| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 3077 | 3566 (0.300) | 189 (0.020) | 21/146 | NT | 8.7% | intergenic (‑403/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– |
| ? | NC_012417 | = 3108 | 716 (0.070) | intergenic (‑434/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 13559 total aligned reads displayed.
GATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/2986‑3125 | aTTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGT < 1:3797159‑M1/91‑1 (MQ=255) ttttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGtt < 2:469077/91‑1 (MQ=255) tttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTta < 1:1682503/91‑1 (MQ=255) ttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTtat < 1:3580410/91‑1 (MQ=255) ttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTtat < 2:3675776/91‑1 (MQ=255) ttATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTtat > 2:2864337/1‑91 (MQ=255) atatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTAtatta < 2:2307991/91‑1 (MQ=255) tatataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTAT < 1:3250078‑M1/91‑1 (MQ=255) atataGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATT > 1:2970313‑M1/1‑91 (MQ=255) aGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAgg > 1:1984680/1‑91 (MQ=255) gCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAGCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGgt < 1:3112035/91‑1 (MQ=255) gCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGgt < 1:1066957/91‑1 (MQ=255) gCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGgt > 1:3655199/1‑91 (MQ=255) gCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGgt < 1:1419313/91‑1 (MQ=255) tAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCg < 1:210555/91‑1 (MQ=255) aaCTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGGGGTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGa > 2:2732120/1‑91 (MQ=255) ACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGaa < 1:3382629‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGgtg > 1:3733434‑M1/1‑84 (MQ=255) TTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCtt < 1:1613974‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCtt < 2:1062188‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCtt < 2:2656999‑M1/91‑1 (MQ=255) tGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATctta > 2:1286775‑M2/1‑87 (MQ=255) gATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTTTTTGAATGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATcttaa < 2:2373852‑M2/91‑6 (MQ=255) gATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATcttaa < 1:270825‑M2/91‑6 (MQ=255) gATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATcttaa > 2:1661481‑M2/1‑86 (MQ=255) atatTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTaaa < 2:2018204/91‑1 (MQ=255) tatTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGattcgacaccttaata < 2:685586‑M1/91‑17 (MQ=255) tatTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAaat < 2:3440634/91‑1 (MQ=255) tatTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAaat > 1:3443869/1‑91 (MQ=255) atTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAaata < 2:3517499/91‑1 (MQ=255) aCAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATa < 1:990993‑M2/91‑2 (MQ=255) aCAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATa < 1:2310580‑M2/91‑2 (MQ=255) aCAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATa < 2:760878‑M2/91‑2 (MQ=255) cAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATac < 2:1861879‑M2/91‑3 (MQ=255) aGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATact < 2:193189‑M2/91‑4 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg > 2:1572908‑M2/1‑87 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg < 1:777617‑M2/91‑5 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg > 1:506635‑M2/1‑87 (MQ=255) gtgtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactg > 1:2243028‑M2/1‑87 (MQ=255) gtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAGACCCCCAGTattatttaagattcgacaccttaataatataactg < 2:922126‑M1/91‑36 (MQ=255) gtTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactggg < 2:402056‑M2/91‑7 (MQ=255) tttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgggg < 1:850‑M2/91‑8 (MQ=255) tttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgggg > 1:2768177‑M2/1‑84 (MQ=255) ttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTggggg < 1:578570/91‑1 (MQ=255) ttAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTggggg < 1:640220/91‑1 (MQ=255) aaaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAAGAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATAAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTc < 2:3825967/91‑1 (MQ=255) aaCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATactgggggcct < 1:179946‑M2/91‑12 (MQ=255) gtgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt > 2:2451440/1‑91 (MQ=255) gtgtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCtttt < 2:1217432/91‑1 (MQ=255) gtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTa > 1:1135467/1‑91 (MQ=255) gtTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTa > 2:2148619/1‑91 (MQ=255) tttttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAt < 1:708830/91‑1 (MQ=255) ttGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatg < 2:3227840‑M2/91‑4 (MQ=255) tgtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAGACCCCCAGTattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtc < 2:1145850‑M1/91‑51 (MQ=255) tgtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGCATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgc < 1:3184573‑M2/91‑5 (MQ=255) tgtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgc < 1:2643944‑M2/91‑5 (MQ=255) tgtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgc > 1:2370822‑M2/1‑87 (MQ=255) tgtgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgc > 1:3040173‑M2/1‑87 (MQ=255) atacttctagtagtattatattgcatataaaaaaCCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTtatat < 1:916813‑M2/57‑3 (MQ=255) tgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaa < 2:1793131‑M2/91‑7 (MQ=255) tgCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaa < 1:2434762‑M2/91‑7 (MQ=255) cGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaata > 2:2224710‑M2/1‑83 (MQ=255) gTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatat > 2:1356183‑M2/1‑82 (MQ=255) gAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataa > 1:1352313‑M2/1‑80 (MQ=255) gAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataa < 1:1202539‑M2/91‑12 (MQ=255) aaGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataata > 2:1725829‑M2/1‑78 (MQ=255) ggAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatact < 1:351507‑M2/91‑16 (MQ=255) aaaTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactact < 2:3314223‑M2/91‑19 (MQ=255) aaaTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactact < 2:53489‑M2/91‑19 (MQ=255) aaaTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactacc < 2:1424952‑M2/91‑19 (MQ=255) aaaTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACGTGGGGTCTTTTTATatgcaatataatacaact < 2:257920‑M2/91‑19 (MQ=255) aaTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactacta < 1:2574225‑M2/91‑20 (MQ=255) aaTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactacta > 1:439884‑M2/1‑72 (MQ=255) aTTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactag < 1:2051764‑M2/91‑21 (MQ=255) tttGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactaga < 2:3021193‑M2/91‑22 (MQ=255) gACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagt < 2:359650‑M2/91‑25 (MQ=255) cAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtat < 1:2507227‑M2/91‑27 (MQ=255) cAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtat < 2:3088482‑M2/91‑27 (MQ=255) aaTAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtata < 1:1000990‑M2/91‑28 (MQ=255) aaTAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtata > 2:842143‑M2/1‑64 (MQ=255) tAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataac > 2:3160928‑M2/1‑62 (MQ=255) aaaaa‑a‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataacc > 1:1489073‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaa‑a‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataacc > 2:2515654‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaa‑a‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccg > 2:608360‑M2/1‑60 (MQ=255) aaa‑a‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccga > 1:3860490‑M2/1‑59 (MQ=255) aa‑a‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaa > 1:2905319‑M2/1‑58 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaat < 2:294148‑M2/91‑37 (MQ=255) ccccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaat < 1:1927004‑M2/91‑37 (MQ=255) cccAGTattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaaaacacgtttaaac > 2:2795964‑M1/1‑6 (MQ=255) cccAGTattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaaaacacgtttaaac > 1:1858003‑M1/1‑6 (MQ=255) cccAGTattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaaaacacgtttaaac > 1:331735‑M1/1‑6 (MQ=255) ccAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatca < 1:1553394‑M2/91‑39 (MQ=255) aGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatatagtactactagaagtataaccgaaaatcaag > 2:3375774‑M2/1‑51 (MQ=255) gTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga > 1:1740213‑M2/1‑50 (MQ=255) gTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga > 1:2174500‑M2/1‑50 (MQ=255) gTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaaga < 2:2082108‑M2/91‑42 (MQ=255) ttATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagat < 2:149473‑M2/91‑43 (MQ=255) ttATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagat > 1:1278395‑M2/1‑49 (MQ=255) ttATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagat < 2:3746233‑M2/91‑43 (MQ=255) tattatttaagattcgacaccttaataatataactggggttttttattgtcaaattttcctttcacgcacaaaaacacgtttaaacactgt > 1:282412‑M1/1‑1 (MQ=255) | GATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAA‑A‑CCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/2986‑3125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |