| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1858390 = | 128 (0.670) | 23 (0.150) | 13/126 | NT | 16.8% | intergenic (‑17/+57) | USA300HOU_RS09235/USA300HOU_RS09240 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1858437 = | 127 (0.850) | intergenic (‑64/+10) | USA300HOU_RS09235/USA300HOU_RS09240 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1858496‑1858390‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atttaagtgcatttgttTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGAC > USA300TCH1516_ALE/1858437‑1858526 ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTA < 1:389860/91‑1ATGTAGCAACTGATCCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTA > 2:3294488/1‑91 TGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAT > 2:2828421/1‑91 GTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCGAGAGTAGATAAATAATTAATAAGTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATT < 1:1794351/91‑1 TAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTT > 1:1221420/1‑91 TAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTT < 2:141166/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCGCTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 2:2266434/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 2:2266671/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 2:3667497/91‑1 AGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTA < 2:3667498/91‑1 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAA < 2:3696417/91‑1 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAA < 1:2186936/91‑1 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAA > 2:2679265/1‑91 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAA < 1:2742766/91‑1 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAGTTAA > 1:3239403/1‑91 GCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTAGTTAA > 1:3239388/1‑91 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAtg > 2:1121834/1‑89 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG > 2:2966591/1‑91 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG < 1:497173/91‑1 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG > 2:2966671/1‑91 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG < 1:766896/91‑1 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG > 1:934800/1‑91 CAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAG > 2:181444/1‑91 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT > 1:2668341/1‑91 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT > 1:2668400/1‑91 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT < 2:355915/91‑1 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT > 2:516579/1‑91 AACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGT > 2:2333438/1‑91 ACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTG > 1:1536733/1‑91 ACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTG > 1:1536430/1‑91 ACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTG > 1:1104636/1‑91 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 2:2568180/91‑1 CTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGC < 2:2494469/91‑1 TGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCA < 2:176934/91‑1 TGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCA < 2:176955/91‑1 TGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCA > 2:2194743/1‑91 GATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCAT < 1:1530559/91‑1 GATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCAT < 1:2318695/91‑1 ATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATT < 2:1852676/91‑1 ATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATT > 1:2105115/1‑91 TGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTT < 1:3136918/91‑1 TGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTT > 2:1685872/1‑91 GCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTG > 2:1430509/1‑91 GCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTG > 2:294126/1‑91 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT > 1:161226/1‑91 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT < 1:1438131/91‑1 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT > 1:2746616/1‑91 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT > 1:1759703/1‑91 CAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGT < 2:1962031/91‑1 AAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT > 1:3305360/1‑91 AGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATC > 1:1656413/1‑91 AATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATT > 2:3032152/1‑58 AATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATT < 1:3032152/58‑1 TTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATA > 1:3837795/1‑91 AAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATT > 2:2857530/1‑91 ATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATC > 1:267623/1‑91 TGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCA > 2:292658/1‑91 CACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGT > 1:2342216/1‑91 CACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGT > 1:2428265/1‑91 ACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTT > 2:514236/1‑91 TAAATGAAGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTCCT > 2:2733076/1‑91 AAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTA > 2:2110181/1‑91 AAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTA > 2:2110198/1‑91 AAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTA > 2:1048989/1‑91 TGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACAT > 1:1218163/1‑91 TGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACAT > 1:6477/1‑91 GTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATa > 2:3843056/1‑90 GTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATT > 2:3557400/1‑91 TGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAG > 2:3151918/1‑91 TGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAG > 2:3151549/1‑91 TGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAG > 1:2099854/1‑91 TGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAG > 1:1748598/1‑91 GTTACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTGGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGC > 1:2513644/1‑91 ACTTATTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTT > 2:1499428/1‑91 TTTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAAT > 1:1299068/1‑91 TTAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATT > 2:2691549/1‑91 TAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTT > 2:674996/1‑91 TAAGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTT > 2:674687/1‑91 AGTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGC > 2:1063399/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 1:1655489/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 2:3825731/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA < 2:2742766/91‑1 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 2:1398321/1‑91 GTGCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCA > 2:3505008/1‑91 GCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACT < 2:3044040/91‑1 GCATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTCGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACT < 1:3746439/91‑1 CATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTT > 2:540033/1‑91 CATTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTT > 2:3058467/1‑91 TTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCC < 2:2166631/91‑1 TTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCC > 2:2756326/1‑91 TTTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCC < 2:2047915/91‑1 TTGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCA > 1:2063594/1‑91 TTGTTTAATTATTAATCATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCA < 1:785556/91‑1 TGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCAC < 1:3580176/91‑1 TGTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCAC > 2:1314022/1‑91 GTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACG < 1:355915/91‑1 GTTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACG > 1:438532/1‑91 TTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGA > 2:3034644/1‑91 TTTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGACTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGA < 1:3873477/91‑1 TTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGAC > 2:607610/1‑91 ATGTAGCAACTGATGCAAATCATAGCTATACTTCTAGAGTAGATAAATAATTAATAATTAAACAAATGCACTTAAATGAGGTTGTTACTTATTTAAGTGCATTTGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1858496‑1858390‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atttaagtgcatttgttTAATTATTAATTATTTATCTACTCTAGAAGTATAGCTATGATTTGCATCAGTTGCTACATTATTAGCTTTGTAATTTGCACTTCCACGAC > USA300TCH1516_ALE/1858437‑1858526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |