New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 88662 = | 238 (1.250) | 10 (0.070) | 6/126 | NT | 5.7% | intergenic (+35/‑730) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 88722 = | 143 (0.960) | intergenic (+95/‑670) | nusG_1/USA300TCH1516_00080 | Transcription termination/antitermination protein NusG/hypothetical protein |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
CTAGTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAACC > USA300TCH1516_ALE/88632‑88812 | aGTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAg > 1:498431/1‑91 (MQ=255) aGTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAg < 2:852215/91‑1 (MQ=255) gTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgt < 1:3212279/91‑1 (MQ=255) gTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgt > 1:2925943/1‑91 (MQ=255) ttCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtg < 2:3586318/91‑1 (MQ=255) tCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTGCTGTTAAGGATGATATTATTTAgtgt > 2:3367836/1‑91 (MQ=255) tCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAgtgt < 2:3647437/91‑1 (MQ=255) aaTTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTaa < 2:3788751/91‑1 (MQ=255) ttGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAAt < 1:471730/91‑1 (MQ=255) gagaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTa > 2:2233189/1‑91 (MQ=255) gagaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTa > 2:3557058/1‑91 (MQ=255) gagaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTa > 2:781202/1‑91 (MQ=255) agaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaa < 2:972310/91‑1 (MQ=255) gaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaa > 2:629643/1‑91 (MQ=255) gaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaa > 2:1909496/1‑91 (MQ=255) gaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaa < 1:2317980/91‑1 (MQ=255) gaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaa > 2:414040/1‑91 (MQ=255) gaAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaa > 2:3339665/1‑91 (MQ=255) aaataaatAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaaaa > 1:125482/1‑91 (MQ=255) ataaataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTaa < 1:3075606/87‑1 (MQ=255) aataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAt > 2:3280259/1‑91 (MQ=255) ataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAtt > 2:3498087/1‑91 (MQ=255) ataGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAtt > 1:3692549/1‑91 (MQ=255) taGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAttt > 1:2828012/1‑91 (MQ=255) aGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAAtttt > 2:2560260/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa > 2:2265838/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa > 2:2703121/1‑91 (MQ=255) gATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGAATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTa < 1:432900/91‑1 (MQ=255) atatAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTag > 2:1345935/1‑91 (MQ=255) atatAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTag < 2:1658953/91‑1 (MQ=255) atatAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTag < 1:247122/91‑1 (MQ=255) taAAAATCTCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaag < 2:3436040/91‑1 (MQ=255) AAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaaga < 2:1799814‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaaga > 2:1272867‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaaga > 2:2789556‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTagaaga > 1:693605‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAAt > 2:1501308‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAAt > 1:357596‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAAt > 1:743859‑M1/1‑91 (MQ=255) ATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATaa > 2:54038‑M1/1‑91 (MQ=255) tatcctccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAAc > 2:2646426‑M2/56‑91 (MQ=255) tatcctccttaacaataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAAc > 2:931099‑M2/56‑91 (MQ=255) ATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACa < 1:1416159‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACa > 1:3296388‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTAt < 1:314995‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTAt < 2:679085‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATc > 1:176548‑M1/1‑91 (MQ=255) TTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCa > 1:1590708‑M1/1‑91 (MQ=255) TTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCa > 2:698828‑M1/1‑91 (MQ=255) TTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCa < 1:1203543‑M1/91‑1 (MQ=255) TAATCAATGATTTAAATAACTTAATATTGTTAAGGAGGATATTTTTTACTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAAAATTTATCaa > 2:731073‑M1/1‑91 (MQ=255) TAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaa > 1:453451‑M1/1‑91 (MQ=255) TAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaa > 2:3824973‑M1/1‑91 (MQ=255) TAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaa > 1:2212589‑M1/1‑91 (MQ=255) AATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaa < 1:105062‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaaa > 2:2405118‑M1/1‑91 (MQ=255) tCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaaaa > 1:1540344/1‑91 (MQ=255) aataataagttatttaaattattgattaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCaaaaaa > 2:2035502‑M2/43‑91 (MQ=255) aataatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAAc > 2:1650393/1‑91 (MQ=255) aataatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAAc > 2:2359002/1‑91 (MQ=255) taatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTg < 2:318173/91‑1 (MQ=255) taagTTAAACAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTg < 1:3485742/91‑1 (MQ=255) aatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGt < 1:1105737/91‑1 (MQ=255) aatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGt < 2:3076323/91‑1 (MQ=255) aatTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGt < 2:3025877/91‑1 (MQ=255) tttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATAAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTc < 2:1080341/91‑1 (MQ=255) ttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTTGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCa > 1:3830985/1‑91 (MQ=255) ttAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTTGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCa > 1:240092/1‑91 (MQ=255) tAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCAt > 2:1764457/1‑91 (MQ=255) aaaTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCAtt > 2:1671600/1‑91 (MQ=255) aaTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTa > 1:592412/1‑91 (MQ=255) aaTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTa > 2:2608248/1‑91 (MQ=255) aTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTAc < 1:2082187/91‑1 (MQ=255) aTAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTAc < 2:1039933/91‑1 (MQ=255) cTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCtta > 1:3638391/1‑91 (MQ=255) ttattaTTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCttat < 2:1856728/91‑1 (MQ=255) ttattGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGACGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTaa > 1:1006662/1‑91 (MQ=255) ttattGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTaa > 1:3191923/1‑91 (MQ=255) tattGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAAt < 1:1705941/91‑1 (MQ=255) tGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGa < 1:3013726/91‑1 (MQ=255) gTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGaa < 1:1942320/91‑1 (MQ=255) ttaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGaaa > 2:1461788‑M2/18‑91 (MQ=255) ttaaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGaaa < 1:1644307‑M2/74‑1 (MQ=255) taaggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAAt < 1:2940365‑M2/75‑1 (MQ=255) atgaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATta < 2:3753935‑M2/77‑1 (MQ=255) ggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtat > 1:1321288‑M2/14‑91 (MQ=255) ggaggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtat < 2:461352‑M2/78‑1 (MQ=255) aggatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATtatat > 2:30645‑M2/12‑91 (MQ=255) gatatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATaa < 2:1885823‑M2/82‑1 (MQ=255) atatttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAAt < 1:781202‑M2/83‑1 (MQ=255) tttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaa < 2:914211‑M2/86‑1 (MQ=255) tttttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaa < 2:3148325‑M2/86‑1 (MQ=255) tttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaa < 2:294697‑M2/88‑1 (MQ=255) tttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaa < 1:2743187‑M2/88‑1 (MQ=255) tttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaa > 2:3589201‑M2/4‑91 (MQ=255) ttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaaa > 1:1837379‑M2/3‑91 (MQ=255) ttTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTaaaaa > 1:3796946‑M2/3‑91 (MQ=255) tTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAc > 2:2178561‑M2/2‑91 (MQ=255) tAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAcc > 1:874127/1‑91 (MQ=255) tAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAAcc > 2:3158734/1‑91 (MQ=255) | CTAGTTCTAAATTGAGAAATAAATAGATATAAAAATATCCTCCTTAATCAATAATTTAAATAACTTATTATTGTTAAGGAGGATATTTTTTAGTGTGTAAATTAAAAAGAATTTTAGAAGAATAACATTTATCAAAAAACTGTTCATTACCTTATTAATTGAAATTATATAATTAAAAACC > USA300TCH1516_ALE/88632‑88812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |