1 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGG < 2:176548/91‑1 ATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGG < 1:314995/91‑1 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAG > 2:1300966/1‑91 AAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGAATAAGGAG > 1:1942219/1‑91 AAATGTTATTCTTCTAAAACTCTTTTTAAGTTACACACTAAAAAAGATCCTCCTTAACGATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAG < 2:1771291/91‑1 AATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGG < 2:375291/91‑1 ATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGA > 1:399756/1‑91 ATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGA > 1:364719/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGAT > 2:3476668/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGAT < 1:1416159/91‑1 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGAT > 1:140347/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGAT < 1:1389313/91‑1 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGAT > 1:3296339/1‑91 TGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGAT > 1:3296388/1‑91 TGTTAGTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAGCAATAATAAGTTATTTAAATTAGTGATTAAGGAGGAT < 1:1091628/91‑1 TTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATAT > 2:54038/1‑91 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTT > 2:1501308/1‑91 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTT > 2:784935/1‑91 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTT > 1:743859/1‑91 ATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTT > 1:357596/1‑91 TTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTT < 2:666366/91‑1 TTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTT < 2:2843792/91‑1 TTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTT < 1:2322012/91‑1 TTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACAATAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTT < 2:916995/91‑1 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT > 2:2789556/1‑91 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT > 1:693605/1‑91 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT < 2:1799814/91‑1 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT > 1:2937129/1‑91 TCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT > 2:1272867/1‑91 TATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAAC > 2:2646426/1‑91 TATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAAC > 2:929794/1‑91 TATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAAC > 1:561829/1‑91 TCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACAT > 2:2581069/1‑91 TCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGAGTGTAAATTACAAAGAATTTTAGCAGAATAACAT > 1:173295/1‑91 CTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTT > 2:460750/1‑91 AACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAA > 1:2213786/1‑91 AATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA > 2:2035502/1‑91 TTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA < 1:1644307/91‑1 TTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA > 2:1461788/1‑91 TTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA < 2:314995/91‑1 TTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA < 2:3033717/91‑1 TTAAGGAGGATATTCTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAA > 2:3298560/1‑91 TAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAAT < 1:2940365/91‑1 TAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAAT < 2:689600/91‑1 TAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAAT < 1:1909496/91‑1 TAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAAT < 2:2239813/91‑1 TAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAAT < 2:1890352/91‑1 AAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACCTGTTCTTTA‑CTTAATAATTTAAAat > 1:1626739/1‑89 atGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTA < 2:3753935/89‑1 AGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTA < 1:3880451/91‑1 GGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTAT < 2:461352/91‑1 GGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTAT > 1:1321288/1‑91 GAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATA > 2:1053954/1‑91 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATAT > 1:2194265/1‑91 AGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATAT > 2:30645/1‑91 GGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATA > 1:2766173/1‑91 GATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAA < 2:1885823/91‑1 GATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAA < 2:1885389/91‑1 GATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAA > 1:3300625/1‑91 GATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAA < 2:1885592/91‑1 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT < 2:164738/91‑1 ATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTAAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAT > 2:3812606/1‑91 TATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCGAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATT < 2:3193014/91‑1 TATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATT < 1:44277/91‑1 TATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATT < 1:566122/91‑1 ATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTA < 1:1127619/91‑1 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA < 2:3148325/91‑1 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA > 1:3023159/1‑91 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA < 2:914211/91‑1 TTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATAAATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAA < 2:3149171/91‑1 TTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAA < 1:2901248/91‑1 TTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAA < 2:2673919/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA < 1:3818784/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA > 1:1284210/1‑91 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA < 1:3819003/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA > 2:3589201/1‑91 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA < 1:2743187/91‑1 TTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAA < 2:294697/91‑1 TTTAGTGTGTAAATTAAAAATAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAA < 2:2699752/91‑1 TTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAA < 1:1017119/91‑1 TTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAA > 1:1837379/1‑91 TTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAA > 1:2089324/1‑91 TTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC < 2:2419096/91‑1 TTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC > 2:2178561/1‑91 TTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC > 2:2178589/1‑91 TTTTGATAAATGTTATTCTTCTAAAATTCTTTTTAATTTACACACTAAAAAATATCCTCCTTAACAATAATAAGTTATTTAAATTATTGATTAAGGAGGATATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/88768‑88662‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAA‑CTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAC > USA300TCH1516_ALE/88722‑88811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |